Metamenu

Effective results for Geobacter sp. M18 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 561
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 51 eukaryotic-like domains, contained in 561 proteins (1 high, 560 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type VI)

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
443143.GM18_2098(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF00989) (PF13426) (PF08448)ER
443143.GM18_3541(PF02518) (PF00512) (PF00072) (PF00989) (PF08448)ER
443143.GM18_2824(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF13426) (PF08448)ER
443143.GM18_2846(PF00072) (PF02518) (PF00512) (PF13426)ER
443143.GM18_1089(PF02518) (PF00072) (PF00989) (PF00512)ER
443143.GM18_0306(PF02518) (PF00512) (PF00989) (PF08448)ER
443143.GM18_0890(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)(mitochondrial)
443143.GM18_2002(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF00989) (PF08448)(ER)
443143.GM18_3683(PF00072) (PF02518) (PF00512) (PF13426)(ER)
443143.GM18_3840(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)ER
443143.GM18_4312(PF02518) (PF00072) (PF00989) (PF00512)(ER)
443143.GM18_3186(PF00072) (PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_1480(PF00512) (PF00989) (PF02518)ER
443143.GM18_0011(PF00072) (PF13492) (PF00512) (PF02518) (PF13426)
443143.GM18_2834(PF02518) (PF00072) (PF08448)mitochondrial; (mitochondrial)
443143.GM18_0008(PF02518) (PF00512) (PF00989)ER
443143.GM18_4468(PF00512) (PF00072) (PF02518)ER
443143.GM18_1524(PF02518) (PF00512) (PF00989)ER
443143.GM18_3283(PF02518) (PF00072) (PF00989) (PF13426) (PF00512)
443143.GM18_2355(PF02518) (PF00072) (PF00512)(mitochondrial); mitochondrial
443143.GM18_3753(PF00989) (PF13426) (PF08448)ER
443143.GM18_1886(PF02518) (PF00512) (PF13426)ER
443143.GM18_4016(PF00512) (PF08448) (PF02518) (PF13426) (PF00989)
443143.GM18_1894(PF02518) (PF00512) (PF13426)ER
443143.GM18_2206(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF13426) (PF00989)
443143.GM18_3307(PF00512) (PF02518) (PF08448)(ER)
443143.GM18_0098(PF13492) (PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_2494(PF00512) (PF00989) (PF02518)ER
443143.GM18_4310(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF00989) (PF08448)
443143.GM18_3854(PF02518) (PF13426) (PF08448)(ER)
443143.GM18_4087(PF00512) (PF02518) (PF13426)ER
443143.GM18_1340(PF00072) (PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_2275(PF02518) (PF00072) (PF08448)ER
443143.GM18_2269(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_1960(PF02518) (PF00512)mitochondrial
443143.GM18_2280(PF00072) (PF13426)(mitochondrial)
443143.GM18_1368(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_4459(PF02518) (PF00512)(mitochondrial)
443143.GM18_0608(PF02310) (PF04055)(ER)
443143.GM18_2858(PF02518) (PF00072) (PF00989) (PF08448)
443143.GM18_4079(PF00512) (PF02518)(ER)
443143.GM18_2833(PF02518) (PF00512)(ER)
443143.GM18_0381(PF13237) (PF02754)(ER)
443143.GM18_1830(PF02518) (PF00512)(mitochondrial)
443143.GM18_1762(PF02518) (PF00072) (PF13426) (PF00512)
443143.GM18_3700(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_0009(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF08448)
443143.GM18_0926(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_3381(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_2080(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_3565(PF02310) (PF04055)(mitochondrial)
443143.GM18_4009(PF02518) (PF00072) (PF00989) (PF00512)
443143.GM18_4003(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF08448)
443143.GM18_1289(PF13237) (PF02754)(ER)
443143.GM18_2181(PF02518) (PF00072) (PF13426) (PF00512)
443143.GM18_4248(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_0237(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_1294(PF02518) (PF00072) (PF13426) (PF00512)
443143.GM18_1293(PF02518) (PF00512) (PF13426)(ER)
443143.GM18_2409(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_2407(PF02518) (PF00512) (PF00989) (PF13426)
443143.GM18_1984(PF00512) (PF02518)mitochondrial
443143.GM18_1875(PF13237) (PF02754)ER
443143.GM18_1202(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_1260(PF00512) (PF02518) (PF13426) (PF08448)
443143.GM18_2695(PF02518) (PF00512) (PF00989) (PF13426)
443143.GM18_3926(PF02518) (PF08448)ER
443143.GM18_0454(PF00512) (PF00072) (PF02518) (PF08448)
443143.GM18_1245(PF00512) (PF00072) (PF00989) (PF02518)
443143.GM18_3262(PF00512) (PF00989) (PF13426) (PF02518)
443143.GM18_0068(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_0309(PF02518) (PF00072)ER
443143.GM18_0891(PF02518) (PF08448)ER
443143.GM18_2535(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_2222(PF13492) (PF00512) (PF02518) (PF08448)
443143.GM18_0781(PF02518) (PF00512)(ER); ER
443143.GM18_3278(PF00158) (PF00072) (PF02954)(ER)
443143.GM18_2642(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_0794(PF02310) (PF04055) (PF13428)(ER)
443143.GM18_3205(PF16199) (PF04055)ER
443143.GM18_3475(PF02310) (PF04055)(ER); (mitochondrial)
443143.GM18_4080(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
443143.GM18_2808(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_2270(PF00512) (PF00072) (PF00989) (PF02518)
443143.GM18_2583(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_3223(PF00512) (PF02518) (PF13426) (PF08448)
443143.GM18_0627(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_0621(PF02310) (PF04055)ER
443143.GM18_3985(PF00512) (PF02518)ER
443143.GM18_3988(PF02310) (PF04055)ER
443143.GM18_4052(PF02310) (PF04055)(mitochondrial)
443143.GM18_0319(PF02518) (PF00512)ER
443143.GM18_1961(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3189(PF01058)mitochondrial; (mitochondrial)
443143.GM18_3231(PF00512) (PF02518) (PF08448)
443143.GM18_3230(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1236(PF12849)ER
443143.GM18_2281(PF12849)ER
443143.GM18_1369(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1560(PF12849)ER
443143.GM18_4250(PF00343)(mitochondrial)
443143.GM18_0990(PF02518) (PF00512) (PF13426)
443143.GM18_1775(PF07085)mitochondrial; (mitochondrial)
443143.GM18_4405(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1553(PF02518)ER
443143.GM18_0367(PF00512) (PF00072) (PF02518)
443143.GM18_0365(PF00158) (PF13426) (PF02954)
443143.GM18_2831(PF02518) (PF00072) (PF08448)
443143.GM18_1831(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1760(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1765(PF04187)mitochondrial; (mitochondrial)
443143.GM18_1494(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_1153(PF13290)ER
443143.GM18_2847(PF02518) (PF00072) (PF08448)
443143.GM18_0377(PF00158) (PF02954) (PF08448)
443143.GM18_4474(PF00512) (PF00072) (PF02518)
443143.GM18_4276(PF00512) (PF00989) (PF02518)
443143.GM18_0397(PF02754)ER
443143.GM18_0307(PF00512) (PF00072) (PF02518)
443143.GM18_2381(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3157(PF12849)ER
443143.GM18_1842(PF00158) (PF02954) (PF08448)
443143.GM18_1624(PF04187)ER
443143.GM18_0716(PF13436)ER
443143.GM18_0710(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_3704(PF16199) (PF04055)(plastid)
443143.GM18_3707(PF12849)ER
443143.GM18_4019(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_1530(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_1448(PF04055)mitochondrial
443143.GM18_2899(PF00882)ER
443143.GM18_2081(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3369(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_0721(PF08982)(mitochondrial)
443143.GM18_0036(PF01814)ER
443143.GM18_4008(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_1526(PF12849)ER
443143.GM18_3826(PF02518) (PF00512) (PF13426)
443143.GM18_0803(PF02518) (PF00072) (PF00989)
443143.GM18_0805(PF04187)ER
443143.GM18_3280(PF02754)ER
443143.GM18_2182(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1517(PF12849)ER
443143.GM18_4249(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1985(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1874(PF00766) (PF12838) (PF01012)
443143.GM18_2353(PF13290)ER
443143.GM18_2354(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_1505(PF12849)ER
443143.GM18_1473(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_4232(PF00158) (PF02954)plastid
443143.GM18_0224(PF13426)ER
443143.GM18_3113(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1667(PF02518)ER
443143.GM18_1668(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_0598(PF02310) (PF04055)(ER)
443143.GM18_0597(PF05140)ER
443143.GM18_2698(PF08448)(mitochondrial)
443143.GM18_0217(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_2209(PF00989) (PF13426) (PF08448)
443143.GM18_0075(PF00512) (PF00072) (PF02518)
443143.GM18_3793(PF02754)(mitochondrial)
443143.GM18_1307(PF12849)ER
443143.GM18_1249(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_0687(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3264(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_0064(PF13237)ER
443143.GM18_1336(PF00766) (PF12838) (PF01012)
443143.GM18_1337(PF02754)ER
443143.GM18_1250(PF00512) (PF02518)plastid
443143.GM18_2652(PF02518) (PF00512)(ER)
443143.GM18_2536(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_2221(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3306(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_0782(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3279(PF02518) (PF00512)(mitochondrial)
443143.GM18_1783(PF02518)mitochondrial
443143.GM18_1853(PF12838)mitochondrial
443143.GM18_1850(PF01058)mitochondrial; (mitochondrial)
443143.GM18_2826(PF02518) (PF00072) (PF08448)
443143.GM18_4302(PF13290)ER
443143.GM18_1500(PF00882)ER
443143.GM18_3684(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_0880(PF02310) (PF04055)(mitochondrial)
443143.GM18_2255(PF01058)(ER)
443143.GM18_2493(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_0797(PF02518) (PF00512) (PF00989)
443143.GM18_4092(PF02518) (PF00072) (PF00512)
443143.GM18_2104(PF02518) (PF00512) (PF13426)
443143.GM18_3514(PF07085)mitochondrial; (mitochondrial)
443143.GM18_2815(PF00158) (PF02954) (PF08448)
443143.GM18_1357(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1529(PF09835)(mitochondrial)
443143.GM18_1014(PF02518)mitochondrial
443143.GM18_0320(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1572(PF13480)mitochondrial
443143.GM18_2674(PF02518) (PF00512) (PF08448)
443143.GM18_2673(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_3217(PF00766) (PF01012)(ER)
443143.GM18_2114(PF02518) (PF00989) (PF08448)
443143.GM18_3442(PF04055)(mitochondrial)
443143.GM18_2807(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_1067(PF00158) (PF00072) (PF02954)
443143.GM18_4433(PF05140)ER
443143.GM18_4509(PF07085)mitochondrial
443143.GM18_1756(PF00158) (PF08448) (PF02954)
443143.GM18_1590(PF13428)ER
443143.GM18_1215(PF00766) (PF13237) (PF01012)
443143.GM18_1216(PF02754)ER
443143.GM18_4426(PF00989)(ER); ER
443143.GM18_0963(PF14307)ER
443143.GM18_3521(PF00072) (PF00989)
443143.GM18_0767(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_4047(PF09835)(ER)
443143.GM18_0193(PF00437)(ER)
443143.GM18_3880(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_0607(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_1776(PF00072) (PF13426)
443143.GM18_0010(PF00512) (PF02518)
443143.GM18_3940(PF00158)plastid
443143.GM18_0383(PF00766) (PF01012)
443143.GM18_2159(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_3540(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_0396(PF00766) (PF01012)
443143.GM18_4384(PF10588) (PF13237)
443143.GM18_1027(PF02518) (PF00989)
443143.GM18_2095(PF00437)plastid
443143.GM18_3229(PF04055)(mitochondrial)
443143.GM18_4011(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_2178(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_3602(PF00072)(mitochondrial)
443143.GM18_0801(PF00437)(mitochondrial)
443143.GM18_2413(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_1193(PF00766) (PF01012)
443143.GM18_2562(PF13426) (PF08448)
443143.GM18_2180(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_3909(PF00512) (PF02518)
443143.GM18_3902(PF00072) (PF00989)
443143.GM18_2742(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_2745(PF13480)(ER)
443143.GM18_3832(PF00512) (PF00072)
443143.GM18_1291(PF00766) (PF01012)
443143.GM18_1066(PF00512) (PF02518)
443143.GM18_3112(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_1884(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_0599(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_1779(PF04055)(ER)
443143.GM18_2208(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_0695(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_1676(PF13426) (PF08448)
443143.GM18_1679(PF00158) (PF02954)
443143.GM18_0077(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_0202(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_4212(PF09835)(mitochondrial)
443143.GM18_0680(PF02540)(mitochondrial)
443143.GM18_1790(PF01739) (PF00072)
443143.GM18_4202(PF16199) (PF04055)
443143.GM18_0301(PF00437) (PF00072)
443143.GM18_0302(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_0305(PF00072) (PF08448)
443143.GM18_0875(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_3019(PF00158) (PF02954)
443143.GM18_2313(PF02518) (PF08448)
443143.GM18_1787(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_3682(PF00158) (PF00072)
443143.GM18_3846(PF04055)(plastid)
443143.GM18_1912(PF03144)(mitochondrial)
443143.GM18_2107(PF00512) (PF02518)
443143.GM18_0643(PF05140)(ER)
443143.GM18_2816(PF00512) (PF02518)
443143.GM18_1358(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_3695(PF10588) (PF13237)
443143.GM18_2113(PF00072) (PF13426)
443143.GM18_2115(PF02518) (PF00072)
443143.GM18_4502(PF02518) (PF13426)
443143.GM18_4053(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_0626(PF02518) (PF00512)
443143.GM18_0623(PF02310) (PF04055)
443143.GM18_1211(PF04055)(mitochondrial)
443143.GM18_2268(PF00072)
443143.GM18_1969(PF08982)
443143.GM18_1967(PF01814)
443143.GM18_0439(PF02540)
443143.GM18_1814(PF03144)
443143.GM18_3185(PF02873)
443143.GM18_3239(PF12838)
443143.GM18_3238(PF02754)
443143.GM18_0501(PF00078)
443143.GM18_2282(PF12899)
443143.GM18_0615(PF05140)
443143.GM18_3522(PF00072)
443143.GM18_1365(PF00072)
443143.GM18_4043(PF04055)
443143.GM18_3730(PF00072)
443143.GM18_3731(PF02518)
443143.GM18_3735(PF04055)
443143.GM18_0351(PF00158)
443143.GM18_3885(PF02873)
443143.GM18_1175(PF04055)
443143.GM18_4299(PF01814)
443143.GM18_1958(PF04055)
443143.GM18_3086(PF00072)
443143.GM18_1771(PF04055)
443143.GM18_2149(PF13428)
443143.GM18_2145(PF13426)
443143.GM18_3556(PF13426)
443143.GM18_1487(PF04055)
443143.GM18_1481(PF00072)
443143.GM18_4407(PF02518)
443143.GM18_0774(PF00072)
443143.GM18_3727(PF01739)
443143.GM18_4078(PF00072)
443143.GM18_3947(PF12838)
443143.GM18_0382(PF01012)
443143.GM18_2443(PF00158)
443143.GM18_1948(PF00072)
443143.GM18_3097(PF00072)
443143.GM18_1761(PF00072)
443143.GM18_2158(PF04055)
443143.GM18_2155(PF04055)
443143.GM18_3404(PF02915)
443143.GM18_1495(PF00072)
443143.GM18_1492(PF00072)
443143.GM18_0707(PF04055)
443143.GM18_2848(PF13426)
443143.GM18_0014(PF04055)
443143.GM18_1543(PF04055)
443143.GM18_0172(PF12838)
443143.GM18_4470(PF00072)
443143.GM18_1157(PF02954)
443143.GM18_4275(PF00072)
443143.GM18_0395(PF01012)
443143.GM18_1028(PF00072)
443143.GM18_2435(PF00437)
443143.GM18_2436(PF00072)
443143.GM18_1846(PF04055)
443143.GM18_1847(PF04055)
443143.GM18_2542(PF00072)
443143.GM18_0579(PF04055)
443143.GM18_1717(PF01814)
443143.GM18_2360(PF04055)
443143.GM18_4389(PF01058)
443143.GM18_4018(PF00072)
443143.GM18_0004(PF02518)
443143.GM18_4014(PF01739)
443143.GM18_4469(PF00072)
443143.GM18_3962(PF00078)
443143.GM18_1036(PF02915)
443143.GM18_0924(PF04055)
443143.GM18_4399(PF03144)
443143.GM18_0815(PF04055)
443143.GM18_0817(PF03144)
443143.GM18_1859(PF10588)
443143.GM18_1858(PF12838)
443143.GM18_3382(PF00072)
443143.GM18_2559(PF02310)
443143.GM18_1702(PF03144)
443143.GM18_2175(PF01739)
443143.GM18_0494(PF04055)
443143.GM18_2179(PF00072)
443143.GM18_1633(PF13480)
443143.GM18_1631(PF13480)
443143.GM18_4007(PF00072)
443143.GM18_4005(PF00072)
443143.GM18_0152(PF10588)
443143.GM18_0155(PF01058)
443143.GM18_3600(PF00072)
443143.GM18_3601(PF13492)
443143.GM18_3603(PF01739)
443143.GM18_3605(PF00072)
443143.GM18_3607(PF00072)
443143.GM18_3912(PF00989)
443143.GM18_2881(PF00078)
443143.GM18_2882(PF00078)
443143.GM18_1049(PF00078)
443143.GM18_1282(PF02310)
443143.GM18_2412(PF00072)
443143.GM18_1192(PF01012)
443143.GM18_1190(PF00072)
443143.GM18_3172(PF00078)
443143.GM18_1990(PF00343)
443143.GM18_2568(PF01814)
443143.GM18_3284(PF03144)
443143.GM18_4298(PF13480)
443143.GM18_1867(PF12838)
443143.GM18_0027(PF02754)
443143.GM18_0026(PF12838)
443143.GM18_0124(PF00072)
443143.GM18_0126(PF00437)
443143.GM18_0123(PF01814)
443143.GM18_0128(PF00072)
443143.GM18_3612(PF00072)
443143.GM18_3611(PF00072)
443143.GM18_3610(PF02518)
443143.GM18_3904(PF03144)
443143.GM18_1053(PF00078)
443143.GM18_3837(PF00078)
443143.GM18_0830(PF03144)
443143.GM18_1290(PF01012)
443143.GM18_2408(PF00072)
443143.GM18_2406(PF00072)
443143.GM18_0905(PF13480)
443143.GM18_1981(PF00072)
443143.GM18_1983(PF01814)
443143.GM18_1871(PF04055)
443143.GM18_1873(PF01012)
443143.GM18_3589(PF04055)
443143.GM18_3585(PF02540)
443143.GM18_1723(PF04055)
443143.GM18_2357(PF01739)
443143.GM18_3759(PF00437)
443143.GM18_4020(PF00072)
443143.GM18_0136(PF04055)
443143.GM18_1474(PF04055)
443143.GM18_1476(PF01715)
443143.GM18_0223(PF00072)
443143.GM18_0227(PF00437)
443143.GM18_1062PF16575
443143.GM18_2758(PF10588)
443143.GM18_3809(PF04055)
443143.GM18_1786(PF00072)
443143.GM18_0917(PF02540)
443143.GM18_3114(PF00989)
443143.GM18_3110(PF01058)
443143.GM18_1088(PF12838)
443143.GM18_1889(PF02915)
443143.GM18_1883(PF00078)
443143.GM18_1885(PF00072)
443143.GM18_2211(PF01739)
443143.GM18_2981(PF02732)
443143.GM18_3245(PF04055)
443143.GM18_3741(PF07085)
443143.GM18_0109(PF00437)
443143.GM18_3638(PF00072)
443143.GM18_4010(PF00072)
443143.GM18_3925(PF00072)
443143.GM18_0218(PF00072)
443143.GM18_1317(PF04055)
443143.GM18_4355(PF01814)
443143.GM18_1090(PF00072)
443143.GM18_2207(PF00072)
443143.GM18_2205(PF00072)
443143.GM18_0696(PF00072)
443143.GM18_1675(PF02915)
443143.GM18_1671(PF02540)
443143.GM18_2029(PF00078)
443143.GM18_2028(PF00078)
443143.GM18_0072(PF00072)
443143.GM18_0071(PF00072)
443143.GM18_0076(PF00072)
443143.GM18_3640(PF00072)
443143.GM18_3642(PF00078)
443143.GM18_1419(PF01739)
443143.GM18_1418(PF02518)
443143.GM18_1417(PF00072)
443143.GM18_0207(PF00072)
443143.GM18_2687(PF05189)
443143.GM18_1303(PF00072)
443143.GM18_3861(PF00078)
443143.GM18_3005(PF01814)
443143.GM18_2231(PF12838)
443143.GM18_0446(PF00437)
443143.GM18_2304(PF00343)
443143.GM18_1643(PF13480)
443143.GM18_2012(PF00078)
443143.GM18_3261(PF13426)
443143.GM18_0065(PF12838)
443143.GM18_0660(PF13480)
443143.GM18_1421(PF00072)
443143.GM18_0272(PF00072)
443143.GM18_2832(PF00072)
443143.GM18_1335(PF01012)
443143.GM18_0879(PF08392)
443143.GM18_0300(PF00072)
443143.GM18_0304(PF00072)
443143.GM18_0892(PF00072)
443143.GM18_0894(PF01739)
443143.GM18_0897(PF02518)
443143.GM18_2651(PF00072)
443143.GM18_2653(PF13492)
443143.GM18_2314(PF04055)
443143.GM18_2316(PF12038)
443143.GM18_0788(PF00078)
443143.GM18_3272(PF12838)
443143.GM18_0099(PF00072)
443143.GM18_2393(PF00078)
443143.GM18_3060(PF12838)
443143.GM18_1785(PF00072)
443143.GM18_0264(PF04055)
443143.GM18_0263(PF04055)
443143.GM18_2821(PF00072)
443143.GM18_2820(PF00078)
443143.GM18_1220(PF00078)
443143.GM18_2792(PF02754)
443143.GM18_2798(PF02754)
443143.GM18_3680(PF00072)
443143.GM18_3686(PF00072)
443143.GM18_0314(PF02310)
443143.GM18_0889(PF00072)
443143.GM18_1138(PF00437)
443143.GM18_2646(PF00072)
443143.GM18_4410(PF00072)
443143.GM18_2648(PF04055)
443143.GM18_1917(PF02915)
443143.GM18_1915(PF00025)
443143.GM18_3068(PF00072)
443143.GM18_2496(PF00437)
443143.GM18_2497(PF00437)
443143.GM18_0461(PF00072)
443143.GM18_0460(PF01058)
443143.GM18_0080(PF01739)
443143.GM18_2105(PF00078)
443143.GM18_3517(PF01715)
443143.GM18_3671(PF00072)
443143.GM18_3474(PF04055)
443143.GM18_1231(PF01058)
443143.GM18_4408(PF01739)
443143.GM18_2671(PF00072)
443143.GM18_4402(PF02915)
443143.GM18_2678(PF00072)
443143.GM18_3714(PF00072)
443143.GM18_3071(PF04055)
443143.GM18_0413(PF00158)
443143.GM18_3219(PF04055)
443143.GM18_3214(PF01012)
443143.GM18_4089(PF00437)
443143.GM18_2117(PF02518)
443143.GM18_2116(PF00072)
443143.GM18_0632(PF00072)
443143.GM18_3448(PF02518)
443143.GM18_3994(PF13281)
443143.GM18_3997(PF02026)
443143.GM18_3991(PF13271)
443143.GM18_3992(PF13271)
443143.GM18_0240(PF00072)
443143.GM18_1344(PF02915)
443143.GM18_1341(PF00072)
443143.GM18_0336(PF00437)
443143.GM18_1201(PF00072)
443143.GM18_1109(PF01814)
443143.GM18_1110(PF01814)
443143.GM18_4507(PF04055)
443143.GM18_2273(PF02518)
443143.GM18_2276(PF00072)
443143.GM18_1975(PF00072)
443143.GM18_0408(PF00078)
443143.GM18_2582(PF00072)
443143.GM18_0530(PF02915)
443143.GM18_0829(PF03144)
443143.GM18_0628(PF00072)
443143.GM18_0625(PF00072)
443143.GM18_0031(PF03144)
443143.GM18_4006(PF00072)
443143.GM18_1525(PF00072)
443143.GM18_4004(PF00989)
443143.GM18_3986(PF00072)
443143.GM18_3980(PF00343)
443143.GM18_1214(PF01012)
443143.GM18_4429(PF00025)
443143.GM18_0962(PF14307)
443143.GM18_0965(PF14307)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 0.5 (4/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================