Effective results for Enterobacter aerogenes KCTC 2190 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 664
- Predicted by EffectiveT3: 170 (high confidence), 303 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 30 within, 24 before, 40 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 76
- Predicted by EffectiveELD: 11 eukaryotic-like domains, contained in 52 proteins (1 high, 51 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III), (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
1028307.EAE_05780(PF00854)(ER)
1028307.EAE_23880(>)(mitochondrial)
1028307.EAE_11035(<)ER
1028307.EAE_14235+ER
1028307.EAE_12375+ER
1028307.EAE_12585+(mitochondrial)
1028307.EAE_10265(PF13332)(mitochondrial)
1028307.EAE_20830+ER
1028307.EAE_22690+(mitochondrial)
1028307.EAE_06150(+)+(mitochondrial); (plastid)
1028307.EAE_08660(>)ER
1028307.EAE_08795(>)(ER)
1028307.EAE_00095+ER
1028307.EAE_21945+ER
1028307.EAE_05335+ER
1028307.EAE_18245+ER
1028307.EAE_18710+ER
1028307.EAE_18715+ER
1028307.EAE_16170+ER; (ER)
1028307.EAE_10070(PF01228)mitochondrial
1028307.EAE_17155+ER
1028307.EAE_13255(PF00854)ER
1028307.EAE_06820+mitochondrial; (mitochondrial)
1028307.EAE_11405+ER
1028307.EAE_07990+ER
1028307.EAE_06225+(ER)
1028307.EAE_04535(>)ER
1028307.EAE_22670(>)ER
1028307.EAE_22070(PF01204)(ER)
1028307.EAE_05465(>)ER
1028307.EAE_01800(PF00577)ER
1028307.EAE_01805(PF00345)ER
1028307.EAE_20695+ER
1028307.EAE_06975+(mitochondrial)
1028307.EAE_05950+(ER)
1028307.EAE_15985(PF00328)ER
1028307.EAE_14100(PF00854)ER
1028307.EAE_18100+ER
1028307.EAE_17210(>)ER
1028307.EAE_02260(>)(ER)
1028307.EAE_16630+ER
1028307.EAE_14825(>)mitochondrial; (mitochondrial)
1028307.EAE_10105+ER
1028307.EAE_02600(PF00577)ER
1028307.EAE_20910+(mitochondrial)
1028307.EAE_13690+(mitochondrial)
1028307.EAE_06635+(ER)
1028307.EAE_09030(PF13332)ER; (ER)
1028307.EAE_17050+ER
1028307.EAE_16320(>)mitochondrial
1028307.EAE_22740(+)(PF00345)ER
1028307.EAE_22745(PF00577)ER
1028307.EAE_08600(PF00345)ER
1028307.EAE_15535+ER
1028307.EAE_01385+ER
1028307.EAE_00415+ER
1028307.EAE_04060(>)(mitochondrial)
1028307.EAE_06385+(mitochondrial)
1028307.EAE_09330+ER
1028307.EAE_08015+ER
1028307.EAE_02360(PF00577)ER
1028307.EAE_02365(PF00345)ER
1028307.EAE_02160(<)(ER)
1028307.EAE_10790(PF00577)ER
1028307.EAE_20055+mitochondrial
1028307.EAE_02420(PF00345)(mitochondrial)
1028307.EAE_10810(PF00345)(mitochondrial)
1028307.EAE_19335(>)ER
1028307.EAE_23160(>)ER
1028307.EAE_10785(PF00345)mitochondrial
1028307.EAE_12335(>)ER
1028307.EAE_05575+ER
1028307.EAE_05610+(mitochondrial)
1028307.EAE_13890+ER
1028307.EAE_12230(PF00345)ER
1028307.EAE_22555+ER
1028307.EAE_01485+ER
1028307.EAE_08585(>)(mitochondrial)
1028307.EAE_09855(>)(mitochondrial); (plastid)
1028307.EAE_19545+(ER)
1028307.EAE_11795+(mitochondrial); mitochondrial
1028307.EAE_09180(PF00345)ER
1028307.EAE_02745(PF00345)ER
1028307.EAE_03165+ER
1028307.EAE_24710(PF00345)ER
1028307.EAE_06085+(ER)
1028307.EAE_22000+(mitochondrial); mitochondrial
1028307.EAE_23260+mitochondrial; (mitochondrial)
1028307.EAE_19765(>)ER
1028307.EAE_03920(PF01204)ER
1028307.EAE_14720(PF01228)(mitochondrial)
1028307.EAE_24070+ER
1028307.EAE_03820+ER
1028307.EAE_13850+ER
1028307.EAE_14085(>)ER
1028307.EAE_21030+ER
1028307.EAE_17370(<)ER
1028307.EAE_02525(PF00328)ER
1028307.EAE_06030+(plastid)
1028307.EAE_06355(<)(ER)
1028307.EAE_08520(<)ER; not used
1028307.EAE_09230+(mitochondrial)
1028307.EAE_20835(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_03305(+)ER
1028307.EAE_22875++
1028307.EAE_07170(<)+
1028307.EAE_21305+(plastid)
1028307.EAE_22205+(ER)
1028307.EAE_06010(+)(ER)
1028307.EAE_06015+(plastid)
1028307.EAE_12810(+)mitochondrial
1028307.EAE_09325++
1028307.EAE_10045(+)ER
1028307.EAE_20255+(plastid)
1028307.EAE_22785+(plastid)
1028307.EAE_05665+(plastid)
1028307.EAE_07685(+)mitochondrial
1028307.EAE_09175(PF00577)(ER)
1028307.EAE_09005+(PF13332)
1028307.EAE_18945(+)ER
1028307.EAE_01970(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_06105(<)
1028307.EAE_16670(+)ER; (mitochondrial)
1028307.EAE_05065+(>)
1028307.EAE_24790++
1028307.EAE_02595(PF00345)(mitochondrial)
1028307.EAE_06590(+)+(ER)
1028307.EAE_15170+(ER)
1028307.EAE_09375(+)ER
1028307.EAE_09395++
1028307.EAE_18040+(<)
1028307.EAE_00355+(mitochondrial)
1028307.EAE_11985+(mitochondrial)
1028307.EAE_06530(>)(mitochondrial)
1028307.EAE_24580+(mitochondrial)
1028307.EAE_15830+plastid
1028307.EAE_24170(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_10875(<)(mitochondrial); not used
1028307.EAE_15355+(mitochondrial)
1028307.EAE_11305(<)(mitochondrial)
1028307.EAE_12890(+)mitochondrial; (mitochondrial)
1028307.EAE_15815++
1028307.EAE_17785+(mitochondrial)
1028307.EAE_02550+(ER)
1028307.EAE_03600(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_04840+(mitochondrial)
1028307.EAE_21550+(ER)
1028307.EAE_23820+(mitochondrial)
1028307.EAE_21165+(mitochondrial)
1028307.EAE_22230+PF10548
1028307.EAE_22950(+)+(plastid)
1028307.EAE_06055(+)ER
1028307.EAE_03635+(plastid)
1028307.EAE_20215(+)mitochondrial
1028307.EAE_21635(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_14535(+)mitochondrial; (mitochondrial)
1028307.EAE_24355+(plastid)
1028307.EAE_03130+(>)
1028307.EAE_12275+
1028307.EAE_02235+
1028307.EAE_06145+
1028307.EAE_22115(<)
1028307.EAE_06520+
1028307.EAE_05435+
1028307.EAE_12470+
1028307.EAE_23865(<)
1028307.EAE_15120(PF01228)
1028307.EAE_18345+
1028307.EAE_03490+
1028307.EAE_19430+
1028307.EAE_01330(<)
1028307.EAE_21900(PF11798)
1028307.EAE_13080+
1028307.EAE_16965+
1028307.EAE_09190(>)
1028307.EAE_07320+
1028307.EAE_16360(>)
1028307.EAE_22445+
1028307.EAE_09285+
1028307.EAE_11620+
1028307.EAE_06890+
1028307.EAE_03475(>)
1028307.EAE_15605+
1028307.EAE_15600+
1028307.EAE_23505(>)
1028307.EAE_22275(<)
1028307.EAE_00785(>)
1028307.EAE_23890+
1028307.EAE_03405+
1028307.EAE_04150+
1028307.EAE_09750+
1028307.EAE_05845(PF01204)
1028307.EAE_14170+
1028307.EAE_12320+
1028307.EAE_03840+
1028307.EAE_03050+
1028307.EAE_04165+
1028307.EAE_20820+
1028307.EAE_13495+
1028307.EAE_22265+
1028307.EAE_12720+
1028307.EAE_11130(+)(mitochondrial); not used
1028307.EAE_19380+
1028307.EAE_24575+
1028307.EAE_19655(<)
1028307.EAE_01885+
1028307.EAE_17705+
1028307.EAE_10280+not used
1028307.EAE_16835(<)
1028307.EAE_24220+
1028307.EAE_06790+
1028307.EAE_02480(PF00854)
1028307.EAE_13240+
1028307.EAE_07755(>)
1028307.EAE_16200(+)+
1028307.EAE_19730(<)
1028307.EAE_08425+
1028307.EAE_20740+
1028307.EAE_19645+
1028307.EAE_11275+
1028307.EAE_01345+
1028307.EAE_16440+
1028307.EAE_07980+
1028307.EAE_21265(+)plastid
1028307.EAE_21260+
1028307.EAE_22400+
1028307.EAE_22530+
1028307.EAE_22335+not used
1028307.EAE_23200+
1028307.EAE_23680+
1028307.EAE_03970+
1028307.EAE_10595+
1028307.EAE_11260+
1028307.EAE_09370+
1028307.EAE_21875+
1028307.EAE_01105+
1028307.EAE_00980(PF01228)
1028307.EAE_16675+
1028307.EAE_20275+
1028307.EAE_06770(<)
1028307.EAE_07425+
1028307.EAE_13730+
1028307.EAE_06605+
1028307.EAE_08755+
1028307.EAE_22435+
1028307.EAE_12510(>)
1028307.EAE_08570+
1028307.EAE_19405+
1028307.EAE_14355+
1028307.EAE_15885+
1028307.EAE_18620+
1028307.EAE_00190(+)(plastid)
1028307.EAE_00480+
1028307.EAE_04455+
1028307.EAE_17115+
1028307.EAE_16515(+)plastid
1028307.EAE_13030+
1028307.EAE_20460+
1028307.EAE_11930(PF11798)
1028307.EAE_21190+
1028307.EAE_12185+
1028307.EAE_11850+
1028307.EAE_12345(+)(plastid)
1028307.EAE_07725+
1028307.EAE_11020+
1028307.EAE_19270+
1028307.EAE_23355(+)(ER)
1028307.EAE_23175+
1028307.EAE_19695(+)+
1028307.EAE_19180+
1028307.EAE_02920+
1028307.EAE_07090+
1028307.EAE_04280(<)
1028307.EAE_13020+
1028307.EAE_16255+
1028307.EAE_10870(>)
1028307.EAE_06135+
1028307.EAE_11840+
1028307.EAE_22295+
1028307.EAE_08605(PF00577)
1028307.EAE_18800+
1028307.EAE_12155(>)
1028307.EAE_15740+
1028307.EAE_19190+
1028307.EAE_00010(>)
1028307.EAE_17910(PF00854)
1028307.EAE_18485+not used
1028307.EAE_10545+
1028307.EAE_05010+
1028307.EAE_16790+
1028307.EAE_20845+
1028307.EAE_03390+
1028307.EAE_04725+
1028307.EAE_23975+
1028307.EAE_11940(+)(ER); not used
1028307.EAE_00230+
1028307.EAE_09835+
1028307.EAE_00715+
1028307.EAE_23025+
1028307.EAE_11125+
1028307.EAE_14495(<)
1028307.EAE_14670+
1028307.EAE_20720(PF09994)
1028307.EAE_16780+
1028307.EAE_07330+
1028307.EAE_02425(PF00577)
1028307.EAE_12985+
1028307.EAE_21890+
1028307.EAE_21235+
1028307.EAE_04645+
1028307.EAE_00515+
1028307.EAE_11630+
1028307.EAE_02555(+)(ER)
1028307.EAE_07460(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_21385+
1028307.EAE_22145(PF11798)
1028307.EAE_03560(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_02170(+)+
1028307.EAE_23385+
1028307.EAE_07280+
1028307.EAE_00030+
1028307.EAE_00150+
1028307.EAE_19155+
1028307.EAE_15805+
1028307.EAE_10145+
1028307.EAE_20425+
1028307.EAE_21950(PF09994)
1028307.EAE_04305+
1028307.EAE_19940(<)
1028307.EAE_04745+not used
1028307.EAE_06675+
1028307.EAE_06910(>)
1028307.EAE_23955(<)
1028307.EAE_22155(>)
1028307.EAE_22395(<)
1028307.EAE_07695+
1028307.EAE_03355(+)(plastid)
1028307.EAE_09515(>)
1028307.EAE_09795+
1028307.EAE_10190(+)(plastid)
1028307.EAE_11575+
1028307.EAE_05345(+)(plastid)
1028307.EAE_13955(>)
1028307.EAE_21940(PF09994)
1028307.EAE_13540(+)(mitochondrial)
1028307.EAE_17345+
1028307.EAE_13155(+)+
1028307.EAE_16825+
1028307.EAE_18975(+)(plastid)
1028307.EAE_24715(PF00577)
1028307.EAE_01985+
1028307.EAE_14340+
1028307.EAE_01365(+)(ER)
1028307.EAE_15485+
1028307.EAE_23335(>)
1028307.EAE_12680+
1028307.EAE_15640+
1028307.EAE_08985+
1028307.EAE_08845+
1028307.EAE_03750+
1028307.EAE_14995+
1028307.EAE_11160(>)
1028307.EAE_15935(<)
1028307.EAE_10765+
1028307.EAE_02750(PF00577)
1028307.EAE_21375+
1028307.EAE_16350+
1028307.EAE_04175+
1028307.EAE_10855+
1028307.EAE_22480+
1028307.EAE_12695+
1028307.EAE_02325+
1028307.EAE_12105(PF00345)
1028307.EAE_12100(PF00577)
1028307.EAE_15585+
1028307.EAE_02035+
1028307.EAE_20395+
1028307.EAE_11825+
1028307.EAE_05980+
1028307.EAE_00045+
1028307.EAE_09865(>)
1028307.EAE_10755+
1028307.EAE_20765+
1028307.EAE_19610+
1028307.EAE_20760+
1028307.EAE_17745+
1028307.EAE_00210(+)(PF09994)
1028307.EAE_21590+
1028307.EAE_17185+
1028307.EAE_02665+
1028307.EAE_20980(PF11798)
1028307.EAE_01095(+)+
1028307.EAE_06040+
1028307.EAE_22035(PF01228)
1028307.EAE_00940(>)
1028307.EAE_12000+
1028307.EAE_03250+
1028307.EAE_12715+
1028307.EAE_00675(PF16485)
1028307.EAE_04055+
1028307.EAE_05880+
1028307.EAE_11990+
1028307.EAE_04330+
1028307.EAE_20495+not used
1028307.EAE_16025(+)
1028307.EAE_13610(+)
1028307.EAE_15615(+)
1028307.EAE_22440(+)
1028307.EAE_01020(+)
1028307.EAE_12475(+)
1028307.EAE_23885(+)
1028307.EAE_19295(+)
1028307.EAE_08255(+)
1028307.EAE_09415(+)
1028307.EAE_15545(+)
1028307.EAE_16015(+)
1028307.EAE_20745(+)
1028307.EAE_14410(+)
1028307.EAE_03785(+)
1028307.EAE_09195(+)
1028307.EAE_16960(+)
1028307.EAE_05235(+)
1028307.EAE_19915(+)
1028307.EAE_17140(+)
1028307.EAE_17810(+)
1028307.EAE_02220(+)
1028307.EAE_22695(+)
1028307.EAE_01925(+)
1028307.EAE_21015(+)
1028307.EAE_22470(+)
1028307.EAE_12575(+)
1028307.EAE_07175(+)
1028307.EAE_08880(+)
1028307.EAE_23255(+)
1028307.EAE_19625(+)
1028307.EAE_18240(+)
1028307.EAE_04130(+)
1028307.EAE_16605(+)
1028307.EAE_19800(+)
1028307.EAE_16185(+)
1028307.EAE_21665(+)
1028307.EAE_13925(+)
1028307.EAE_02070(+)
1028307.EAE_12030(+)
1028307.EAE_23640(+)
1028307.EAE_15145(+)
1028307.EAE_19385(+)
1028307.EAE_08345(+)
1028307.EAE_03670(+)
1028307.EAE_18525(+)
1028307.EAE_09690(+)
1028307.EAE_14765(+)
1028307.EAE_17125(+)
1028307.EAE_18840(+)
1028307.EAE_24040(+)
1028307.EAE_13395(+)
1028307.EAE_02485(+)
1028307.EAE_15620(+)
1028307.EAE_22520(+)
1028307.EAE_07195(+)
1028307.EAE_19395(+)
1028307.EAE_08350(+)
1028307.EAE_18720(+)not used
1028307.EAE_14590(+)
1028307.EAE_17715(+)
1028307.EAE_10450(+)
1028307.EAE_21865(+)
1028307.EAE_18285(+)
1028307.EAE_06415(+)
1028307.EAE_16665(+)
1028307.EAE_24785(+)
1028307.EAE_13235(+)
1028307.EAE_13720(+)
1028307.EAE_08630(+)
1028307.EAE_13835(+)
1028307.EAE_23750(+)
1028307.EAE_04190(+)
1028307.EAE_09900(+)
1028307.EAE_06170(+)
1028307.EAE_14295(+)
1028307.EAE_14105(+)
1028307.EAE_14565(+)
1028307.EAE_20655(+)
1028307.EAE_05115(+)
1028307.EAE_24025(+)
1028307.EAE_00985(+)
1028307.EAE_24155(+)
1028307.EAE_24795(+)
1028307.EAE_06370(+)
1028307.EAE_21600(+)
1028307.EAE_14500(+)
1028307.EAE_15775(+)
1028307.EAE_22505(+)
1028307.EAE_09570(+)
1028307.EAE_09800(+)
1028307.EAE_12820(+)
1028307.EAE_18445(+)
1028307.EAE_10610(+)
1028307.EAE_20550(+)
1028307.EAE_02915(+)
1028307.EAE_10035(+)
1028307.EAE_00195(+)
1028307.EAE_17200(+)
1028307.EAE_20465(+)
1028307.EAE_11980(+)
1028307.EAE_12180(+)
1028307.EAE_00425(+)
1028307.EAE_13740(+)
1028307.EAE_05805(+)
1028307.EAE_23595(+)
1028307.EAE_04450(+)
1028307.EAE_00600(+)
1028307.EAE_15340(+)
1028307.EAE_12760(+)
1028307.EAE_09960(+)
1028307.EAE_17445(+)
1028307.EAE_09365(+)
1028307.EAE_11665(+)
1028307.EAE_17425(+)
1028307.EAE_04070(+)
1028307.EAE_21275(+)
1028307.EAE_14305(+)
1028307.EAE_24000(+)
1028307.EAE_24750(+)
1028307.EAE_16655(+)not used
1028307.EAE_22630(+)
1028307.EAE_12885(+)
1028307.EAE_01760(+)
1028307.EAE_03400(+)
1028307.EAE_19460(+)
1028307.EAE_10495(+)
1028307.EAE_18480(+)
1028307.EAE_14795(+)
1028307.EAE_06465(+)
1028307.EAE_18150(+)
1028307.EAE_01155(+)
1028307.EAE_03975(+)
1028307.EAE_08490(+)
1028307.EAE_04320(+)
1028307.EAE_02710(+)
1028307.EAE_08885(+)
1028307.EAE_20285(+)
1028307.EAE_02345(+)
1028307.EAE_14050(+)
1028307.EAE_21085(+)
1028307.EAE_21715(+)
1028307.EAE_07410(+)
1028307.EAE_11945(+)
1028307.EAE_22370(+)
1028307.EAE_08705(+)
1028307.EAE_12410(+)
1028307.EAE_23375(+)
1028307.EAE_09945(+)
1028307.EAE_19525(+)
1028307.EAE_15255(+)
1028307.EAE_15810(+)
1028307.EAE_14405(+)
1028307.EAE_11310(+)
1028307.EAE_20545(+)
1028307.EAE_21410(+)
1028307.EAE_21145(+)
1028307.EAE_21520(+)
1028307.EAE_22965(+)
1028307.EAE_06645(+)
1028307.EAE_03460(+)
1028307.EAE_07605(+)
1028307.EAE_03360(+)
1028307.EAE_13815(+)
1028307.EAE_23030(+)
1028307.EAE_23035(+)
1028307.EAE_00205(+)
1028307.EAE_07690(+)
1028307.EAE_14265(+)
1028307.EAE_11555(+)
1028307.EAE_20045(+)
1028307.EAE_02885(+)
1028307.EAE_01045(+)
1028307.EAE_17080(+)
1028307.EAE_00930(+)
1028307.EAE_06255(+)
1028307.EAE_03045(+)
1028307.EAE_03170(+)
1028307.EAE_21170(+)
1028307.EAE_22150(+)
1028307.EAE_13120(+)
1028307.EAE_22390(+)
1028307.EAE_04925(+)
1028307.EAE_08725(+)
1028307.EAE_08855(+)
1028307.EAE_18545(+)
1028307.EAE_09290(+)
1028307.EAE_06885(+)
1028307.EAE_00400(+)
1028307.EAE_15520(+)
1028307.EAE_10195(+)
1028307.EAE_14690(+)
1028307.EAE_21045(+)
1028307.EAE_01055(+)
1028307.EAE_07820(+)
1028307.EAE_20410(+)
1028307.EAE_05755(+)
1028307.EAE_18580(+)
1028307.EAE_06710(+)
1028307.EAE_01180(+)
1028307.EAE_19955(+)
1028307.EAE_21540(+)
1028307.EAE_10350(+)
1028307.EAE_12200(+)
1028307.EAE_11060(+)
1028307.EAE_23835(+)
1028307.EAE_03345(+)
1028307.EAE_10620(+)
1028307.EAE_19850(+)
1028307.EAE_15000(+)
1028307.EAE_19005(+)
1028307.EAE_11165(+)
1028307.EAE_17120(+)
1028307.EAE_00130(+)
1028307.EAE_20625(+)
1028307.EAE_02190(+)
1028307.EAE_15645(+)
1028307.EAE_04235(+)
1028307.EAE_14425(+)
1028307.EAE_14420(+)
1028307.EAE_04520(+)
1028307.EAE_14015(+)
1028307.EAE_16795(+)
1028307.EAE_17755(+)
1028307.EAE_04035(+)
1028307.EAE_01430(+)
1028307.EAE_24275(+)
1028307.EAE_24420(+)
1028307.EAE_04760(+)
1028307.EAE_23995(+)
1028307.EAE_12920(+)
1028307.EAE_04830(+)
1028307.EAE_23845(+)
1028307.EAE_15675(+)
1028307.EAE_07120(+)
1028307.EAE_03455(+)
1028307.EAE_03245(+)
1028307.EAE_10240(+)
1028307.EAE_14185(+)
1028307.EAE_20070(+)
1028307.EAE_17740(+)
1028307.EAE_18185(+)
1028307.EAE_17365(+)
1028307.EAE_20280(+)
1028307.EAE_01420(+)
1028307.EAE_20985(+)
1028307.EAE_20210(+)
1028307.EAE_01890(+)
1028307.EAE_01895(+)
1028307.EAE_07480(+)
1028307.EAE_22450(+)
1028307.EAE_13440(+)
1028307.EAE_19860(+)
1028307.EAE_08040(+)
1028307.EAE_02445(+)
1028307.EAE_18425(+)
1028307.EAE_20385(+)
1028307.EAE_18615(+)
1028307.EAE_01360(+)
1028307.EAE_10405(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 0.3 (3/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 2.0 (16/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================