Effective results for Streptosporangium roseum DSM 43021 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1273
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 98 eukaryotic-like domains, contained in 1273 proteins (11 high, 1262 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
479432.Sros_2604(PF00196) (PF03704) (PF00486)(mitochondrial)
479432.Sros_0836(PF00931) (PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_4208(PF02278) (PF08124) (PF02884)(mitochondrial)
479432.Sros_4999(PF03644) (PF00754)ER
479432.Sros_3784(PF16317) (PF00754)ER
479432.Sros_2256(PF02278) (PF02884)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_3336(PF00041) PF03423ER
479432.Sros_7134(PF11721) (PF00041)ER
479432.Sros_1172(PF04542) (PF08281)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_7741(PF00931) (PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_0829(PF03704) (PF00486)ER
479432.Sros_3432(PF00931) (PF03704) (PF00486)(mitochondrial)
479432.Sros_7591(PF00041) (PF00553)ER
479432.Sros_4296(PF00931) (PF03704)(mitochondrial)
479432.Sros_3384(PF00931) (PF03704) (PF00486)(plastid)
479432.Sros_3559(PF00041) (PF00553)(mitochondrial); plastid
479432.Sros_2208(PF00668) (PF05977) (PF13745)(mitochondrial)
479432.Sros_6790(PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_2247(PF04542) (PF08281)(ER)
479432.Sros_6897(PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_0933(PF00041) (PF00553)ER
479432.Sros_0935(PF00041) (PF00553)ER
479432.Sros_0934(PF00041) (PF00553)ER
479432.Sros_1025(PF03704) (PF00486)ER
479432.Sros_4464(PF03704) (PF00486)mitochondrial
479432.Sros_1918(PF02839) (PF00041)ER
479432.Sros_2430(PF00931) (PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_4174(PF00931) (PF03704) (PF00486)(plastid)
479432.Sros_8724(PF01804) (PF00754)ER
479432.Sros_6842(PF00668) (PF13745)(mitochondrial)
479432.Sros_3391(PF00931) (PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_2492(PF00041) (PF00553)ER
479432.Sros_4874(PF04542) (PF08281)(ER)
479432.Sros_4992(PF00754)ER
479432.Sros_4059(PF08279)ER
479432.Sros_6208(PF01494)mitochondrial
479432.Sros_1461(PF00931) (PF03704) (PF00486)
479432.Sros_7157(PF01061)(mitochondrial)
479432.Sros_7566(PF00553)(mitochondrial)
479432.Sros_7565(PF00553)ER
479432.Sros_6787(PF01061)(mitochondrial)
479432.Sros_0034(PF00144)ER
479432.Sros_1255(PF08281)(mitochondrial); mitochondrial
479432.Sros_4557(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_5207(PF01494)(ER)
479432.Sros_6414(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_8158(PF01061)(mitochondrial)
479432.Sros_5809(PF13460)mitochondrial
479432.Sros_8153(PF01494)ER; (ER)
479432.Sros_8784(PF08376)ER
479432.Sros_7950(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_4312(PF02225)ER
479432.Sros_5783(PF00931) (PF03704) (PF00486)
479432.Sros_5782(PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_9271(PF00067)ER
479432.Sros_3337PF03423ER
479432.Sros_3334(PF00668) (PF13745)(mitochondrial)
479432.Sros_1861(PF05977)mitochondrial
479432.Sros_2505(PF01804)mitochondrial
479432.Sros_5767(PF01494)(ER)
479432.Sros_7113(PF02627)(ER)
479432.Sros_0079(PF12802)ER; (ER)
479432.Sros_5244(PF08279)ER
479432.Sros_7912(PF00754)(ER)
479432.Sros_7913(PF02322)ER
479432.Sros_7911(PF00754)ER
479432.Sros_7914(PF01654)ER
479432.Sros_2262(PF13349)ER
479432.Sros_3800PF03659ER
479432.Sros_4605(PF02322)ER
479432.Sros_3497(PF11721)ER
479432.Sros_7646(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_1396(PF08309)ER
479432.Sros_1395(PF08309)ER
479432.Sros_4416(PF00196)(ER); ER
479432.Sros_2156(PF12802)(ER)
479432.Sros_8445(PF01804)mitochondrial
479432.Sros_5280(PF12802)(mitochondrial)
479432.Sros_7728(PF02983)ER
479432.Sros_7622(PF00480) (PF12802)(ER)
479432.Sros_4390(PF01804)ER
479432.Sros_4398(PF00144)ER
479432.Sros_5709(PF08352)ER
479432.Sros_4476(PF00754)ER
479432.Sros_1117(PF00163)(mitochondrial)
479432.Sros_3848(PF01872)ER
479432.Sros_8721(PF00144)ER
479432.Sros_4645(PF08279)(ER); (plastid)
479432.Sros_1589PF03659ER
479432.Sros_2729(PF01494)mitochondrial
479432.Sros_3193(PF08376)ER
479432.Sros_3456(PF00069)(mitochondrial)
479432.Sros_2974(PF08279)(mitochondrial); (ER)
479432.Sros_0213(PF01061)(mitochondrial)
479432.Sros_8183(PF02225)ER
479432.Sros_9294(PF00931) (PF00486) (PF03704)
479432.Sros_6746(PF05977)(ER)
479432.Sros_4216(PF00440)(ER)
479432.Sros_5805(PF02983)ER
479432.Sros_3478(PF12802)(ER)
479432.Sros_2300(PF00196)(ER)
479432.Sros_3657(PF00931) (PF03704) (PF00486)
479432.Sros_7883(PF14087)ER
479432.Sros_9106(PF08309)ER; (ER)
479432.Sros_6166(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_2096(PF07702)(mitochondrial)
479432.Sros_1678(PF01061)ER
479432.Sros_1920(PF02839)ER
479432.Sros_8916(PF02983)ER; (ER)
479432.Sros_6952(PF01872)ER
479432.Sros_4140(PF08592)ER
479432.Sros_1313(PF03704)ER; (ER)
479432.Sros_1544(PF00069)(mitochondrial)
479432.Sros_3980(PF08279)ER
479432.Sros_7747(PF00440)mitochondrial
479432.Sros_3920PF14447(mitochondrial)
479432.Sros_3696(PF01872)ER
479432.Sros_2345(PF03992)(mitochondrial)
479432.Sros_5697(PF08352)(mitochondrial)
479432.Sros_3599(PF02839)ER
479432.Sros_6991(PF02627)mitochondrial
479432.Sros_7867(PF13460)(mitochondrial)
479432.Sros_9167(PF00266)(mitochondrial); plastid
479432.Sros_4183(PF01061)mitochondrial
479432.Sros_6603(PF01494)ER
479432.Sros_3034(PF02225)(ER); ER
479432.Sros_9090(PF07702)(ER)
479432.Sros_5380(PF08326)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_1775(PF01061)ER
479432.Sros_3558(PF02839)ER
479432.Sros_7257(PF08279)ER
479432.Sros_6254(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_6663(PF02322)ER
479432.Sros_3289(PF01494)ER; (ER)
479432.Sros_0570(PF00144)mitochondrial
479432.Sros_8778(PF01494)ER; (ER)
479432.Sros_4085(PF00440)(mitochondrial); plastid
479432.Sros_4089(PF05977)(mitochondrial)
479432.Sros_1562(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_5020(PF00440)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_4862(PF03403)ER
479432.Sros_9330(PF00196)(ER)
479432.Sros_6210(PF00144)mitochondrial
479432.Sros_5326(PF08279)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_3895(PF02839)ER
479432.Sros_6027(PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_1240(PF00041)ER
479432.Sros_4547(PF02322)ER
479432.Sros_3791(PF00931) (PF03704) (PF00486)
479432.Sros_5839(PF13565)(mitochondrial)
479432.Sros_4308(PF01061)(ER); mitochondrial
479432.Sros_4309(PF01061)ER
479432.Sros_5792(PF02225)ER
479432.Sros_2893(PF00754)ER
479432.Sros_5216(PF02225)ER
479432.Sros_2535(PF13460)mitochondrial
479432.Sros_6407(PF00553)ER
479432.Sros_0356(PF08376)ER
479432.Sros_6890(PF00553)(ER); ER
479432.Sros_8791PF06241(mitochondrial)
479432.Sros_8795(PF02322)ER
479432.Sros_8794(PF01654)(ER); plastid
479432.Sros_4368(PF05977)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_4361(PF16901)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_4029(PF00196)(ER)
479432.Sros_9200(PF01872)ER; (ER)
479432.Sros_9203(PF00144)mitochondrial
479432.Sros_5238(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_8803(PF03403)ER
479432.Sros_5436(PF13460)(mitochondrial)
479432.Sros_2166(PF01494)(ER)
479432.Sros_0452(PF08279)mitochondrial; ER
479432.Sros_0936(PF00553)mitochondrial
479432.Sros_7908(PF02839)ER; mitochondrial
479432.Sros_8280(PF00553)ER
479432.Sros_5419(PF01494)ER; (ER)
479432.Sros_5081(PF01061)(ER)
479432.Sros_4423(PF13565)(mitochondrial)
479432.Sros_8630(PF08279)(ER)
479432.Sros_0043(PF00965)ER
479432.Sros_4638(PF00440)mitochondrial
479432.Sros_4635(PF13565)(mitochondrial)
479432.Sros_6467(PF00144)(mitochondrial)
479432.Sros_0606(PF00144)(mitochondrial); (ER)
479432.Sros_2550(PF00144)ER
479432.Sros_7736(PF00440)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_5476(PF12740)ER
479432.Sros_5719(PF00553)ER
479432.Sros_9154(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_4405(PF00440)(mitochondrial); (plastid)
479432.Sros_0415(PF07510)ER
479432.Sros_0977(PF08279)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_0625(PF08376)ER
479432.Sros_5296(PF00553)ER
479432.Sros_8171(PF00553)ER
479432.Sros_5452(PF02839)ER
479432.Sros_3272(PF00931)ER
479432.Sros_3279(PF02322)ER
479432.Sros_4885(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_8887(PF05977)mitochondrial; ER
479432.Sros_3462(PF04542) (PF08281)(ER)
479432.Sros_1917(PF00553)ER
479432.Sros_7185(PF01872)ER
479432.Sros_2473(PF08352)mitochondrial
479432.Sros_2479(PF02983)ER
479432.Sros_3253(PF03403)ER
479432.Sros_4203(PF02225)ER
479432.Sros_8037(PF16889)ER
479432.Sros_3403(PF00163)(mitochondrial)
479432.Sros_3408(PF01061)(mitochondrial)
479432.Sros_3375(PF00480)mitochondrial
479432.Sros_8206(PF12802)ER; (ER)
479432.Sros_1566(PF08592)ER
479432.Sros_7893PF06241mitochondrial
479432.Sros_0817(PF13349)ER
479432.Sros_0812(PF00754)ER
479432.Sros_5375(PF07510)ER
479432.Sros_3230(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_4224(PF01872)ER
479432.Sros_4226(PF04542) (PF08281)(mitochondrial)
479432.Sros_4221(PF03403)(mitochondrial)
479432.Sros_4222(PF05977)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_4516(PF13460)(mitochondrial)
479432.Sros_5141(PF03704) (PF00486)(ER)
479432.Sros_6172(PF01494)ER
479432.Sros_0793(PF02225)ER
479432.Sros_0247(PF00135)ER
479432.Sros_5960(PF01025)ER
479432.Sros_5968(PF13469)(mitochondrial)
479432.Sros_4154(PF08592)ER
479432.Sros_3746(PF08592)(ER)
479432.Sros_2448(PF00754)ER
479432.Sros_4973(PF00266)mitochondrial; ER
479432.Sros_5510(PF13460)(mitochondrial)
479432.Sros_7209(PF03403)ER
479432.Sros_6636(PF12740)ER
479432.Sros_6982(PF01872)(ER)
479432.Sros_1180(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_3589(PF05147)ER
479432.Sros_6846(PF02839)ER
479432.Sros_0112(PF00069)(mitochondrial); mitochondrial
479432.Sros_7263(PF00069)(mitochondrial)
479432.Sros_3395(PF00754)ER
479432.Sros_3396(PF00754)mitochondrial
479432.Sros_0283(PF02839)ER
479432.Sros_0284(PF14087)ER
479432.Sros_8919(PF02983)ER; (ER)
479432.Sros_8918(PF02983)(ER)
479432.Sros_8917(PF02983)ER; (ER)
479432.Sros_8260(PF00480)mitochondrial
479432.Sros_8915(PF02983)(ER)
479432.Sros_5398(PF08279)ER
479432.Sros_5395(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_3144(PF05977)ER; mitochondrial
479432.Sros_3140(PF00754)ER
479432.Sros_3707(PF02026)ER
479432.Sros_3705(PF16889)ER
479432.Sros_0545(PF03992)ER
479432.Sros_1551(PF00754)ER
479432.Sros_6264(PF00440)ER; (ER)
479432.Sros_0735(PF03704) (PF00486)(mitochondrial)
479432.Sros_4133(PF08279)ER
479432.Sros_2496(PF01494)mitochondrial
479432.Sros_3724(PF00754)ER
479432.Sros_3727(PF00480)(mitochondrial)
479432.Sros_3723(PF00754)ER
479432.Sros_4096(PF01872)(ER)
479432.Sros_2003(PF00754)ER
479432.Sros_2002(PF00135)ER; (ER)
479432.Sros_8952(PF02225)(mitochondrial); mitochondrial
479432.Sros_4517(PF04542) (PF08281)(ER)
479432.Sros_2210(PF13460)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_4851(PF08352)(ER)
479432.Sros_5620(PF00144)mitochondrial; (mitochondrial)
479432.Sros_5825(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_8509(PF00069)(mitochondrial)
479432.Sros_7979(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_4051(PF00196)(ER)
479432.Sros_0759(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_1805(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_4558(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_6577(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_8781(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_7958(PF13460)(mitochondrial)
479432.Sros_2424(PF00668) (PF13745)
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479432.Sros_6557(PF00668) (PF13745)
479432.Sros_6558(PF00668) (PF13745)
479432.Sros_1611(PF04542) (PF08281)
479432.Sros_4012(PF00440)(mitochondrial)
479432.Sros_5768(PF00440)(mitochondrial)
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479432.Sros_4097(PF00440)(ER)
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479432.Sros_3954(PF00069)
479432.Sros_5800(PF00196)
479432.Sros_6676(PF00069)
479432.Sros_3077(PF16889)
479432.Sros_8931(PF08352)
479432.Sros_8930(PF08352)
479432.Sros_8935(PF01061)
479432.Sros_0093(PF00069)
479432.Sros_0091(PF00196)
479432.Sros_6079(PF05977)
479432.Sros_0898(PF04542)
479432.Sros_0895(PF00486)
479432.Sros_2497(PF00440)
479432.Sros_6384(PF00440)
479432.Sros_3541(PF12802)
479432.Sros_7386(PF00069)
479432.Sros_7380(PF07702)
479432.Sros_7034(PF07702)
479432.Sros_2239(PF07510)
479432.Sros_3081(PF13580)
479432.Sros_8769(PF00440)
479432.Sros_8099(PF02575)
479432.Sros_8764(PF00486)
479432.Sros_6806(PF00486)
479432.Sros_6800(PF00440)
479432.Sros_0156(PF07702)
479432.Sros_0154(PF07702)
479432.Sros_4093(PF00440)
479432.Sros_4095(PF08279)
479432.Sros_1579(PF00069)
479432.Sros_2008(PF12802)
479432.Sros_2000(PF00440)
479432.Sros_5054(PF00440)
479432.Sros_2005(PF02126)
479432.Sros_2004(PF02126)
479432.Sros_0718(PF07702)
479432.Sros_4875(PF13474)
479432.Sros_4879(PF00135)
479432.Sros_3063(PF00480)
479432.Sros_3061(PF00480)
479432.Sros_7526(PF00440)
479432.Sros_2820(PF00196)
479432.Sros_2824(PF01327)
479432.Sros_5606(PF00440)
479432.Sros_5601(PF01327)
479432.Sros_2923(PF03070)
479432.Sros_5608(PF01139)
479432.Sros_1039(PF01494)
479432.Sros_3524(PF00196)
479432.Sros_3293(PF03992)
479432.Sros_4471(PF12802)
479432.Sros_4473(PF00440)
479432.Sros_0508(PF00196)
479432.Sros_0503(PF00196)
479432.Sros_8744(PF00067)
479432.Sros_4071(PF00440)
479432.Sros_4073(PF00440)
479432.Sros_4076(PF00144)
479432.Sros_5038(PF01636)
479432.Sros_5035(PF12802)
479432.Sros_5033(PF13565)
479432.Sros_2022(PF01494)
479432.Sros_0773(PF00196)
479432.Sros_1821(PF08376)
479432.Sros_5623(PF00440)
479432.Sros_5626(PF13460)
479432.Sros_6032(PF00196)
479432.Sros_9024(PF12802)
479432.Sros_4685(PF13565)
479432.Sros_4684(PF12900)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================