Effective results for Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 963
- Predicted by EffectiveT3: 255 (high confidence), 357 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 21 within, 18 before, 75 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 208
- Predicted by EffectiveELD: 25 eukaryotic-like domains, contained in 193 proteins (149 high, 44 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV), Type VI
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
---|---|---|---|---|---|
223283.PSPTO_1407 | + | PF01609 PF05598 | ER | ||
223283.PSPTO_1418 | PF01609 PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_0968 | PF01609 PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_1439 | PF01609 PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_2204 | PF01609 PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_3208 | (>) | PF01609 PF05598 | (mitochondrial) | ||
223283.PSPTO_4792 | PF01609 PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_1592 | + | + | ER; plastid | ||
223283.PSPTO_4067 | (+) | + | mitochondrial | ||
223283.PSPTO_1315 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1310 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4347 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_3923 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4343 | + | + | (PF12255) | ||
223283.PSPTO_0780 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2927 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4529 | (>) | (ER); (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4253 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2010 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2541 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_0381 | + | ER | |||
223283.PSPTO_2426 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4997 | (PF06293) | (ER) | |||
223283.PSPTO_3210 | + | (mitochondrial); plastid | |||
223283.PSPTO_3963 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4774 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_1477 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_4569 | (<) | (ER) | |||
223283.PSPTO_3230 | + | ER | |||
223283.PSPTO_3233 | (>) | ER | |||
223283.PSPTO_5440 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1493 | + | ER | |||
223283.PSPTO_5556 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_3532 | + | ER | |||
223283.PSPTO_0844 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_0393 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4485 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_4152 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_0474 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
223283.PSPTO_1704 | (PF02146) | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_3113 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_5269 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_5261 | + | (ER); ER | |||
223283.PSPTO_2665 | (>) | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_1778 | (>) | ER | |||
223283.PSPTO_5428 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2463 | + | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_0358 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_0355 | + | ER | |||
223283.PSPTO_0171 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_0681 | + | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_1229 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1207 | + | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_2836 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2162 | + | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_1929 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_3194 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_5564 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2764 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3422 | (>) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4457 | (>) | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_4856 | + | ER | |||
223283.PSPTO_5524 | + | ER | |||
223283.PSPTO_5031 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_4721 | + | + | PF05932 | ||
223283.PSPTO_0733 | + | ER | |||
223283.PSPTO_2707 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4596 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1343 | + | ER | |||
223283.PSPTO_5318 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4845 | (PF07678) | ER | |||
223283.PSPTO_2180 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
223283.PSPTO_1188 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4060 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_0583 | + | + | plastid | ||
223283.PSPTO_2514 | + | ER | |||
223283.PSPTO_0912 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_5131 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_1166 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_0980 | + | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_2024 | (<) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2234 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1854 | (PF11162) | ER | |||
223283.PSPTO_2556 | + | ER; (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2008 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4185 | (>) | (ER); ER | |||
223283.PSPTO_3972 | + | ER | |||
223283.PSPTO_3971 | + | ER | |||
223283.PSPTO_5584 | + | ER | |||
223283.PSPTO_5582 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4303 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4305 | + | ER | |||
223283.PSPTO_3560 | PF01150 | ER | |||
223283.PSPTO_4514 | + | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_5179 | (>) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0613 | (<) | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_1879 | (>) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4395 | (<) | ER | |||
223283.PSPTO_0673 | + | ER | |||
223283.PSPTO_1813 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_3240 | (>) | ER | |||
223283.PSPTO_3249 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
223283.PSPTO_1714 | (>) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2432 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2323 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0816 | + | ER | |||
223283.PSPTO_1509 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2887 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1763 | + | ER | |||
223283.PSPTO_3734 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_3731 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4702 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2691 | (>) | ER | |||
223283.PSPTO_5315 | (>) | ER | |||
223283.PSPTO_4841 | + | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_1567 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_3807 | + | ER | |||
223283.PSPTO_3808 | PF05598 | ER | |||
223283.PSPTO_4784 | + | (ER); ER | |||
223283.PSPTO_1805 | + | ER | |||
223283.PSPTO_2328 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2324 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4643 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_2841 | (PF00665) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
223283.PSPTO_2843 | (PF11162) | ER | |||
223283.PSPTO_1616 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3304 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_2792 | + | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_5216 | + | ER | |||
223283.PSPTO_0534 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_1910 | + | (mitochondrial); mitochondrial | |||
223283.PSPTO_4971 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4691 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
223283.PSPTO_2284 | + | ER | |||
223283.PSPTO_2281 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_3415 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4931 | (>) | (ER); (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0263 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_5517 | + | ER | |||
223283.PSPTO_3961 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2071 | + | ER | |||
223283.PSPTO_4913 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_1992 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
223283.PSPTO_2054 | (<) | ER | |||
223283.PSPTO_2053 | + | (ER); (plastid) | |||
223283.PSPTO_3903 | + | ER | |||
223283.PSPTO_0903 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_0902 | (>) | PF01609 PF05598 | |||
223283.PSPTO_4278 | (+) | ER | |||
223283.PSPTO_0228 | + | (PF06945) | |||
223283.PSPTO_2387 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_2437 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3389 | + | (PF00182) | |||
223283.PSPTO_0208 | (+) | ER | |||
223283.PSPTO_4251 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3250 | (+) | (mitochondrial); plastid | |||
223283.PSPTO_4756 | + | ER; not used | |||
223283.PSPTO_5591 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_1451 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0883 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_1383 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_1682 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_5368 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4194 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_3213 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_2971 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4567 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4389 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_5385 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_4718 | + | + | |||
223283.PSPTO_5443 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_5445 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0055 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_1909 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3394 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_0849 | (+) | (mitochondrial); (ER) | |||
223283.PSPTO_5638 | (+) | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_5635 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_1398 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_4737 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4730 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_1342 | + | + | |||
223283.PSPTO_0865 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3925 | + | + | |||
223283.PSPTO_2800 | (+) | (ER); (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3132 | + | + | |||
223283.PSPTO_2872 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_1966 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_5543 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_2460 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3482 | (<) | (ER) | |||
223283.PSPTO_3336 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_3151 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_1227 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_2850 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_4468 | (<) | + | |||
223283.PSPTO_2740 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3433 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3996 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3999 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4967 | PF14564 (PF08964) | ||||
223283.PSPTO_4429 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
223283.PSPTO_0503 | + | PF05932 | |||
223283.PSPTO_0058 | + | (PF00665) | |||
223283.PSPTO_5488 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_3420 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0194 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_0196 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_2125 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0292 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3651 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_1659 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_1654 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2006 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0712 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_3098 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_0019 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_5198 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_4906 | + | + | |||
223283.PSPTO_1020 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4589 | PF05932 | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4588 | + | + | |||
223283.PSPTO_4594 | + | PF01129 | |||
223283.PSPTO_3613 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0035 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0039 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_1340 | (+) | mitochondrial | |||
223283.PSPTO_1619 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_1004 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4440 | (<) | (mitochondrial); not used | |||
223283.PSPTO_4117 | (+) | ER | |||
223283.PSPTO_2981 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_3059 | + | ||||
223283.PSPTO_3973 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_1189 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0589 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_1799 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4269 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_2535 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0977 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_1443 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3013 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_4188 | + | + | |||
223283.PSPTO_4764 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4769 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3692 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_3224 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3223 | PF01609 PF05598 | ||||
223283.PSPTO_3216 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3502 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_4994 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0670 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4722 | + | (PF14566) | |||
223283.PSPTO_4724 | + | + | |||
223283.PSPTO_3528 | PF01609 PF05598 | ||||
223283.PSPTO_1377 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_2655 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0878 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_0003 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_1831 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_1027 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2678 | + | (<) | |||
223283.PSPTO_3102 | (>) | + | |||
223283.PSPTO_4101 | + | (>) | |||
223283.PSPTO_5411 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3220 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0833 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_4592 | + | PF01129 | |||
223283.PSPTO_2321 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_0502 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_1098 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_1095 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_0149 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4556 | PF07217 | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2840 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_1934 | + | plastid | |||
223283.PSPTO_1930 | + | (ER) | |||
223283.PSPTO_4625 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3169 | (+) | ER | |||
223283.PSPTO_5575 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_5215 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_5212 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_0535 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3044 | (PF00665) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_2115 | (>) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4013 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_4018 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4693 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_4696 | PF01609 (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_4956 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3882 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_5304 | + | PF03050 | |||
223283.PSPTO_3608 | (PF00665) PF02796 | ||||
223283.PSPTO_3715 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_3298 | (+) | ER | |||
223283.PSPTO_0446 | (+) | ER; (ER) | |||
223283.PSPTO_4725 | PF01609 PF05598 | ||||
223283.PSPTO_1998 | + | + | |||
223283.PSPTO_0024 | + | (mitochondrial); not used | |||
223283.PSPTO_4078 | + | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0028 | (PF00665) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0905 | + | (plastid) | |||
223283.PSPTO_0767 | (>) | ||||
223283.PSPTO_2262 | + | ||||
223283.PSPTO_2196 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_2992 | + | ||||
223283.PSPTO_3027 | + | ||||
223283.PSPTO_4270 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_5066 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_1172 | (<) | ||||
223283.PSPTO_1174 | (+) | (<) | |||
223283.PSPTO_4093 | + | ||||
223283.PSPTO_5321 | + | ||||
223283.PSPTO_4896 | + | ||||
223283.PSPTO_4898 | + | ||||
223283.PSPTO_3929 | + | ||||
223283.PSPTO_1781 | + | ||||
223283.PSPTO_2388 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_3550 | + | ||||
223283.PSPTO_1387 | + | ||||
223283.PSPTO_1260 | + | ||||
223283.PSPTO_1336 | (<) | ||||
223283.PSPTO_0946 | + | ||||
223283.PSPTO_0944 | + | ||||
223283.PSPTO_4807 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_4751 | + | ||||
223283.PSPTO_1455 | + | ||||
223283.PSPTO_1453 | + | ||||
223283.PSPTO_2046 | + | ||||
223283.PSPTO_0124 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_3578 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3686 | + | ||||
223283.PSPTO_1382 | + | ||||
223283.PSPTO_0083 | + | ||||
223283.PSPTO_0089 | + | ||||
223283.PSPTO_0620 | + | ||||
223283.PSPTO_1861 | + | ||||
223283.PSPTO_1681 | + | ||||
223283.PSPTO_0223 | + | ||||
223283.PSPTO_4272 | + | ||||
223283.PSPTO_4190 | + | ||||
223283.PSPTO_3217 | + | not used | |||
223283.PSPTO_2812 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_4779 | + | ||||
223283.PSPTO_4998 | (PF06293) | ||||
223283.PSPTO_4999 | (PF06293) | ||||
223283.PSPTO_0592 | (<) | ||||
223283.PSPTO_5161 | + | ||||
223283.PSPTO_1116 | + | ||||
223283.PSPTO_5168 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4876 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3237 | + | ||||
223283.PSPTO_4712 | + | ||||
223283.PSPTO_0457 | + | ||||
223283.PSPTO_0450 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_5447 | + | ||||
223283.PSPTO_5000 | (PF06293) | ||||
223283.PSPTO_5483 | + | ||||
223283.PSPTO_3396 | + | ||||
223283.PSPTO_2622 | (PF02146) | ||||
223283.PSPTO_2767 | + | ||||
223283.PSPTO_1535 | + | ||||
223283.PSPTO_0044 | + | ||||
223283.PSPTO_3705 | + | ||||
223283.PSPTO_3703 | + | ||||
223283.PSPTO_4157 | + | ||||
223283.PSPTO_3876 | (>) | ||||
223283.PSPTO_5286 | + | ||||
223283.PSPTO_5284 | + | ||||
223283.PSPTO_5466 | + | ||||
223283.PSPTO_5471 | (+) | plastid | |||
223283.PSPTO_5475 | + | ||||
223283.PSPTO_0864 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_0130 | + | ||||
223283.PSPTO_1510 | (>) | ||||
223283.PSPTO_2093 | (PF00182) | ||||
223283.PSPTO_2092 | + | ||||
223283.PSPTO_2898 | + | ||||
223283.PSPTO_3278 | + | ||||
223283.PSPTO_2806 | + | ||||
223283.PSPTO_4139 | + | ||||
223283.PSPTO_5406 | + | ||||
223283.PSPTO_0808 | + | ||||
223283.PSPTO_5356 | + | ||||
223283.PSPTO_2660 | + | ||||
223283.PSPTO_4677 | + | ||||
223283.PSPTO_3130 | + | ||||
223283.PSPTO_1570 | + | not used | |||
223283.PSPTO_2873 | (>) | ||||
223283.PSPTO_0310 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_5246 | + | ||||
223283.PSPTO_1960 | + | ||||
223283.PSPTO_0516 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_0041 | + | ||||
223283.PSPTO_5013 | + | ||||
223283.PSPTO_2468 | (PF06945) | ||||
223283.PSPTO_0828 | + | ||||
223283.PSPTO_0827 | (>) | ||||
223283.PSPTO_2686 | + | ||||
223283.PSPTO_3332 | + | ||||
223283.PSPTO_4652 | + | ||||
223283.PSPTO_3159 | + | ||||
223283.PSPTO_1089 | + | ||||
223283.PSPTO_1088 | + | ||||
223283.PSPTO_4461 | + | ||||
223283.PSPTO_5226 | + | ||||
223283.PSPTO_0545 | + | ||||
223283.PSPTO_1949 | (+) | plastid | |||
223283.PSPTO_1943 | + | ||||
223283.PSPTO_3006 | + | ||||
223283.PSPTO_3556 | + | ||||
223283.PSPTO_2445 | + | ||||
223283.PSPTO_4636 | + | ||||
223283.PSPTO_3172 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_1205 | + | ||||
223283.PSPTO_1209 | + | ||||
223283.PSPTO_1208 | + | ||||
223283.PSPTO_3955 | + | ||||
223283.PSPTO_3954 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_3781 | + | ||||
223283.PSPTO_2741 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_1157 | (>) | ||||
223283.PSPTO_5200 | + | ||||
223283.PSPTO_1927 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3432 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_3198 | + | ||||
223283.PSPTO_3190 | + | ||||
223283.PSPTO_3197 | + | ||||
223283.PSPTO_4340 | + | ||||
223283.PSPTO_1043 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_4964 | + | ||||
223283.PSPTO_2760 | + | ||||
223283.PSPTO_0056 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_5481 | + | ||||
223283.PSPTO_5533 | + | ||||
223283.PSPTO_1671 | + | ||||
223283.PSPTO_2598 | + | ||||
223283.PSPTO_5018 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_1065 | + | ||||
223283.PSPTO_0193 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_4455 | (>) | ||||
223283.PSPTO_1241 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_4675 | (PF02146) | ||||
223283.PSPTO_4852 | + | ||||
223283.PSPTO_0291 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_0298 | PF02796 | ||||
223283.PSPTO_4001 | + | ||||
223283.PSPTO_4008 | + | ||||
223283.PSPTO_1658 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_3542 | + | ||||
223283.PSPTO_2004 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3409 | + | ||||
223283.PSPTO_3405 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_3402 | + | ||||
223283.PSPTO_4921 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3945 | + | ||||
223283.PSPTO_3679 | + | ||||
223283.PSPTO_0018 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_5197 | + | ||||
223283.PSPTO_5545 | + | ||||
223283.PSPTO_0482 | + | ||||
223283.PSPTO_5052 | + | ||||
223283.PSPTO_1022 | + | ||||
223283.PSPTO_5370 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_4599 | PF05932 | ||||
223283.PSPTO_4597 | + | ||||
223283.PSPTO_4044 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_4037 | (PF00182) | ||||
223283.PSPTO_4038 | + | ||||
223283.PSPTO_1349 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_3442 | + | ||||
223283.PSPTO_3445 | + | ||||
223283.PSPTO_2069 | + | ||||
223283.PSPTO_4871 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_1001 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_4699 | + | ||||
223283.PSPTO_0930 | + | ||||
223283.PSPTO_2277 | (PF06189) | ||||
223283.PSPTO_4665 | + | ||||
223283.PSPTO_0347 | + | ||||
223283.PSPTO_3587 | + | ||||
223283.PSPTO_3581 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_2487 | + | ||||
223283.PSPTO_1988 | + | ||||
223283.PSPTO_1981 | + | ||||
223283.PSPTO_4068 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_0584 | (PF02146) | ||||
223283.PSPTO_1369 | PF05932 | ||||
223283.PSPTO_5331 | (PF13402) | ||||
223283.PSPTO_1363 | + | ||||
223283.PSPTO_2048 | + | ||||
223283.PSPTO_0911 | + | ||||
223283.PSPTO_3936 | + | ||||
223283.PSPTO_3933 | (PF00182) | ||||
223283.PSPTO_0779 | + | ||||
223283.PSPTO_1423 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3975 | (+) | (>) | |||
223283.PSPTO_4081 | + | ||||
223283.PSPTO_5353 | PF05932 | ||||
223283.PSPTO_4882 | (PF11162) | ||||
223283.PSPTO_5014 | + | ||||
223283.PSPTO_2029 | + | ||||
223283.PSPTO_2538 | + | ||||
223283.PSPTO_2539 | + | ||||
223283.PSPTO_4741 | + | ||||
223283.PSPTO_1863 | + | ||||
223283.PSPTO_1448 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_2239 | + | ||||
223283.PSPTO_2491 | + | ||||
223283.PSPTO_3019 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3014 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_3544 | + | ||||
223283.PSPTO_0890 | + | ||||
223283.PSPTO_5112 | + | ||||
223283.PSPTO_5110 | + | ||||
223283.PSPTO_0092 | + | ||||
223283.PSPTO_0950 | + | ||||
223283.PSPTO_4186 | (+) | + | |||
223283.PSPTO_4189 | + | ||||
223283.PSPTO_3756 | + | ||||
223283.PSPTO_3751 | (PF06945) | ||||
223283.PSPTO_4767 | + | ||||
223283.PSPTO_0402 | + | ||||
223283.PSPTO_4768 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_3489 | + | ||||
223283.PSPTO_1466 | (PF06945) | ||||
223283.PSPTO_1469 | + | ||||
223283.PSPTO_3561 | + | ||||
223283.PSPTO_2966 | + | ||||
223283.PSPTO_4511 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_4519 | + | ||||
223283.PSPTO_4865 | + | ||||
223283.PSPTO_5178 | + | ||||
223283.PSPTO_1878 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_4863 | + | ||||
223283.PSPTO_2574 | + | ||||
223283.PSPTO_4703 | + | ||||
223283.PSPTO_5432 | + | ||||
223283.PSPTO_3743 | + | ||||
223283.PSPTO_1551 | + | ||||
223283.PSPTO_3501 | (+) | (>) | |||
223283.PSPTO_4996 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_4574 | (PF13402) | ||||
223283.PSPTO_4570 | + | ||||
223283.PSPTO_5629 | PF01609 | ||||
223283.PSPTO_5620 | (+) | (mitochondrial); not used | |||
223283.PSPTO_1819 | + | ||||
223283.PSPTO_1814 | (PF06945) | ||||
223283.PSPTO_4727 | + | ||||
223283.PSPTO_4729 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_1713 | (+) | (plastid) | |||
223283.PSPTO_3524 | (>) | ||||
223283.PSPTO_1376 | (+) | PF05932 | |||
223283.PSPTO_2450 | + | ||||
223283.PSPTO_0877 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0876 | + | ||||
223283.PSPTO_1385 | + | ||||
223283.PSPTO_1526 | + | ||||
223283.PSPTO_5057 | + | ||||
223283.PSPTO_5509 | (PF00665) | ||||
223283.PSPTO_3841 | + | ||||
223283.PSPTO_1356 | + | ||||
223283.PSPTO_2675 | (<) | ||||
223283.PSPTO_3942 | + | ||||
223283.PSPTO_0102 | + | ||||
223283.PSPTO_4100 | + | ||||
223283.PSPTO_1765 | + | ||||
223283.PSPTO_1944 | + | ||||
223283.PSPTO_1945 | + | ||||
223283.PSPTO_3225 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_0832 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_0834 | (>) | ||||
223283.PSPTO_2694 | + | ||||
223283.PSPTO_3129 | + | ||||
223283.PSPTO_5645 | + | ||||
223283.PSPTO_1568 | + | ||||
223283.PSPTO_5254 | + | ||||
223283.PSPTO_1955 | + | ||||
223283.PSPTO_1952 | + | ||||
223283.PSPTO_1772 | + | ||||
223283.PSPTO_2322 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_2325 | + | ||||
223283.PSPTO_3498 | + | ||||
223283.PSPTO_3499 | + | ||||
223283.PSPTO_4642 | + | ||||
223283.PSPTO_4315 | + | ||||
223283.PSPTO_1890 | + | ||||
223283.PSPTO_1096 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_1093 | + | ||||
223283.PSPTO_0148 | + | ||||
223283.PSPTO_1233 | + | ||||
223283.PSPTO_1546 | (>) | ||||
223283.PSPTO_1238 | + | ||||
223283.PSPTO_1036 | + | ||||
223283.PSPTO_3799 | + | ||||
223283.PSPTO_3790 | (<) | ||||
223283.PSPTO_2842 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_2845 | (PF11162) | ||||
223283.PSPTO_4418 | (+) | plastid | |||
223283.PSPTO_1617 | + | ||||
223283.PSPTO_0553 | (<) | ||||
223283.PSPTO_1939 | + | ||||
223283.PSPTO_1935 | + | ||||
223283.PSPTO_1932 | + | not used | |||
223283.PSPTO_4631 | + | ||||
223283.PSPTO_2305 | + | ||||
223283.PSPTO_2301 | + | ||||
223283.PSPTO_4626 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_4623 | (PF06884) | ||||
223283.PSPTO_5576 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_1213 | + | ||||
223283.PSPTO_2828 | + | ||||
223283.PSPTO_2171 | + | ||||
223283.PSPTO_4436 | + | ||||
223283.PSPTO_4296 | + | ||||
223283.PSPTO_5218 | + | ||||
223283.PSPTO_1917 | (+) | (ER) | |||
223283.PSPTO_1669 | + | ||||
223283.PSPTO_2365 | (<) | ||||
223283.PSPTO_2361 | + | ||||
223283.PSPTO_3183 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0320 | + | ||||
223283.PSPTO_4976 | + | ||||
223283.PSPTO_4975 | + | ||||
223283.PSPTO_3043 | (PF06189) | ||||
223283.PSPTO_3644 | + | ||||
223283.PSPTO_0043 | + | ||||
223283.PSPTO_0049 | + | ||||
223283.PSPTO_1645 | (>) | ||||
223283.PSPTO_1648 | + | ||||
223283.PSPTO_2349 | + | ||||
223283.PSPTO_3345 | (>) | ||||
223283.PSPTO_4371 | (PF06293) | ||||
223283.PSPTO_5537 | + | ||||
223283.PSPTO_0701 | + | ||||
223283.PSPTO_5393 | + | ||||
223283.PSPTO_2287 | + | ||||
223283.PSPTO_2136 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_3086 | + | ||||
223283.PSPTO_3665 | + | ||||
223283.PSPTO_3662 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3886 | (+) | plastid | |||
223283.PSPTO_1374 | (+) | PF05932 | |||
223283.PSPTO_1373 | + | ||||
223283.PSPTO_0061 | + | ||||
223283.PSPTO_4331 | + | ||||
223283.PSPTO_4333 | + | ||||
223283.PSPTO_5514 | + | ||||
223283.PSPTO_4935 | + | ||||
223283.PSPTO_2739 | + | ||||
223283.PSPTO_3065 | + | ||||
223283.PSPTO_3607 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_5183 | + | ||||
223283.PSPTO_0840 | (>) | ||||
223283.PSPTO_3960 | + | ||||
223283.PSPTO_4014 | PF01695 | ||||
223283.PSPTO_2077 | (+) | (PF12949) | |||
223283.PSPTO_2078 | + | ||||
223283.PSPTO_3292 | + | ||||
223283.PSPTO_3299 | (+) | (mitochondrial) | |||
223283.PSPTO_0922 | + | ||||
223283.PSPTO_0746 | (PF05277) | ||||
223283.PSPTO_0740 | + | ||||
223283.PSPTO_5147 | + | ||||
223283.PSPTO_5141 | + | ||||
223283.PSPTO_5312 | + | ||||
223283.PSPTO_1199 | + | not used | |||
223283.PSPTO_5303 | + | ||||
223283.PSPTO_1372 | + | ||||
223283.PSPTO_1370 | + | ||||
223283.PSPTO_5308 | + | ||||
223283.PSPTO_0907 | + | ||||
223283.PSPTO_0901 | + | ||||
223283.PSPTO_0766 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2267 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2192 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4275 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4094 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1876 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2203 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4528 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1153 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1330 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2544 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2014 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2549 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4800 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0383 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3769 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3948 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0410 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1454 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2041 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2043 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0651 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3688 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5364 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2562 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3200 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4191 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3969 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2976 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2978 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5324 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4563 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5389 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4174 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3726 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0454 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5448 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2933 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0501 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1327 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1322 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1908 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3397 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4549 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5632 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1534 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3879 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4732 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0866 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2649 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2642 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2640 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5619 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1511 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2091 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3852 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3855 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5263 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5267 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5354 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1302 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0111 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1579 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1575 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2870 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4448 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2469 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3486 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_3485 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4651 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0174 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1559 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2140 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2144 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4465 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5224 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2339 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0371 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0155 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0152 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4520 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3787 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2835 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_2838 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2296 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2166 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4405 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5209 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5203 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5201 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1925 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1923 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5560 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0050 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0509 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0508 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1670 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2590 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2597 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0999 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5011 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5015 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4940 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2743 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2126 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3650 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4004 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4523 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5520 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4602 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0713 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4246 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2727 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_0271 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0272 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4024 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5199 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_3469 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3283 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3285 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5055 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1281 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2253 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3610 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0038 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4039 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1612 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1348 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3441 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1821 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3911 | + | ||||
223283.PSPTO_3915 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0758 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1405 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1404 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1406 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1408 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2279 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2181 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2985 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3056 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3637 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0239 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0588 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0580 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2000 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1362 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0916 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3937 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0771 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1795 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4985 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0212 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4888 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4747 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0792 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_1866 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0274 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2231 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2237 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2942 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_2945 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3548 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3018 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4539 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0095 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0098 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1328 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0499 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4182 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5588 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5581 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5583 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1465 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4656 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4879 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3568 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_3697 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_4513 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5172 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1870 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1871 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4168 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4709 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5430 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5433 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0421 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0429 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3507 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2632 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2630 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0675 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4143 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3711 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1694 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3525 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2650 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_0873 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5605 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1835 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1839 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3263 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0465 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0467 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_1738 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1731 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2677 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2674 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3105 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5081 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4107 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4105 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3826 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5270 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1979 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2706 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3120 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0699 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0698 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1566 | (+) | not used | |||
223283.PSPTO_2863 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4475 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5257 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1807 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0572 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0570 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1777 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2332 | + | ||||
223283.PSPTO_3497 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4316 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1892 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1090 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4644 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3794 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0554 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4326 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4322 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1914 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1668 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2240 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2710 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2369 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2368 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2585 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3369 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3188 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0323 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1058 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1581 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3046 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2778 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2802 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0047 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0934 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3437 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5534 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1073 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1075 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1076 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4073 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5390 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4071 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2282 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2759 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2131 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0287 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3661 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4330 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0301 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5049 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0726 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3067 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3066 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0268 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4058 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1606 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2076 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3293 | (+) | ||||
223283.PSPTO_5458 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3045 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4215 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4245 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0242 | (+) | ||||
223283.PSPTO_1191 | (+) | ||||
223283.PSPTO_0236 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2508 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2505 | (+) | ||||
223283.PSPTO_3902 | (+) | ||||
223283.PSPTO_4686 | (+) | ||||
223283.PSPTO_2825 | (+) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveT3 predictions using new standard model 2.0.1 (PROTEINS.NEW.EFFECTIVET3)
- EffectiveT3 predictions using old standard model 1.0.1 (PROTEINS.OLD.EFFECTIVET3)
- EffectiveCCBD predictions (PROTEINS.CHAPERONES.TXT)
- T4SEpre bpbAac predictions (T4SEpre_bpbAac_FinalResult.csv)
- T4SEpre psAac predictions (T4SEpre_psAac_FinalResult.csv)
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
Estimated copy number = 1.3 (13/10 KEGG proteins)
- Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
Estimated copy number = 0.1 (1/10 KEGG proteins)
- Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
Estimated copy number = 2.25 (18/8 KEGG proteins)
Individual results for each secretion system
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
- List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
Estimated copy number = 1.3 (13/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 0.1 (1/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 2.25 (18/8 KEGG proteins)