Effective results for Kribbella flavida DSM 17836 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 664
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 60 eukaryotic-like domains, contained in 664 proteins (9 high, 655 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
479435.Kfla_1820(PF00356) (PF13377)(mitochondrial); (plastid)
479435.Kfla_4225(PF00356) (PF13377)mitochondrial
479435.Kfla_2983(PF16655) (PF09423)(mitochondrial)
479435.Kfla_0302(PF16655) (PF09423)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_1053(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_2021(PF08124) (PF02884)mitochondrial
479435.Kfla_2588(PF16655) (PF09423)mitochondrial
479435.Kfla_5257(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_6814(PF16655) (PF09423)(mitochondrial)
479435.Kfla_1832(PF00356) (PF13377)(mitochondrial); plastid
479435.Kfla_4788(PF04542) (PF08281)(mitochondrial)
479435.Kfla_4255(PF12862) (PF03704)(mitochondrial)
479435.Kfla_0044(PF00356) (PF13377)(mitochondrial); plastid
479435.Kfla_6180(PF16655) (PF09423)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_6512(PF00356) (PF13377)mitochondrial
479435.Kfla_2661(PF16655) (PF09423)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_6358(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_2773(PF04542) (PF08281)(ER)
479435.Kfla_2755(PF00356) (PF13377)(mitochondrial); plastid
479435.Kfla_2382(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_3048(PF16990)ER
479435.Kfla_0482(PF00754)ER
479435.Kfla_6080(PF03372)ER
479435.Kfla_6084(PF03372)ER
479435.Kfla_1512PF16116ER
479435.Kfla_1513PF16116ER; (mitochondrial)
479435.Kfla_5518(PF00356) (PF13377)(plastid)
479435.Kfla_0364(PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_5093(PF08386)ER
479435.Kfla_2841(PF04542) (PF08281)(ER)
479435.Kfla_3490(PF13302)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_3492(PF00754)ER
479435.Kfla_4263(PF03795)(mitochondrial)
479435.Kfla_4482(PF08386)ER
479435.Kfla_7048(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_7049(PF00754)ER
479435.Kfla_0542(PF00583)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_0093(PF00480)(mitochondrial)
479435.Kfla_0896(PF05977)ER
479435.Kfla_1667(PF04542) (PF08281)(ER)
479435.Kfla_2807(PF05977)(ER); (plastid)
479435.Kfla_6004(PF03372)(mitochondrial); (plastid)
479435.Kfla_4578(PF13653)ER
479435.Kfla_4573(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_5484PF06963ER
479435.Kfla_5156(PF08386)ER
479435.Kfla_1671(PF03663)ER
479435.Kfla_4148(PF01636)(mitochondrial)
479435.Kfla_0922(PF16670)(ER)
479435.Kfla_1032(PF13302)(mitochondrial)
479435.Kfla_6056(PF05977)ER
479435.Kfla_4822(PF00480)mitochondrial
479435.Kfla_5668(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_3849(PF02333)ER
479435.Kfla_2464(PF00754)ER
479435.Kfla_2463(PF00754)ER
479435.Kfla_2462(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_5858(PF00356) (PF13377)(plastid)
479435.Kfla_5270(PF00356) (PF13377)(plastid)
479435.Kfla_5278(PF08386)ER
479435.Kfla_1174(PF01636)(ER)
479435.Kfla_1400(PF03663)ER
479435.Kfla_6815(PF00754)mitochondrial
479435.Kfla_6810(PF00754)ER
479435.Kfla_4672(PF16990)ER
479435.Kfla_0776(PF00356) (PF13377)(plastid)
479435.Kfla_1304(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_1309(PF08386)ER
479435.Kfla_1308(PF03795)(mitochondrial)
479435.Kfla_3724(PF03372)ER
479435.Kfla_2975(PF08386)ER
479435.Kfla_5912(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_6858(PF03704)ER
479435.Kfla_1464(PF03663)(ER)
479435.Kfla_5392(PF03704)ER
479435.Kfla_5029(PF04542) (PF08281)(plastid)
479435.Kfla_4397(PF01636)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_0805(PF08386)ER
479435.Kfla_0650(PF07931)(ER)
479435.Kfla_2871(PF13649)ER; (ER)
479435.Kfla_6215(PF05721)(ER)
479435.Kfla_7034(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_5525(PF00583)(mitochondrial)
479435.Kfla_0357(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_3038(PF03015)(ER)
479435.Kfla_1504(PF00754)ER
479435.Kfla_1507(PF16990)ER
479435.Kfla_1768(PF03372)ER
479435.Kfla_7013(PF00754)ER
479435.Kfla_4526(PF08386)ER
479435.Kfla_5780(PF08386)ER
479435.Kfla_1041(PF03704)(ER); (mitochondrial)
479435.Kfla_3229(PF00754)ER
479435.Kfla_1069(PF00754)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_2591(PF00480)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_4171(PF01229)ER
479435.Kfla_5808(PF01872)(ER)
479435.Kfla_5806(PF00754)ER
479435.Kfla_3415(PF03372)mitochondrial; (mitochondrial)
479435.Kfla_4546(PF13302)(mitochondrial)
479435.Kfla_6962(PF16670)ER
479435.Kfla_5619(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_5459(PF00754)ER
479435.Kfla_4052(PF16990)mitochondrial
479435.Kfla_4442PF16116(mitochondrial); mitochondrial
479435.Kfla_4441PF16116ER
479435.Kfla_5244(PF01636)(mitochondrial)
479435.Kfla_6747(PF03372)mitochondrial; ER
479435.Kfla_2664(PF03663)ER
479435.Kfla_0027(PF00754)ER
479435.Kfla_1880(PF11175)ER
479435.Kfla_4461(PF05977)ER
479435.Kfla_3307(PF08326)(mitochondrial)
479435.Kfla_4329(PF08386)ER
479435.Kfla_5208(PF03372)ER
479435.Kfla_2965(PF08386)ER
479435.Kfla_6476(PF03372)ER
479435.Kfla_2771(PF01872)(ER); ER
479435.Kfla_3655(PF00754)mitochondrial
479435.Kfla_6868(PF02333)ER
479435.Kfla_2347(PF03372)(ER)
479435.Kfla_4366(PF08031)mitochondrial
479435.Kfla_1717(PF00079)ER
479435.Kfla_2927(PF00356) (PF13377)(mitochondrial)
479435.Kfla_5965(PF03372)ER
479435.Kfla_4974(PF00754)ER
479435.Kfla_3044(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4012(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0665(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_4958(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6166(PF03147) (PF01409)
479435.Kfla_3026(PF00583)(mitochondrial)
479435.Kfla_5075(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_2869(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1777(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2694(PF03704)(mitochondrial)
479435.Kfla_3610(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_2981(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2068(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3554(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_5305(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3672(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_6028(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0323(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_1051(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3778(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0526(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3751(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4165(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_1489(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3259(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5481(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5157(PF16158)(mitochondrial)
479435.Kfla_5159(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2287(PF08386)plastid
479435.Kfla_5369(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0076(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6383(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1900(PF00480)(ER)
479435.Kfla_2404(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_0249(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0240(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4716(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1636(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_6193(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2679(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5463(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_6691(PF16655) (PF09423)
479435.Kfla_3923(PF03795)(ER)
479435.Kfla_3922(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4470(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1151(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1403(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5403(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3949(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_3946(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_4677(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_3370(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5238(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4084(PF03704)(ER)
479435.Kfla_4431(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3164(PF03795)(mitochondrial)
479435.Kfla_3163(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0182(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0459(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4559(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_2356(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_5763(PF13302)(plastid)
479435.Kfla_6614(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6618(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5952(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_1813(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_6096(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_2134(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2098(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_5584(PF01636)(ER)
479435.Kfla_4838(PF01820) (PF07478)
479435.Kfla_1458(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_7060(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3034(PF03704)(mitochondrial)
479435.Kfla_4044(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4023(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6234(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3620(PF01820) (PF07478)
479435.Kfla_4270(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_1973(PF05977)(ER)
479435.Kfla_2834(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0784(PF01820) (PF07478)
479435.Kfla_1564(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1563(PF03795)(ER)
479435.Kfla_5781(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_2039(PF00480)(plastid)
479435.Kfla_2784(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3788(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_2812(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6019(PF01715)(ER)
479435.Kfla_6274(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3220(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_7073(PF01820) (PF07478)
479435.Kfla_0335(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0339(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6486(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1065(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2603(PF16655) (PF09423)
479435.Kfla_2419(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4158(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0255(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_2626(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4834(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3918(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3870(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_3877(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4137(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_5267(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_0238(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4720(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_4586(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1162(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1160(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5216(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1379(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1087(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6824(PF08124) (PF02884)
479435.Kfla_5829(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6805(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_4662PF14447(mitochondrial)
479435.Kfla_2496(PF03795)(mitochondrial)
479435.Kfla_4501(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_5439(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_1680(PF05977)(mitochondrial)
479435.Kfla_5904(PF00356) (PF13377)
479435.Kfla_4360(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6661(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6667(PF04542) (PF08281)
479435.Kfla_6593(PF13649)(ER)
479435.Kfla_5575(PF04542) (PF08281)
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479435.Kfla_5980(PF06441)
479435.Kfla_5672(PF09861)
479435.Kfla_0910(PF04542)
479435.Kfla_6370(PF05977)
479435.Kfla_3937(PF08241)
479435.Kfla_3933(PF01872)
479435.Kfla_3584(PF13649)
479435.Kfla_0097(PF13302)
479435.Kfla_3320(PF01636)
479435.Kfla_4447(PF04542)
479435.Kfla_4110(PF00583)
479435.Kfla_4119(PF00583)
479435.Kfla_0746(PF03704)
479435.Kfla_0215(PF01636)
479435.Kfla_3133(PF08241)
479435.Kfla_4870(PF00480)
479435.Kfla_4307(PF00480)
479435.Kfla_5652(PF13649)
479435.Kfla_1082(PF01636)
479435.Kfla_1089(PF00583)
479435.Kfla_0970(PF00583)
479435.Kfla_1885(PF01636)
479435.Kfla_6350(PF01636)
479435.Kfla_3951(PF03372)
479435.Kfla_3100(PF08241)
479435.Kfla_6530(PF00480)
479435.Kfla_6828(PF00583)
479435.Kfla_4440(PF00480)
479435.Kfla_5220(PF04542)
479435.Kfla_2943(PF01636)
479435.Kfla_1148(PF06441)
479435.Kfla_1143(PF01872)
479435.Kfla_1144(PF08327)
479435.Kfla_3159(PF01872)
479435.Kfla_3970(PF16912)
479435.Kfla_7052(PF00583)
479435.Kfla_2368(PF05721)
479435.Kfla_2961(PF00583)
479435.Kfla_2969(PF00583)
479435.Kfla_1436(PF08241)
479435.Kfla_2777(PF13302)
479435.Kfla_2512(PF04542)
479435.Kfla_2705(PF00480)
479435.Kfla_3657(PF05721)
479435.Kfla_3998(PF00583)
479435.Kfla_3997(PF08327)
479435.Kfla_0420(PF08327)
479435.Kfla_6319(PF00583)
479435.Kfla_2348(PF08241)
479435.Kfla_3433(PF03704)
479435.Kfla_5776(PF00583)
479435.Kfla_5770(PF01636)
479435.Kfla_0852(PF04542)
479435.Kfla_1105(PF01636)
479435.Kfla_1109(PF04862)
479435.Kfla_6456(PF13649)
479435.Kfla_6103PF00416
479435.Kfla_5909(PF13563)
479435.Kfla_4368(PF08031)
479435.Kfla_0446(PF01636)
479435.Kfla_2442(PF08281)
479435.Kfla_6597(PF00583)
479435.Kfla_2107(PF03704)
479435.Kfla_2108(PF13302)
479435.Kfla_4623(PF01872)
479435.Kfla_4999(PF03795)
479435.Kfla_5717(PF13649)
479435.Kfla_0294(PF13302)
479435.Kfla_0872(PF13649)
479435.Kfla_1471(PF01872)
479435.Kfla_5963(PF01872)
479435.Kfla_5962(PF08327)
479435.Kfla_4380(PF00583)
479435.Kfla_5382(PF00583)
479435.Kfla_5389(PF01229)
479435.Kfla_0603(PF13649)
479435.Kfla_2128(PF05977)
479435.Kfla_5552(PF13649)
479435.Kfla_3478(PF00583)
479435.Kfla_6141(PF01872)
479435.Kfla_6415(PF00583)
479435.Kfla_6418(PF08241)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================