Metamenu

Effective results for Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 906
- Predicted by EffectiveT3: 254 (high confidence), 336 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 34 within, 26 before, 58 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 41 eukaryotic-like domains, contained in 228 proteins (83 high, 145 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
243265.plu3065(>)(PF08479)ER
243265.plu2198(PF02844) (PF02843)(mitochondrial)
243265.plu3569(>)(PF08479)ER
243265.plu4025(<)(ER)
243265.plu2144(>)ER
243265.plu3948(>)ER
243265.plu4830(>)(mitochondrial)
243265.plu3300PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0506(PF00345)ER
243265.plu3155(>)ER
243265.plu3930(PF02661)(ER)
243265.plu2158(PF00345)ER
243265.plu0253(PF02661)(mitochondrial)
243265.plu3722PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu3145(>)ER
243265.plu3140PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu2414PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu2419PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0226(PF08479)(mitochondrial)
243265.plu0548PF13332mitochondrial; (mitochondrial)
243265.plu0011+(mitochondrial); plastid
243265.plu0545(PF01381)mitochondrial
243265.plu0789(PF00345)ER
243265.plu0787(PF00345)ER
243265.plu0780(PF00345)ER
243265.plu0782(PF00345)(ER); ER
243265.plu0783(PF00345)(ER)
243265.plu0161+ER
243265.plu1788PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0790(PF00345)(ER)
243265.plu4815PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu2743PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0317(PF08479)ER
243265.plu0316PF13332(mitochondrial)
243265.plu2314PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0310PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0225PF13332ER; (ER)
243265.plu0798(>)(ER)
243265.plu3594PF13332ER
243265.plu0173(>)ER; (ER)
243265.plu0961(PF12256) (PF03534) PF12255
243265.plu0969(PF12256) (PF03534) PF12255
243265.plu4801(PF06662)ER
243265.plu4800(>)ER
243265.plu3266PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu2954PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu1368(PF08479)ER
243265.plu1367PF13332mitochondrial; (mitochondrial)
243265.plu4299(PF01381)mitochondrial
243265.plu1695PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4293(PF01381)mitochondrial
243265.plu2986(>)mitochondrial; (mitochondrial)
243265.plu4123PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4901(PF01381)(mitochondrial)
243265.plu3064PF13332ER
243265.plu0772(PF00345)ER
243265.plu1421PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0115(>)ER
243265.plu3480PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4864+(mitochondrial)
243265.plu2047PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu2453PF13332ER; (ER)
243265.plu0744(PF02661)(mitochondrial)
243265.plu0345PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu2677(<)ER
243265.plu3269PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu4442PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu3718PF13332mitochondrial; (mitochondrial)
243265.plu3719(PF08479)ER
243265.plu1087(>)(ER); (mitochondrial)
243265.plu4150PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu1898PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu2471+ER; (mitochondrial)
243265.plu2473PF13384 PF13358(plastid)
243265.plu0720PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4438PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0385PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu3631(PF00345)ER
243265.plu4362PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu2263(>)ER
243265.plu3026(<)(mitochondrial)
243265.plu4769+(mitochondrial)
243265.plu0738PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu2487(>)ER
243265.plu3510(<)ER
243265.plu3287(>)ER
243265.plu2133+ER
243265.plu3357PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu3353PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4356PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu3728PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0415(PF00345)ER
243265.plu4560PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0092(>)ER
243265.plu1616+ER
243265.plu1137(PF01381)mitochondrial
243265.plu1465+(ER); (mitochondrial)
243265.plu3978PF01807 PF13155(mitochondrial)
243265.plu4751PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0189(>)ER
243265.plu1499(<)(mitochondrial)
243265.plu0478PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4076PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu3568PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0994+ER
243265.plu0996(PF00345)ER
243265.plu1420(>)ER
243265.plu2681(>)ER
243265.plu0468PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu3081(>)ER
243265.plu0267(PF00345)(ER)
243265.plu0266(PF00345)(ER)
243265.plu0262(PF00345)ER
243265.plu0515(PF12256) (PF03534) PF12255
243265.plu1152+mitochondrial; (mitochondrial)
243265.plu1150(PF08479)ER
243265.plu3958PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu0879(>)ER
243265.plu3160PF13384 PF13358(plastid)
243265.plu0326PF13592 PF13358 PF13551
243265.plu4524(>)ER
243265.plu2548(>)(mitochondrial)
243265.plu3099PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu1497PF13592 PF13384 PF13358
243265.plu1146(PF01381)mitochondrial
243265.plu1149PF13332(mitochondrial)
243265.plu4319+(<)
243265.plu4001+(ER)
243265.plu0830+(>)
243265.plu2416+ER
243265.plu4644+(mitochondrial)
243265.plu0308(>)
243265.plu1954+plastid
243265.plu0549(PF08479)(mitochondrial)
243265.plu0544PF01807 PF13155
243265.plu4493(+)(mitochondrial)
243265.plu0494(PF02844) (PF02843)
243265.plu4819+(mitochondrial)
243265.plu3689PF01807 PF13155
243265.plu0791+(plastid)
243265.plu4242(+)+PF00045
243265.plu4488(+)(mitochondrial)
243265.plu1685+(plastid)
243265.plu4667(>)(ER)
243265.plu3697PF01807 PF13155
243265.plu3589PF01807 PF13155
243265.plu3580PF01807 PF13155
243265.plu1561PF14564 (PF08964)
243265.plu1217(+)(mitochondrial)
243265.plu0971+PF03538
243265.plu2420(>)
243265.plu2872+(ER)
243265.plu1009+(plastid)
243265.plu0370(+)(mitochondrial); (plastid)
243265.plu2041++
243265.plu3076+(>)
243265.plu1382+(PF16485)
243265.plu3655(>)
243265.plu1881+(plastid)
243265.plu4445(+)(mitochondrial)
243265.plu3714PF01807 PF13155
243265.plu1486+(plastid)
243265.plu4335(+)mitochondrial; plastid
243265.plu0724(PF08843)(ER); not used
243265.plu3705PF01807 PF13155
243265.plu2018(+)mitochondrial; (mitochondrial)
243265.plu4767+(ER)
243265.plu0397+(>)
243265.plu1269+plastid
243265.plu1620+(plastid)
243265.plu3036+(plastid)
243265.plu0414+(mitochondrial)
243265.plu0401(+)ER
243265.plu1440(PF13535)(mitochondrial)
243265.plu4375+(mitochondrial)
243265.plu1136PF01807 PF13155
243265.plu4243(+)+PF00045
243265.plu0232+plastid
243265.plu1053(+)ER
243265.plu1459+(mitochondrial); not used
243265.plu2838+(mitochondrial)
243265.plu1126PF01807 PF13155
243265.plu1690+(>)
243265.plu4256(+)ER
243265.plu3777(PF05932)(mitochondrial)
243265.plu3170+(ER)
243265.plu4515+(mitochondrial)
243265.plu1243(>)(mitochondrial)
243265.plu1334++
243265.plu1920(+)(mitochondrial)
243265.plu0459(+)(ER)
243265.plu4231+PF00045
243265.plu3786(+)(mitochondrial); (plastid)
243265.plu3436+(plastid)
243265.plu1145PF01807 PF13155
243265.plu3941(+)(mitochondrial)
243265.plu3894+
243265.plu1952(+)+
243265.plu4780+
243265.plu4788(PF01381)
243265.plu2373(+)(mitochondrial)
243265.plu3157(PF00165)
243265.plu3159(+)(PF01764)
243265.plu0443(PF01381)
243265.plu0334(PF01609)
243265.plu0337+
243265.plu0444(PF01381)
243265.plu4530(<)
243265.plu2797+
243265.plu2551(>)
243265.plu0206(PF01381)
243265.plu1555+
243265.plu1550(PF10908)
243265.plu0537PF13332
243265.plu4227+
243265.plu1518(PF01764)
243265.plu4592(PF01381)
243265.plu3393(>)
243265.plu3820+
243265.plu1311+
243265.plu4311(>)
243265.plu3932(PF08843)
243265.plu3937+
243265.plu2153(+)(PF10908)
243265.plu0945+
243265.plu0941+
243265.plu4825+
243265.plu3330+
243265.plu2008+
243265.plu2308(PF01381)
243265.plu3724(+)(<)
243265.plu3200+
243265.plu3206(+)(ER)
243265.plu2960+
243265.plu2412+
243265.plu2411+
243265.plu4646+
243265.plu0302+
243265.plu1012(PF06792)
243265.plu0015+
243265.plu0784(+)(plastid)
243265.plu4494(PF01609)
243265.plu2639+
243265.plu2636+
243265.plu2632(+)(ER)
243265.plu0167(<)
243265.plu0553(PF01381)
243265.plu2891(<)
243265.plu0288+
243265.plu2096(+)+
243265.plu0829(PF05932)
243265.plu4240+
243265.plu0820(PF08774)
243265.plu0822+
243265.plu0825(PF08774)
243265.plu4108+
243265.plu3469(PF01381)
243265.plu3328+
243265.plu3214(PF02661)
243265.plu3219+
243265.plu3134+
243265.plu4676+
243265.plu3044(+)(plastid)
243265.plu2534+
243265.plu1575+
243265.plu0795+
243265.plu3590(PF01381)
243265.plu3596+
243265.plu0319(PF01609)
243265.plu2622+
243265.plu0486+
243265.plu1190(+)(plastid)
243265.plu0488+
243265.plu2952PF10548
243265.plu1687+
243265.plu1684+not used
243265.plu2085(PF01381)
243265.plu0810+
243265.plu0962PF03538
243265.plu0965PF03538
243265.plu1965+
243265.plu3861+
243265.plu2164+
243265.plu1205+
243265.plu2326(<)
243265.plu3268(PF01609)
243265.plu2009+
243265.plu1986+
243265.plu1983+
243265.plu1982(+)(mitochondrial)
243265.plu3690(PF01381)
243265.plu3698(PF01381)
243265.plu0565(>)
243265.plu4270(PF08843)
243265.plu3587(PF01609)
243265.plu3581(PF01381)
243265.plu2610(>)
243265.plu2617(>)
243265.plu1361(PF01609)
243265.plu1363(PF01381)
243265.plu0101(+)(mitochondrial)
243265.plu1746(PF01609)
243265.plu1218(PF13535)
243265.plu1005(+)(mitochondrial)
243265.plu1006+
243265.plu0801(PF06792)
243265.plu0805PF03538
243265.plu0804(>)
243265.plu2984(PF01381)
243265.plu3901(>)
243265.plu2180+
243265.plu2189(PF01381)
243265.plu0970PF03538
243265.plu3877+
243265.plu2056+
243265.plu2427+
243265.plu2421(PF02661)
243265.plu4615+
243265.plu1525(<)
243265.plu1524+
243265.plu2298+
243265.plu2515(<)
243265.plu0576(<)
243265.plu0778(PF01381)
243265.plu4466(PF01381)
243265.plu4469+not used
243265.plu2605(+)(>)
243265.plu0371+
243265.plu0373+
243265.plu0372+
243265.plu2608+
243265.plu1351+
243265.plu0116(PF13535)
243265.plu0650+
243265.plu4591+
243265.plu4590+
243265.plu1519(PF01764)
243265.plu1516(PF01764)
243265.plu1517(PF01764)
243265.plu1227+
243265.plu4043+
243265.plu4284(+)(PF02661)
243265.plu2996+
243265.plu2527+
243265.plu2192+
243265.plu2191(>)
243265.plu0909(+)(mitochondrial)
243265.plu0900(PF01381)
243265.plu3803+
243265.plu2049+
243265.plu3241(PF09994)
243265.plu1968(>)
243265.plu3102+
243265.plu3105+
243265.plu2455(PF00648)
243265.plu0741+
243265.plu0297(+)(PF16715)
243265.plu0740+
243265.plu4453(+)(plastid)
243265.plu3791+
243265.plu0127(PF01609)
243265.plu3651+
243265.plu2706(PF01381)
243265.plu2707(PF01381)
243265.plu3658+
243265.plu2855+
243265.plu1726+
243265.plu4457(<)
243265.plu1655+
243265.plu1654+
243265.plu1653+
243265.plu1652+
243265.plu4148(+)(mitochondrial)
243265.plu3342(>)
243265.plu2078+
243265.plu2079(<)
243265.plu2075(>)
243265.plu2077+
243265.plu1880(+)(mitochondrial)
243265.plu0041(<)
243265.plu2449+
243265.plu2283+
243265.plu2282(PF13936)
243265.plu2280(+)(plastid)
243265.plu2285(>)
243265.plu3003(PF01381)
243265.plu3715(PF01381)
243265.plu3712(PF01609)
243265.plu2661+
243265.plu0357(PF01609)
243265.plu1402(PF01381)
243265.plu0131(PF01609)
243265.plu3796(PF01609)
243265.plu1242(PF06500)
243265.plu1712+
243265.plu1238+
243265.plu2202+
243265.plu1729+
243265.plu2201+
243265.plu3829+
243265.plu3394+
243265.plu2063+
243265.plu2062+
243265.plu1943+
243265.plu2474+
243265.plu4621+
243265.plu4626+
243265.plu3195(+)(plastid)
243265.plu3848(+)(plastid)
243265.plu3015(<)
243265.plu3016(PF13936)
243265.plu2387+
243265.plu2388+
243265.plu2389+
243265.plu1873(PF13535)
243265.plu4430(PF09994)
243265.plu4431(+)(mitochondrial)
243265.plu4436(PF03945)
243265.plu3706(PF01381)
243265.plu3703(PF01609)
243265.plu2499(<)
243265.plu1154+
243265.plu4381(<)
243265.plu1704+
243265.plu4092(PF03945)
243265.plu1415(PF01823)
243265.plu0608+
243265.plu1676+
243265.plu4169PF03538
243265.plu4160+
243265.plu4369+
243265.plu4365(PF01381)
243265.plu0932(>)
243265.plu0938+
243265.plu3171+
243265.plu4392+
243265.plu2579+
243265.plu2012+
243265.plu2013+
243265.plu2016+
243265.plu2015+
243265.plu2019+
243265.plu2217(+)(mitochondrial)
243265.plu4395+
243265.plu1809+
243265.plu2127(PF01381)
243265.plu2121+
243265.plu0364+
243265.plu2460PF03538
243265.plu2260+
243265.plu4893(PF13936)
243265.plu4764+
243265.plu0732PF03984
243265.plu0734PF03984
243265.plu3734+
243265.plu3735+
243265.plu2644+
243265.plu0390+
243265.plu4555+
243265.plu3602+
243265.plu1260(+)+
243265.plu1066+
243265.plu4089+
243265.plu4082(PF01609)
243265.plu1461(+)(PF10908)
243265.plu3577PF13332
243265.plu1606(PF01609)
243265.plu4649(PF01609)
243265.plu1609(PF13936)
243265.plu4379+
243265.plu4378+
243265.plu4370+
243265.plu1628(>)
243265.plu1114(PF01609)
243265.plu1286+
243265.plu1282+
243265.plu2397(+)(>)
243265.plu2001+
243265.plu2003+
243265.plu2002+
243265.plu2004+
243265.plu2007+
243265.plu1214+
243265.plu0895(PF01381)
243265.plu0897(>)
243265.plu1211+
243265.plu1210+
243265.plu1043(>)
243265.plu3283(>)
243265.plu2138+
243265.plu4880(PF02661)
243265.plu3846+
243265.plu0584(<)
243265.plu3038+
243265.plu4779(PF01381)
243265.plu1855+
243265.plu0705+
243265.plu4412(+)(plastid)
243265.plu1694+
243265.plu1279+
243265.plu1074+
243265.plu3671(+)(mitochondrial)
243265.plu3504+
243265.plu3503(PF02661)
243265.plu1473+
243265.plu2922(PF01381)
243265.plu2921(PF01381)
243265.plu4186(PF06500)
243265.plu2816+
243265.plu0426+
243265.plu0760(>)
243265.plu3679(<)
243265.plu3609+
243265.plu2519+
243265.plu1917(>)
243265.plu1072(PF01609)
243265.plu1822+
243265.plu1824(PF13936)
243265.plu1812(PF01381)
243265.plu0246+
243265.plu3753(PF05932)
243265.plu3757(PF07720)
243265.plu3755+
243265.plu3196+
243265.plu0403+
243265.plu4579+
243265.plu0084+
243265.plu0669+
243265.plu1042(PF08843)
243265.plu0060+
243265.plu1446+
243265.plu1441(PF13535)
243265.plu3578(PF01609)
243265.plu2937(>)
243265.plu2930+not used
243265.plu4195+
243265.plu4198+
243265.plu4241+
243265.plu1131+
243265.plu1578+
243265.plu1463+
243265.plu0981+
243265.plu0984+
243265.plu1430+
243265.plu1605+
243265.plu4750+
243265.plu0270+
243265.plu0278+
243265.plu0279+
243265.plu0988+
243265.plu3185+
243265.plu0477+
243265.plu4507+
243265.plu2769+
243265.plu2764(<)
243265.plu2766(PF13535)
243265.plu2563(<)
243265.plu0250(<)
243265.plu2907+
243265.plu1630(+)+
243265.plu1637+
243265.plu1127(PF01381)
243265.plu0865(PF01381)
243265.plu3982(PF01381)
243265.plu1035+
243265.plu3969(+)(mitochondrial)
243265.plu0992+
243265.plu2224+
243265.plu1931(PF01381)
243265.plu1696+
243265.plu0888(<)
243265.plu0389+
243265.plu3776+
243265.plu3770(+)(plastid)
243265.plu0463(PF08774)
243265.plu3086+
243265.plu3555+
243265.plu3556+
243265.plu4208(PF01609)
243265.plu1717+
243265.plu2849+
243265.plu1331+
243265.plu1480+
243265.plu2005+
243265.plu1484+
243265.plu4331+not used
243265.plu2827+
243265.plu3425+
243265.plu0958(+)(ER)
243265.plu1157+
243265.plu2918(+)(plastid)
243265.plu0851PF13551
243265.plu0854(PF13936)
243265.plu2177+
243265.plu1508+
243265.plu4682+
243265.plu1925+
243265.plu1924(+)(plastid)
243265.plu2362+
243265.plu3227(PF09994)
243265.plu3220+
243265.plu3325+
243265.plu3733+
243265.plu0198+
243265.plu0210+
243265.plu1629+
243265.plu3163+
243265.plu3162(PF05932)
243265.plu0457+
243265.plu0453(PF08843)
243265.plu2848+
243265.plu1663+
243265.plu1032+
243265.plu1034+
243265.plu3545+
243265.plu3789(PF05932)
243265.plu3788+
243265.plu3783+
243265.plu1493(+)(PF08774)
243265.plu1813+
243265.plu1507(+)(ER)
243265.plu1141+
243265.plu1142+
243265.plu4016(+)plastid
243265.plu2962+
243265.plu2964(>)
243265.plu1810(+)
243265.plu2761(+)
243265.plu0843(+)
243265.plu4838(+)
243265.plu1584(+)
243265.plu3156(+)
243265.plu4536(+)
243265.plu1553(+)not used
243265.plu0531(+)not used
243265.plu0024(+)
243265.plu1383(+)
243265.plu1312(+)
243265.plu0158(+)
243265.plu1776(+)
243265.plu3760(+)
243265.plu2971(+)
243265.plu3331(+)
243265.plu3729(+)
243265.plu2528(+)
243265.plu2529(+)
243265.plu1304(+)
243265.plu3459(+)
243265.plu0554(+)
243265.plu2898(+)
243265.plu0950(+)
243265.plu3329(+)
243265.plu3326(+)
243265.plu2746(+)
243265.plu3211(+)
243265.plu3138(+)
243265.plu3130(+)
243265.plu2400(+)
243265.plu1997(+)
243265.plu3684(+)
243265.plu3682(+)
243265.plu3683(+)
243265.plu2626(+)
243265.plu2621(+)
243265.plu3468(+)
243265.plu0485(+)
243265.plu0481(+)
243265.plu3465(+)not used
243265.plu3463(+)
243265.plu2881(+)
243265.plu2883(+)
243265.plu1688(+)
243265.plu0813(+)
243265.plu4118(+)
243265.plu3508(+)
243265.plu1878(+)
243265.plu1966(+)
243265.plu3863(+)
243265.plu1876(+)
243265.plu2324(+)
243265.plu3260(+)
243265.plu3261(+)
243265.plu0445(+)not used
243265.plu2699(+)
243265.plu2433(+)
243265.plu3691(+)
243265.plu3695(+)
243265.plu3699(+)
243265.plu3054(+)
243265.plu2505(+)not used
243265.plu4471(+)
243265.plu2614(+)
243265.plu3319(+)
243265.plu1364(+)
243265.plu3478(+)
243265.plu3472(+)
243265.plu4582(+)
243265.plu4586(+)
243265.plu1744(+)
243265.plu1219(+)
243265.plu4052(+)
243265.plu4298(+)
243265.plu3452(+)
243265.plu3878(+)
243265.plu2051(+)
243265.plu4343(+)
243265.plu3113(+)
243265.plu2728(+)
243265.plu3639(+)
243265.plu2518(+)
243265.plu3068(+)
243265.plu0577(+)
243265.plu0575(+)
243265.plu4265(+)
243265.plu0374(+)
243265.plu1357(+)
243265.plu1358(+)
243265.plu1510(+)
243265.plu4285(+)
243265.plu2995(+)
243265.plu0902(+)
243265.plu2040(+)
243265.plu3245(+)
243265.plu1706(+)
243265.plu2458(+)
243265.plu3104(+)
243265.plu3074(+)
243265.plu4452(+)
243265.plu0124(+)
243265.plu3496(+)
243265.plu1503(+)
243265.plu1235(+)
243265.plu1727(+)
243265.plu1651(+)
243265.plu2673(+)
243265.plu4140(+)
243265.plu0915(+)
243265.plu3817(+)
243265.plu1433(+)
243265.plu2999(+)
243265.plu0042(+)
243265.plu0155(+)
243265.plu4846(+)
243265.plu4702(+)
243265.plu0754(+)
243265.plu0280(+)
243265.plu0282(+)
243265.plu3711(+)
243265.plu2664(+)
243265.plu0355(+)
243265.plu0354(+)
243265.plu4666(+)
243265.plu0130(+)
243265.plu1500(+)
243265.plu1538(+)
243265.plu1716(+)
243265.plu0626(+)
243265.plu0625(+)
243265.plu1662(+)not used
243265.plu1665(+)
243265.plu1666(+)
243265.plu1390(+)
243265.plu1728(+)
243265.plu3343(+)
243265.plu4888(+)
243265.plu4627(+)
243265.plu1948(+)
243265.plu2278(+)
243265.plu3427(+)
243265.plu3010(+)
243265.plu3013(+)
243265.plu1944(+)
243265.plu2386(+)
243265.plu0728(+)
243265.plu0722(+)
243265.plu1707(+)
243265.plu4273(+)
243265.plu4165(+)
243265.plu4167(+)
243265.plu1389(+)
243265.plu4390(+)
243265.plu2010(+)
243265.plu2011(+)
243265.plu2265(+)
243265.plu2120(+)
243265.plu4762(+)
243265.plu4760(+)
243265.plu4768(+)
243265.plu0735(+)
243265.plu2484(+)
243265.plu2730(+)
243265.plu1067(+)
243265.plu1062(+)
243265.plu1460(+)
243265.plu3677(+)
243265.plu2865(+)
243265.plu1287(+)
243265.plu1284(+)
243265.plu3524(+)
243265.plu2399(+)
243265.plu2000(+)
243265.plu3281(+)
243265.plu3629(+)not used
243265.plu1858(+)
243265.plu4418(+)
243265.plu3721(+)
243265.plu3720(+)
243265.plu3842(+)
243265.plu4568(+)
243265.plu3256(+)
243265.plu0670(+)
243265.plu0070(+)
243265.plu3315(+)
243265.plu3502(+)
243265.plu3501(+)
243265.plu2926(+)
243265.plu1610(+)
243265.plu1613(+)
243265.plu1615(+)
243265.plu4182(+)
243265.plu0542(+)
243265.plu2034(+)
243265.plu2036(+)
243265.plu3292(+)
243265.plu2103(+)
243265.plu2107(+)
243265.plu1829(+)
243265.plu0976(+)
243265.plu3756(+)
243265.plu3193(+)
243265.plu0663(+)
243265.plu0064(+)
243265.plu1625(+)
243265.plu1626(+)not used
243265.plu3051(+)
243265.plu3404(+)
243265.plu1134(+)
243265.plu3457(+)
243265.plu2023(+)
243265.plu1464(+)
243265.plu2119(+)
243265.plu2238(+)
243265.plu0557(+)
243265.plu1900(+)
243265.plu1902(+)
243265.plu3370(+)
243265.plu0322(+)not used
243265.plu2342(+)
243265.plu2349(+)
243265.plu3748(+)
243265.plu2694(+)
243265.plu2767(+)
243265.plu1059(+)
243265.plu4215(+)
243265.plu1240(+)
243265.plu1124(+)
243265.plu1691(+)
243265.plu1128(+)
243265.plu3980(+)
243265.plu3963(+)
243265.plu0030(+)not used
243265.plu0034(+)
243265.plu4697(+)
243265.plu2222(+)
243265.plu3364(+)
243265.plu4605(+)
243265.plu2357(+)
243265.plu1805(+)
243265.plu1806(+)
243265.plu4239(+)
243265.plu2685(+)
243265.plu1532(+)
243265.plu3784(+)
243265.plu1022(+)
243265.plu3798(+)
243265.plu0197(+)
243265.plu1482(+)
243265.plu1713(+)
243265.plu2006(+)
243265.plu4024(+)
243265.plu4307(+)
243265.plu1703(+)not used
243265.plu3886(+)
243265.plu3885(+)
243265.plu4689(+)
243265.plu3318(+)
243265.plu4729(+)
243265.plu4720(+)
243265.plu3221(+)
243265.plu3766(+)
243265.plu3769(+)
243265.plu4526(+)
243265.plu3095(+)
243265.plu3094(+)
243265.plu0217(+)
243265.plu1038(+)
243265.plu1036(+)
243265.plu0524(+)
243265.plu3548(+)
243265.plu3541(+)
243265.plu3781(+)
243265.plu0144(+)
243265.plu0141(+)
243265.plu3430(+)
243265.plu2768(+)
243265.plu2961(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 1.4 (14/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 2.875 (23/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================