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Effective results for Clostridium sp. BNL1100 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 256
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 46 eukaryotic-like domains, contained in 256 proteins (23 high, 233 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
755731.Clo1100_2769(PF02018) (PF00331) (PF06452) (PF00395)ER
755731.Clo1100_2768(PF02018) (PF00331) (PF06452) (PF00395)ER
755731.Clo1100_1822(PF02018) PF00759ER
755731.Clo1100_0919(PF03422) (PF03664)ER
755731.Clo1100_0914(PF03422) (PF03664)ER
755731.Clo1100_0910(PF03422) (PF00331)ER
755731.Clo1100_1782(PF13353) (PF04055)ER; (ER)
755731.Clo1100_3317(PF03422) PF00457ER
755731.Clo1100_3316(PF03422) PF00457ER
755731.Clo1100_0359(PF13353) (PF04055)(mitochondrial)
755731.Clo1100_0630(PF06165) (PF17167)ER
755731.Clo1100_2504(PF13353) (PF04055)(mitochondrial); mitochondrial
755731.Clo1100_0580(PF02018) PF00759ER
755731.Clo1100_3350(PF00331) (PF00395)ER
755731.Clo1100_1080(PF03442) (PF00395)ER
755731.Clo1100_3348(PF06452)ER
755731.Clo1100_3127(PF14526)mitochondrial
755731.Clo1100_2838(PF00395)ER
755731.Clo1100_0872(PF00395)ER
755731.Clo1100_0273(PF08757)ER
755731.Clo1100_1097(PF00395)ER
755731.Clo1100_1825PF00759mitochondrial; (mitochondrial)
755731.Clo1100_1824PF00759ER
755731.Clo1100_0304(PF00395)ER
755731.Clo1100_2756(PF06541)ER
755731.Clo1100_0253PF00759ER
755731.Clo1100_3334(PF00395)ER
755731.Clo1100_2225(PF01789)(ER)
755731.Clo1100_0918(PF03422)ER
755731.Clo1100_0916(PF02018)ER
755731.Clo1100_0917(PF03422)ER
755731.Clo1100_0915(PF03422)ER
755731.Clo1100_0912(PF03422)ER
755731.Clo1100_0913(PF03422)ER
755731.Clo1100_0911(PF03422)ER
755731.Clo1100_0045(PF00395)ER; (ER)
755731.Clo1100_0049(PF00543)ER
755731.Clo1100_1316(PF02156)ER
755731.Clo1100_0315(PF00395)mitochondrial; (mitochondrial)
755731.Clo1100_0407(PF03442)ER
755731.Clo1100_3456(PF00395)ER
755731.Clo1100_4082(PF06452)ER
755731.Clo1100_3996(PF00395)ER
755731.Clo1100_3995(PF00395)ER
755731.Clo1100_3993(PF00395)ER
755731.Clo1100_2867PF00457ER
755731.Clo1100_1353(PF00395)ER
755731.Clo1100_2671PF00759ER
755731.Clo1100_2297(PF03422)ER
755731.Clo1100_0984(PF08757)ER
755731.Clo1100_0298(PF00395)ER
755731.Clo1100_0297(PF00395)(ER)
755731.Clo1100_1905(PF02156)ER
755731.Clo1100_3887(PF03959)ER
755731.Clo1100_1395(PF00395)ER
755731.Clo1100_1818(PF03442)ER
755731.Clo1100_2604(PF00543)(mitochondrial)
755731.Clo1100_3555(PF06541)ER
755731.Clo1100_0774(PF00395)ER
755731.Clo1100_1827PF00759ER
755731.Clo1100_1821PF00759ER
755731.Clo1100_1958PF00759ER
755731.Clo1100_1957(PF08757)ER
755731.Clo1100_2143(PF09394)ER; (ER)
755731.Clo1100_3542(PF00395)ER
755731.Clo1100_3168(PF00395)ER
755731.Clo1100_1720(PF00395)ER
755731.Clo1100_3114(PF04055)mitochondrial
755731.Clo1100_3287(PF00395)ER
755731.Clo1100_3282(PF00331)ER
755731.Clo1100_3751(PF02156)ER
755731.Clo1100_0485(PF04055)(ER)
755731.Clo1100_1990PF00759ER
755731.Clo1100_1847PF00457ER
755731.Clo1100_1849(PF02156)ER
755731.Clo1100_2366(PF00395)ER
755731.Clo1100_3560(PF00239)(mitochondrial)
755731.Clo1100_0721(PF00395)ER
755731.Clo1100_0922(PF03422)ER
755731.Clo1100_0921(PF03422)ER
755731.Clo1100_0920(PF03422)ER
755731.Clo1100_1850PF00759ER
755731.Clo1100_1852PF00759ER
755731.Clo1100_1073(PF00395)ER
755731.Clo1100_2200PF00457ER
755731.Clo1100_2992(PF08757)ER
755731.Clo1100_3137(PF03422)ER
755731.Clo1100_0933PF00759ER
755731.Clo1100_0208(PF06541)ER
755731.Clo1100_2348(PF14249)(mitochondrial)
755731.Clo1100_2685(PF04055)(mitochondrial)
755731.Clo1100_3478(PF00239)(mitochondrial)
755731.Clo1100_2780(PF13745)(mitochondrial)
755731.Clo1100_3321(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_2799(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_3044(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_2801(PF06165) (PF17167)
755731.Clo1100_3878PF03727 PF00349
755731.Clo1100_3052(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_1213(PF06165) (PF17167)
755731.Clo1100_3519(PF00145)(ER)
755731.Clo1100_0985(PF09359)(mitochondrial)
755731.Clo1100_0742(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_0627(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_2934(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_1486(PF04055)(mitochondrial)
755731.Clo1100_2549PF06268(mitochondrial)
755731.Clo1100_1566(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_0158(PF00331)(mitochondrial)
755731.Clo1100_2639(PF04055)(mitochondrial)
755731.Clo1100_2144(PF09394)(mitochondrial)
755731.Clo1100_4061PF10250(ER)
755731.Clo1100_3113(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_3112(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_3110(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_4012(PF06165) (PF17167)
755731.Clo1100_1061(PF00395)(ER)
755731.Clo1100_3562(PF00239)(mitochondrial)
755731.Clo1100_0104(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_2514(PF06165) (PF17167)
755731.Clo1100_3354(PF13353) (PF04055)
755731.Clo1100_0118(PF04055)(mitochondrial)
755731.Clo1100_2527(PF00239)
755731.Clo1100_0474(PF00239)
755731.Clo1100_1874(PF04055)
755731.Clo1100_3658(PF03063)
755731.Clo1100_3655(PF04055)
755731.Clo1100_0271(PF09359)
755731.Clo1100_3345(PF04055)
755731.Clo1100_2680(PF01257)
755731.Clo1100_3222(PF04055)
755731.Clo1100_2753(PF01257)
755731.Clo1100_2751(PF02256)
755731.Clo1100_0789(PF00239)
755731.Clo1100_0522(PF00145)
755731.Clo1100_1300(PF13745)
755731.Clo1100_1301(PF13745)
755731.Clo1100_3480(PF00239)
755731.Clo1100_1312(PF14526)
755731.Clo1100_1794(PF04055)
755731.Clo1100_0314(PF00395)
755731.Clo1100_2782(PF13745)
755731.Clo1100_3253(PF12831)
755731.Clo1100_3254(PF12831)
755731.Clo1100_3255(PF12831)
755731.Clo1100_1418(PF00239)
755731.Clo1100_0892(PF13745)
755731.Clo1100_0890(PF13745)
755731.Clo1100_0896(PF13745)
755731.Clo1100_0895(PF13745)
755731.Clo1100_3475(PF00239)
755731.Clo1100_1304(PF13745)
755731.Clo1100_1305(PF13745)
755731.Clo1100_1784(PF03630)
755731.Clo1100_2798(PF04055)
755731.Clo1100_2335(PF04055)
755731.Clo1100_3318(PF04055)
755731.Clo1100_3261(PF12831)
755731.Clo1100_3262(PF12831)
755731.Clo1100_2800(PF04055)
755731.Clo1100_3687(PF03063)
755731.Clo1100_0889(PF13745)
755731.Clo1100_0792(PF12437)
755731.Clo1100_1757(PF04055)
755731.Clo1100_2012(PF04055)
755731.Clo1100_3271(PF04055)
755731.Clo1100_3038(PF14526)
755731.Clo1100_3053(PF04055)
755731.Clo1100_3691(PF12831)
755731.Clo1100_1436(PF00239)
755731.Clo1100_1923(PF13745)
755731.Clo1100_1432(PF00239)
755731.Clo1100_1430(PF03063)
755731.Clo1100_1741(PF09419)
755731.Clo1100_3843(PF04055)
755731.Clo1100_3514(PF12224)
755731.Clo1100_3423(PF13155)
755731.Clo1100_0519(PF00239)
755731.Clo1100_1596(PF12437)
755731.Clo1100_1352(PF00239)
755731.Clo1100_1000(PF04055)
755731.Clo1100_2678(PF01257)
755731.Clo1100_2677(PF01257)
755731.Clo1100_2676(PF02256)
755731.Clo1100_3215(PF04055)
755731.Clo1100_3216(PF04055)
755731.Clo1100_3218(PF04055)
755731.Clo1100_2292(PF04055)
755731.Clo1100_2290(PF02938)
755731.Clo1100_3503(PF13155)
755731.Clo1100_0982(PF02938)
755731.Clo1100_0749(PF01257)
755731.Clo1100_0189(PF14526)
755731.Clo1100_0188(PF14526)
755731.Clo1100_3438(PF00145)
755731.Clo1100_3434(PF12224)
755731.Clo1100_1767(PF04055)
755731.Clo1100_1421(PF00239)
755731.Clo1100_2598(PF01257)
755731.Clo1100_2599(PF04055)
755731.Clo1100_3221(PF04055)
755731.Clo1100_3226(PF04055)
755731.Clo1100_0992(PF00707)
755731.Clo1100_3154(PF09359)
755731.Clo1100_3409(PF00239)
755731.Clo1100_0751(PF02256)
755731.Clo1100_0198(PF13353)
755731.Clo1100_1572(PF13155)
755731.Clo1100_3717(PF00239)
755731.Clo1100_4059PF10250
755731.Clo1100_2548(PF00239)
755731.Clo1100_0230(PF00145)
755731.Clo1100_0962(PF02475)
755731.Clo1100_3414(PF00239)
755731.Clo1100_3412(PF00239)
755731.Clo1100_3090(PF12831)
755731.Clo1100_3091(PF12831)
755731.Clo1100_1364(PF13155)
755731.Clo1100_1143(PF00145)
755731.Clo1100_2603(PF00543)
755731.Clo1100_3396(PF00145)
755731.Clo1100_3398(PF00145)
755731.Clo1100_0776(PF00543)
755731.Clo1100_0804(PF00543)
755731.Clo1100_1739(PF06777)
755731.Clo1100_2633(PF13745)
755731.Clo1100_2632(PF13745)
755731.Clo1100_2704(PF00162)
755731.Clo1100_2561(PF00239)
755731.Clo1100_2418(PF00239)
755731.Clo1100_3163(PF00707)
755731.Clo1100_0237(PF00162)
755731.Clo1100_2574(PF16760)
755731.Clo1100_3115(PF04055)
755731.Clo1100_3111(PF04055)
755731.Clo1100_0486(PF13745)
755731.Clo1100_0488(PF13745)
755731.Clo1100_3592(PF12224)
755731.Clo1100_3595(PF00145)
755731.Clo1100_1289(PF13884)
755731.Clo1100_1285(PF13884)
755731.Clo1100_1287(PF13884)
755731.Clo1100_1846(PF03063)
755731.Clo1100_1195(PF03063)
755731.Clo1100_1666(PF04055)
755731.Clo1100_3108(PF04055)
755731.Clo1100_3102(PF04055)
755731.Clo1100_3103(PF04055)
755731.Clo1100_3036(PF12831)
755731.Clo1100_0582(PF04055)
755731.Clo1100_1851PF00759
755731.Clo1100_1185(PF00239)
755731.Clo1100_3825(PF04055)
755731.Clo1100_0594(PF04055)
755731.Clo1100_1089(PF00543)
755731.Clo1100_2749(PF01257)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================