Effective results for Providencia alcalifaciens DSM 30120 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 724
- Predicted by EffectiveT3: 186 (high confidence), 270 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 36 within, 37 before, 41 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 154
- Predicted by EffectiveELD: 12 eukaryotic-like domains, contained in 65 proteins (1 high, 64 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
520999.PROVALCAL_01333+(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_01139+(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_01624+(PF00345)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_00359(<)(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_02682+(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00214++(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01432+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_00422(>)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02843+(ER); ER
520999.PROVALCAL_01896+(mitochondrial); mitochondrial
520999.PROVALCAL_00209(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_00208(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00207(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00204(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_02020+ER
520999.PROVALCAL_01322(PF00345)(ER)
520999.PROVALCAL_01329(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_03776+ER
520999.PROVALCAL_03774(PF00577)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03773(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_01934(<)ER
520999.PROVALCAL_02942(PF03222)(ER)
520999.PROVALCAL_01331(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_01332(PF00345)mitochondrial
520999.PROVALCAL_00306+mitochondrial; (mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02784+ER
520999.PROVALCAL_01321(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_01560+ER
520999.PROVALCAL_00403+ER
520999.PROVALCAL_03229+(ER)
520999.PROVALCAL_01687(PF07678)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_00622+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01669+ER
520999.PROVALCAL_03198+ER
520999.PROVALCAL_02814+(ER)
520999.PROVALCAL_02815+ER
520999.PROVALCAL_02701(<)ER
520999.PROVALCAL_03987(>)ER
520999.PROVALCAL_01053+ER
520999.PROVALCAL_03219(>)ER
520999.PROVALCAL_01276+(mitochondrial); (ER)
520999.PROVALCAL_00426(<)(mitochondrial); mitochondrial
520999.PROVALCAL_02111(PF03222)(ER)
520999.PROVALCAL_03423+ER
520999.PROVALCAL_03641(>)(ER)
520999.PROVALCAL_03552(>)ER
520999.PROVALCAL_01311+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01625(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_03086+ER
520999.PROVALCAL_01093+ER
520999.PROVALCAL_00479(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00474(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00270(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_00490++(PF00577)not used
520999.PROVALCAL_02223(<)(ER)
520999.PROVALCAL_02431+ER
520999.PROVALCAL_02847+ER
520999.PROVALCAL_03385(PF03222)ER
520999.PROVALCAL_02935(<)mitochondrial
520999.PROVALCAL_03347+ER
520999.PROVALCAL_01837+ER
520999.PROVALCAL_01836+ER
520999.PROVALCAL_01834(>)ER
520999.PROVALCAL_00265+ER
520999.PROVALCAL_00264(<)ER
520999.PROVALCAL_01606+ER
520999.PROVALCAL_01608(>)ER
520999.PROVALCAL_02645(>)ER
520999.PROVALCAL_03114(+)+ER
520999.PROVALCAL_00001(PF00577)(ER)
520999.PROVALCAL_00003(PF00345)mitochondrial
520999.PROVALCAL_00007(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00253+ER
520999.PROVALCAL_02415+(ER)
520999.PROVALCAL_03103(<)(ER); ER
520999.PROVALCAL_03599+ER
520999.PROVALCAL_03294(>)mitochondrial; (mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03689(>)ER
520999.PROVALCAL_01343+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03825(<)ER; (ER)
520999.PROVALCAL_00934+ER
520999.PROVALCAL_03139(>)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02982+mitochondrial
520999.PROVALCAL_00765+(>)plastid
520999.PROVALCAL_02017(<)ER
520999.PROVALCAL_02699(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_02690(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_00598+ER
520999.PROVALCAL_02999+ER
520999.PROVALCAL_03805+ER; (ER)
520999.PROVALCAL_00358+ER
520999.PROVALCAL_00357+ER
520999.PROVALCAL_00353(<)ER
520999.PROVALCAL_03527+ER
520999.PROVALCAL_03466(>)(ER); ER
520999.PROVALCAL_02691+ER
520999.PROVALCAL_00772+ER
520999.PROVALCAL_02683(PF00577)ER; (ER)
520999.PROVALCAL_01796+ER
520999.PROVALCAL_01797(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_03331(<)ER
520999.PROVALCAL_00914(>)ER; (ER)
520999.PROVALCAL_02852(<)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01313+ER
520999.PROVALCAL_02214+ER
520999.PROVALCAL_03815+ER
520999.PROVALCAL_00360(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_00365(PF00345)ER
520999.PROVALCAL_02212(PF00345)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02211(PF00577)ER
520999.PROVALCAL_02215+ER
520999.PROVALCAL_01094+ER
520999.PROVALCAL_02149(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01433+(ER)
520999.PROVALCAL_00961(+)(ER); (plastid)
520999.PROVALCAL_00838+(plastid)
520999.PROVALCAL_03492+(ER)
520999.PROVALCAL_01140(+)(PF00577)(ER)
520999.PROVALCAL_01453(+)+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03764(PF00102)plastid
520999.PROVALCAL_01390(>)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_00401+(plastid)
520999.PROVALCAL_00536(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02032+plastid
520999.PROVALCAL_01595+(PF00577)not used
520999.PROVALCAL_01667+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02562(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02096++
520999.PROVALCAL_03741(<)+
520999.PROVALCAL_00330+(plastid)
520999.PROVALCAL_02770++
520999.PROVALCAL_02577+(ER)
520999.PROVALCAL_00607(<)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_00454(+)ER
520999.PROVALCAL_00709(>)+
520999.PROVALCAL_00442+(plastid)
520999.PROVALCAL_01006++
520999.PROVALCAL_00660++
520999.PROVALCAL_00714(+)mitochondrial
520999.PROVALCAL_00718+(PF03222)
520999.PROVALCAL_00478+(PF00577)
520999.PROVALCAL_00494+plastid
520999.PROVALCAL_00726+(<)
520999.PROVALCAL_00013(<)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01733+(ER)
520999.PROVALCAL_02240+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03115+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02958+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01288+(PF03222)
520999.PROVALCAL_03857+(>)
520999.PROVALCAL_01727+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02256+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02418+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03618(+)ER
520999.PROVALCAL_00927+plastid
520999.PROVALCAL_00034+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03044(<)+
520999.PROVALCAL_02612+(>)
520999.PROVALCAL_03047(+)(ER)
520999.PROVALCAL_02874+(PF01129)
520999.PROVALCAL_00982+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03834+(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_00568+plastid
520999.PROVALCAL_03129+(ER)
520999.PROVALCAL_00369(+)(mitochondrial); mitochondrial
520999.PROVALCAL_02183(+)(ER)
520999.PROVALCAL_02689(PF00345)(ER)
520999.PROVALCAL_00532+plastid
520999.PROVALCAL_01315(PF10571)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02825(+)(mitochondrial); (plastid)
520999.PROVALCAL_03573+plastid
520999.PROVALCAL_01788+
520999.PROVALCAL_03320+
520999.PROVALCAL_02148+not used
520999.PROVALCAL_03904+
520999.PROVALCAL_03145(+)(>)
520999.PROVALCAL_04068+
520999.PROVALCAL_02849+
520999.PROVALCAL_00200+
520999.PROVALCAL_03430(<)
520999.PROVALCAL_01231+
520999.PROVALCAL_01233(<)not used
520999.PROVALCAL_02009+
520999.PROVALCAL_03244+
520999.PROVALCAL_00555(+)+
520999.PROVALCAL_00552+
520999.PROVALCAL_03633+
520999.PROVALCAL_03000(PF00577)
520999.PROVALCAL_03001(PF00345)
520999.PROVALCAL_01445+
520999.PROVALCAL_03174+not used
520999.PROVALCAL_03177+
520999.PROVALCAL_03172+not used
520999.PROVALCAL_03178(PF05257)not used
520999.PROVALCAL_00930+
520999.PROVALCAL_00151(>)
520999.PROVALCAL_01189+not used
520999.PROVALCAL_01188(<)
520999.PROVALCAL_02943+
520999.PROVALCAL_00302+not used
520999.PROVALCAL_00309+
520999.PROVALCAL_01149+
520999.PROVALCAL_02304+
520999.PROVALCAL_02305+
520999.PROVALCAL_00520+
520999.PROVALCAL_02787+
520999.PROVALCAL_02788+
520999.PROVALCAL_00636+
520999.PROVALCAL_00639(PF04383)
520999.PROVALCAL_03303+not used
520999.PROVALCAL_03762+
520999.PROVALCAL_03582+
520999.PROVALCAL_04082+
520999.PROVALCAL_00094+
520999.PROVALCAL_01852(+)(plastid)
520999.PROVALCAL_03977+
520999.PROVALCAL_03972(PF05257)
520999.PROVALCAL_03458(>)
520999.PROVALCAL_03456+
520999.PROVALCAL_01212+
520999.PROVALCAL_01130+
520999.PROVALCAL_01137+
520999.PROVALCAL_01134+
520999.PROVALCAL_03990+
520999.PROVALCAL_03998+
520999.PROVALCAL_01684+
520999.PROVALCAL_01680+
520999.PROVALCAL_02792+
520999.PROVALCAL_02000+
520999.PROVALCAL_03574+
520999.PROVALCAL_03577+
520999.PROVALCAL_02317+
520999.PROVALCAL_01460+
520999.PROVALCAL_01461+
520999.PROVALCAL_03750+
520999.PROVALCAL_03196(>)
520999.PROVALCAL_00955+
520999.PROVALCAL_00954+
520999.PROVALCAL_03894+
520999.PROVALCAL_02969+
520999.PROVALCAL_02964(+)(PF00577)
520999.PROVALCAL_02966(PF00345)
520999.PROVALCAL_02224+
520999.PROVALCAL_00328+
520999.PROVALCAL_00329+
520999.PROVALCAL_00326+
520999.PROVALCAL_02894(>)
520999.PROVALCAL_01261(>)
520999.PROVALCAL_01266(<)
520999.PROVALCAL_01127(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01126+
520999.PROVALCAL_02411+
520999.PROVALCAL_00437+
520999.PROVALCAL_01698(>)
520999.PROVALCAL_01690+
520999.PROVALCAL_00506+
520999.PROVALCAL_01052+
520999.PROVALCAL_02768+
520999.PROVALCAL_02769+
520999.PROVALCAL_02560+
520999.PROVALCAL_00618+not used
520999.PROVALCAL_03607+
520999.PROVALCAL_02102+
520999.PROVALCAL_03361(+)(ER); not used
520999.PROVALCAL_03364+
520999.PROVALCAL_01676+
520999.PROVALCAL_01470(>)
520999.PROVALCAL_03746(>)
520999.PROVALCAL_03696+
520999.PROVALCAL_02804(<)
520999.PROVALCAL_01906(>)
520999.PROVALCAL_03078+
520999.PROVALCAL_01875+
520999.PROVALCAL_01871+
520999.PROVALCAL_01870+
520999.PROVALCAL_00057+
520999.PROVALCAL_00337+
520999.PROVALCAL_01278+
520999.PROVALCAL_01273+not used
520999.PROVALCAL_01274+
520999.PROVALCAL_01508+
520999.PROVALCAL_01507(>)
520999.PROVALCAL_04057+
520999.PROVALCAL_01060+
520999.PROVALCAL_02771+
520999.PROVALCAL_02772(PF07720)
520999.PROVALCAL_02579(PF04383)
520999.PROVALCAL_00605+
520999.PROVALCAL_02710+
520999.PROVALCAL_02112(PF03222)
520999.PROVALCAL_02116(+)(plastid)
520999.PROVALCAL_01462+
520999.PROVALCAL_03510+not used
520999.PROVALCAL_01644+
520999.PROVALCAL_01648+
520999.PROVALCAL_01484+
520999.PROVALCAL_01480+
520999.PROVALCAL_02607+
520999.PROVALCAL_03734+
520999.PROVALCAL_02591+
520999.PROVALCAL_00996(<)
520999.PROVALCAL_00990(>)
520999.PROVALCAL_03590+
520999.PROVALCAL_01809(>)
520999.PROVALCAL_01801(>)
520999.PROVALCAL_02444+
520999.PROVALCAL_01245+
520999.PROVALCAL_01103+
520999.PROVALCAL_01102+
520999.PROVALCAL_01107+
520999.PROVALCAL_01105+
520999.PROVALCAL_00292+
520999.PROVALCAL_01922+
520999.PROVALCAL_02120+
520999.PROVALCAL_02121+
520999.PROVALCAL_03436(>)
520999.PROVALCAL_02636+
520999.PROVALCAL_02637+
520999.PROVALCAL_03724+
520999.PROVALCAL_01183(+)(plastid)
520999.PROVALCAL_02914+
520999.PROVALCAL_01182+
520999.PROVALCAL_04008+
520999.PROVALCAL_01812(<)not used
520999.PROVALCAL_00070+
520999.PROVALCAL_00071(>)
520999.PROVALCAL_00440+
520999.PROVALCAL_03861+
520999.PROVALCAL_00680+
520999.PROVALCAL_03869+
520999.PROVALCAL_02752+
520999.PROVALCAL_04025+not used
520999.PROVALCAL_02354(<)
520999.PROVALCAL_01719+
520999.PROVALCAL_01862(+)+
520999.PROVALCAL_03409+
520999.PROVALCAL_02134+
520999.PROVALCAL_02629+
520999.PROVALCAL_03663(+)+
520999.PROVALCAL_03666(+)(<)
520999.PROVALCAL_03393+
520999.PROVALCAL_01824+
520999.PROVALCAL_00065+
520999.PROVALCAL_03890+
520999.PROVALCAL_02461+
520999.PROVALCAL_00276+
520999.PROVALCAL_01010+
520999.PROVALCAL_03879(PF03222)
520999.PROVALCAL_02346+
520999.PROVALCAL_02341(+)(>)
520999.PROVALCAL_02722(+)+
520999.PROVALCAL_02726+
520999.PROVALCAL_02725+
520999.PROVALCAL_00675+
520999.PROVALCAL_01706+
520999.PROVALCAL_02437+
520999.PROVALCAL_03701(>)
520999.PROVALCAL_03706(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_03414+
520999.PROVALCAL_02511(PF00707)
520999.PROVALCAL_02040+not used
520999.PROVALCAL_03382+
520999.PROVALCAL_02933(<)
520999.PROVALCAL_03248(<)
520999.PROVALCAL_03249+
520999.PROVALCAL_01833+
520999.PROVALCAL_01831+
520999.PROVALCAL_04006(+)+
520999.PROVALCAL_00015+
520999.PROVALCAL_03256+
520999.PROVALCAL_00120+
520999.PROVALCAL_00269(PF00345)
520999.PROVALCAL_03721+
520999.PROVALCAL_02735+
520999.PROVALCAL_01085+
520999.PROVALCAL_00484+
520999.PROVALCAL_01738+
520999.PROVALCAL_01731(>)
520999.PROVALCAL_02399(>)
520999.PROVALCAL_01601+
520999.PROVALCAL_03238+
520999.PROVALCAL_02648+
520999.PROVALCAL_02640+
520999.PROVALCAL_04002+
520999.PROVALCAL_03606+
520999.PROVALCAL_03604+
520999.PROVALCAL_03944+
520999.PROVALCAL_02715+
520999.PROVALCAL_03113+
520999.PROVALCAL_03119(>)
520999.PROVALCAL_03287+
520999.PROVALCAL_00218+
520999.PROVALCAL_01643+
520999.PROVALCAL_00008(>)not used
520999.PROVALCAL_02891+
520999.PROVALCAL_00002(PF00345)
520999.PROVALCAL_00004+
520999.PROVALCAL_01282+
520999.PROVALCAL_03221+
520999.PROVALCAL_01350+
520999.PROVALCAL_03850+
520999.PROVALCAL_03718+
520999.PROVALCAL_01393(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_02254(+)plastid
520999.PROVALCAL_01220+
520999.PROVALCAL_01483(+)(plastid)
520999.PROVALCAL_00745+
520999.PROVALCAL_03271+
520999.PROVALCAL_02886+
520999.PROVALCAL_04026+
520999.PROVALCAL_02668+
520999.PROVALCAL_02859+
520999.PROVALCAL_03914+
520999.PROVALCAL_01349+
520999.PROVALCAL_03216+
520999.PROVALCAL_03821+
520999.PROVALCAL_03824+
520999.PROVALCAL_03841+
520999.PROVALCAL_02244(+)+
520999.PROVALCAL_02059(+)(<)
520999.PROVALCAL_01194(<)
520999.PROVALCAL_02409+
520999.PROVALCAL_00758+
520999.PROVALCAL_00752+
520999.PROVALCAL_02066+
520999.PROVALCAL_03046+
520999.PROVALCAL_03448(+)+
520999.PROVALCAL_01573(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01408+not used
520999.PROVALCAL_00023+
520999.PROVALCAL_02871(PF05257)
520999.PROVALCAL_01489+
520999.PROVALCAL_00117+
520999.PROVALCAL_03832(<)
520999.PROVALCAL_03835+not used
520999.PROVALCAL_03836+
520999.PROVALCAL_00346+
520999.PROVALCAL_00344+
520999.PROVALCAL_01741+
520999.PROVALCAL_03205+
520999.PROVALCAL_00690+
520999.PROVALCAL_00696+not used
520999.PROVALCAL_00566+
520999.PROVALCAL_00567+
520999.PROVALCAL_02543+
520999.PROVALCAL_02051+
520999.PROVALCAL_02544+
520999.PROVALCAL_02503+
520999.PROVALCAL_02698(PF00345)
520999.PROVALCAL_01562+
520999.PROVALCAL_00371+
520999.PROVALCAL_03630+
520999.PROVALCAL_03635(<)
520999.PROVALCAL_00907+
520999.PROVALCAL_01411+not used
520999.PROVALCAL_04048+
520999.PROVALCAL_01968(+)(<)
520999.PROVALCAL_00164+
520999.PROVALCAL_00221+
520999.PROVALCAL_01221+
520999.PROVALCAL_03795+
520999.PROVALCAL_01366+
520999.PROVALCAL_04066+not used
520999.PROVALCAL_00681+
520999.PROVALCAL_01511(<)
520999.PROVALCAL_01770+not used
520999.PROVALCAL_01773+
520999.PROVALCAL_01172(+)+
520999.PROVALCAL_01170+
520999.PROVALCAL_02464+
520999.PROVALCAL_01082+
520999.PROVALCAL_00579+
520999.PROVALCAL_02268+
520999.PROVALCAL_00771(PF05257)
520999.PROVALCAL_02518(+)PF00620
520999.PROVALCAL_02512(PF00707)
520999.PROVALCAL_01799+
520999.PROVALCAL_03484(<)
520999.PROVALCAL_03445+
520999.PROVALCAL_01421+
520999.PROVALCAL_01424(+)(mitochondrial)
520999.PROVALCAL_01426(+)(<)
520999.PROVALCAL_00820+
520999.PROVALCAL_03150(>)
520999.PROVALCAL_00918+
520999.PROVALCAL_02855+
520999.PROVALCAL_00829+
520999.PROVALCAL_03926+
520999.PROVALCAL_01317+
520999.PROVALCAL_00545+
520999.PROVALCAL_00364(PF00577)
520999.PROVALCAL_04085+
520999.PROVALCAL_01165+
520999.PROVALCAL_02329+
520999.PROVALCAL_00788+
520999.PROVALCAL_02528(+)
520999.PROVALCAL_02520(+)
520999.PROVALCAL_00228(+)
520999.PROVALCAL_02146(+)
520999.PROVALCAL_03408(+)
520999.PROVALCAL_04063(+)
520999.PROVALCAL_04069(+)not used
520999.PROVALCAL_01944(+)
520999.PROVALCAL_03431(+)
520999.PROVALCAL_03955(+)
520999.PROVALCAL_02259(+)
520999.PROVALCAL_00375(+)
520999.PROVALCAL_01236(+)
520999.PROVALCAL_03494(+)
520999.PROVALCAL_02338(+)
520999.PROVALCAL_02207(+)
520999.PROVALCAL_02153(+)
520999.PROVALCAL_03313(+)
520999.PROVALCAL_01859(+)
520999.PROVALCAL_00970(+)
520999.PROVALCAL_00973(+)
520999.PROVALCAL_02832(+)
520999.PROVALCAL_03468(+)
520999.PROVALCAL_02410(+)
520999.PROVALCAL_01337(+)
520999.PROVALCAL_01338(+)
520999.PROVALCAL_00529(+)
520999.PROVALCAL_02015(+)
520999.PROVALCAL_00634(+)
520999.PROVALCAL_00635(+)
520999.PROVALCAL_00631(+)
520999.PROVALCAL_02495(+)
520999.PROVALCAL_03760(+)
520999.PROVALCAL_03167(+)
520999.PROVALCAL_03164(+)
520999.PROVALCAL_00940(+)
520999.PROVALCAL_00095(+)
520999.PROVALCAL_01926(+)
520999.PROVALCAL_03979(+)
520999.PROVALCAL_03976(+)
520999.PROVALCAL_03971(+)
520999.PROVALCAL_01563(+)
520999.PROVALCAL_00318(+)not used
520999.PROVALCAL_00148(+)
520999.PROVALCAL_00533(+)
520999.PROVALCAL_02791(+)
520999.PROVALCAL_02559(+)
520999.PROVALCAL_01661(+)
520999.PROVALCAL_01468(+)
520999.PROVALCAL_03757(+)
520999.PROVALCAL_03685(+)
520999.PROVALCAL_00951(+)
520999.PROVALCAL_00320(+)
520999.PROVALCAL_03649(+)
520999.PROVALCAL_03982(+)
520999.PROVALCAL_02767(+)
520999.PROVALCAL_02364(+)
520999.PROVALCAL_02108(+)
520999.PROVALCAL_02100(+)
520999.PROVALCAL_02314(+)
520999.PROVALCAL_03366(+)
520999.PROVALCAL_00620(+)not used
520999.PROVALCAL_03567(+)
520999.PROVALCAL_02616(+)
520999.PROVALCAL_02615(+)
520999.PROVALCAL_02973(+)
520999.PROVALCAL_00181(+)not used
520999.PROVALCAL_01879(+)
520999.PROVALCAL_00050+
520999.PROVALCAL_00333(+)
520999.PROVALCAL_02397(+)
520999.PROVALCAL_03277(+)
520999.PROVALCAL_00427(+)
520999.PROVALCAL_02865(+)
520999.PROVALCAL_00663(+)
520999.PROVALCAL_01066(+)
520999.PROVALCAL_02778(+)
520999.PROVALCAL_02377(+)
520999.PROVALCAL_03425(+)
520999.PROVALCAL_00880(+)
520999.PROVALCAL_01486(+)not used
520999.PROVALCAL_03731(+)
520999.PROVALCAL_00995(+)
520999.PROVALCAL_00042(+)
520999.PROVALCAL_03596(+)
520999.PROVALCAL_00558(+)
520999.PROVALCAL_00452(+)
520999.PROVALCAL_00456(+)
520999.PROVALCAL_02555(+)
520999.PROVALCAL_00650(+)
520999.PROVALCAL_01076(+)
520999.PROVALCAL_02666(+)
520999.PROVALCAL_02740(+)
520999.PROVALCAL_00674(+)
520999.PROVALCAL_03349(+)
520999.PROVALCAL_00705(+)
520999.PROVALCAL_02639(+)
520999.PROVALCAL_03233(+)
520999.PROVALCAL_03232(+)
520999.PROVALCAL_00859(+)
520999.PROVALCAL_00850(+)
520999.PROVALCAL_00391(+)
520999.PROVALCAL_02913(+)
520999.PROVALCAL_02918(+)
520999.PROVALCAL_01816(+)
520999.PROVALCAL_01255(+)
520999.PROVALCAL_03885(+)
520999.PROVALCAL_00447(+)
520999.PROVALCAL_00282(+)
520999.PROVALCAL_02757(+)
520999.PROVALCAL_02754(+)
520999.PROVALCAL_00688(+)
520999.PROVALCAL_01717(+)
520999.PROVALCAL_03791(+)
520999.PROVALCAL_03539(+)
520999.PROVALCAL_03080(+)
520999.PROVALCAL_03083(+)
520999.PROVALCAL_03245(+)
520999.PROVALCAL_02929(+)
520999.PROVALCAL_01171(+)
520999.PROVALCAL_01084(+)
520999.PROVALCAL_00470(+)
520999.PROVALCAL_00472(+)
520999.PROVALCAL_00576(+)
520999.PROVALCAL_00571(+)
520999.PROVALCAL_00653(+)
520999.PROVALCAL_01704(+)
520999.PROVALCAL_02434(+)
520999.PROVALCAL_01633(+)
520999.PROVALCAL_02658(+)
520999.PROVALCAL_03700(+)
520999.PROVALCAL_03259(+)
520999.PROVALCAL_00873(+)
520999.PROVALCAL_01522(+)
520999.PROVALCAL_03419(+)not used
520999.PROVALCAL_02729(+)
520999.PROVALCAL_03675(+)
520999.PROVALCAL_03438(+)
520999.PROVALCAL_00704(+)
520999.PROVALCAL_02510(+)
520999.PROVALCAL_00128(+)
520999.PROVALCAL_00464(+)
520999.PROVALCAL_02738(+)
520999.PROVALCAL_01739(+)
520999.PROVALCAL_00019(+)
520999.PROVALCAL_01609(+)
520999.PROVALCAL_03066(+)
520999.PROVALCAL_00574(+)
520999.PROVALCAL_03260(+)
520999.PROVALCAL_03261(+)
520999.PROVALCAL_01515(+)
520999.PROVALCAL_01516(+)
520999.PROVALCAL_01517(+)
520999.PROVALCAL_01518(+)
520999.PROVALCAL_03603(+)
520999.PROVALCAL_03605(+)
520999.PROVALCAL_00866(+)
520999.PROVALCAL_03230(+)
520999.PROVALCAL_00549(+)
520999.PROVALCAL_03288(+)
520999.PROVALCAL_00009(+)not used
520999.PROVALCAL_02890(+)
520999.PROVALCAL_00500(+)
520999.PROVALCAL_02898(+)
520999.PROVALCAL_01289(+)
520999.PROVALCAL_00254(+)
520999.PROVALCAL_00255(+)
520999.PROVALCAL_01726(+)
520999.PROVALCAL_02708(+)
520999.PROVALCAL_02417(+)
520999.PROVALCAL_01614(+)
520999.PROVALCAL_02075(+)
520999.PROVALCAL_03077(+)
520999.PROVALCAL_03611(+)
520999.PROVALCAL_03617(+)
520999.PROVALCAL_00923(+)
520999.PROVALCAL_03296(+)
520999.PROVALCAL_00036(+)
520999.PROVALCAL_04028(+)
520999.PROVALCAL_01299(+)
520999.PROVALCAL_03827(+)
520999.PROVALCAL_02716(+)
520999.PROVALCAL_02404(+)
520999.PROVALCAL_02064(+)
520999.PROVALCAL_01577(+)
520999.PROVALCAL_00933(+)
520999.PROVALCAL_02095(+)
520999.PROVALCAL_01993(+)
520999.PROVALCAL_01970(+)
520999.PROVALCAL_02097(+)
520999.PROVALCAL_00213(+)
520999.PROVALCAL_03208(+)
520999.PROVALCAL_00589(+)
520999.PROVALCAL_00585(+)
520999.PROVALCAL_00648(+)
520999.PROVALCAL_00347(+)
520999.PROVALCAL_02016(+)
520999.PROVALCAL_03015(+)
520999.PROVALCAL_00900(+)
520999.PROVALCAL_00903(+)
520999.PROVALCAL_00832(+)
520999.PROVALCAL_03457(+)
520999.PROVALCAL_01982(+)not used
520999.PROVALCAL_02868(+)
520999.PROVALCAL_04045(+)
520999.PROVALCAL_01969(+)
520999.PROVALCAL_00229(+)
520999.PROVALCAL_00591(+)
520999.PROVALCAL_00597(+)
520999.PROVALCAL_03804(+)
520999.PROVALCAL_01771(+)
520999.PROVALCAL_03338(+)
520999.PROVALCAL_03780(+)
520999.PROVALCAL_01083(+)
520999.PROVALCAL_00773(+)not used
520999.PROVALCAL_00776(+)
520999.PROVALCAL_03736(+)
520999.PROVALCAL_02684(+)
520999.PROVALCAL_01790(+)
520999.PROVALCAL_03487(+)
520999.PROVALCAL_00897(+)
520999.PROVALCAL_02850(+)
520999.PROVALCAL_02856(+)
520999.PROVALCAL_01882(+)
520999.PROVALCAL_00172(+)
520999.PROVALCAL_03923(+)
520999.PROVALCAL_03812(+)
520999.PROVALCAL_02450(+)
520999.PROVALCAL_00781(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 1.0 (10/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 0.875 (7/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================