Effective results for Burkholderia sp. CCGE1003 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 963
- Predicted by EffectiveT3: 344 (high confidence), 427 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 34 within, 8 before, 41 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 113
- Predicted by EffectiveELD: 18 eukaryotic-like domains, contained in 53 proteins (2 high, 51 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
640512.BC1003_1086+ER
640512.BC1003_5198(PF08546) (PF02558)(ER)
640512.BC1003_2728+(ER)
640512.BC1003_4894+(PF06779)(ER); (plastid)
640512.BC1003_1529++ER
640512.BC1003_6049(PF08546) (PF02558)ER
640512.BC1003_4290(PF08546) (PF02558)(ER)
640512.BC1003_4205(PF08546) (PF02558)ER
640512.BC1003_4964+ER
640512.BC1003_3585+ER
640512.BC1003_1982(PF15984)(mitochondrial)
640512.BC1003_4001(<)ER
640512.BC1003_3773+++
640512.BC1003_3803(PF11937)ER
640512.BC1003_3774+ER
640512.BC1003_2644+(ER)
640512.BC1003_4763+mitochondrial
640512.BC1003_1517+ER
640512.BC1003_5915+ER; (ER)
640512.BC1003_0179(<)(mitochondrial)
640512.BC1003_3500+(ER)
640512.BC1003_2909(>)ER
640512.BC1003_5689+(mitochondrial)
640512.BC1003_3192+(ER)
640512.BC1003_5276+(ER)
640512.BC1003_5890+ER
640512.BC1003_3520+ER
640512.BC1003_0786+mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_3032(>)(mitochondrial)
640512.BC1003_1050+(mitochondrial)
640512.BC1003_5757(>)(ER)
640512.BC1003_5778+ER
640512.BC1003_4161+ER
640512.BC1003_0641(+)(PF07519)ER
640512.BC1003_3625(PF11937)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_4288+ER
640512.BC1003_5734+ER; (ER)
640512.BC1003_1866+ER
640512.BC1003_4889+(PF06779)(ER)
640512.BC1003_0506+mitochondrial
640512.BC1003_5247+(mitochondrial)
640512.BC1003_4877(>)ER
640512.BC1003_0513(>)ER
640512.BC1003_3097+(ER)
640512.BC1003_3019+(mitochondrial)
640512.BC1003_3872+ER
640512.BC1003_4798+(ER); (mitochondrial)
640512.BC1003_2338+ER
640512.BC1003_2153(>)(ER)
640512.BC1003_3141+(mitochondrial)
640512.BC1003_4919+(mitochondrial)
640512.BC1003_2785+(mitochondrial)
640512.BC1003_3161+(ER)
640512.BC1003_1313+ER
640512.BC1003_4566+ER
640512.BC1003_3593(PF03659)(ER); ER
640512.BC1003_2356(>)ER
640512.BC1003_4548(>)mitochondrial
640512.BC1003_0745+mitochondrial
640512.BC1003_2406+ER
640512.BC1003_2407+(ER); (plastid)
640512.BC1003_1712+ER
640512.BC1003_4104+ER
640512.BC1003_5046+ER
640512.BC1003_5040(PF07519)(ER)
640512.BC1003_0987(PF14347)ER
640512.BC1003_3216+(mitochondrial)
640512.BC1003_0697(PF08546) (PF02558)(ER)
640512.BC1003_2959+ER
640512.BC1003_3494(>)(ER); (mitochondrial)
640512.BC1003_0761PF16994(mitochondrial)
640512.BC1003_3572+ER
640512.BC1003_2733+(mitochondrial); (plastid)
640512.BC1003_0484(>)ER
640512.BC1003_5395(PF06884)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_0802+mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_5550+(mitochondrial); (plastid)
640512.BC1003_1388+mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_4311(PF07519)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_3411+ER
640512.BC1003_4419+ER
640512.BC1003_4413(>)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_3477(>)mitochondrial
640512.BC1003_2121+ER
640512.BC1003_4640+(mitochondrial)
640512.BC1003_5782(PF01075)(ER)
640512.BC1003_0770(>)(mitochondrial)
640512.BC1003_0897+(mitochondrial); (plastid)
640512.BC1003_1143+ER; (ER)
640512.BC1003_0370+(mitochondrial)
640512.BC1003_5415+ER
640512.BC1003_0936+ER
640512.BC1003_4903(PF14347)ER
640512.BC1003_4902(PF14347)ER
640512.BC1003_3798+plastid
640512.BC1003_2980+plastid
640512.BC1003_4492(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0966(+)mitochondrial
640512.BC1003_0255+(mitochondrial)
640512.BC1003_2887+(plastid)
640512.BC1003_1065(+)(PF16155)(mitochondrial)
640512.BC1003_1876++
640512.BC1003_4863(+)(mitochondrial); (plastid)
640512.BC1003_0195+plastid
640512.BC1003_4309++
640512.BC1003_3198++
640512.BC1003_3992(+)ER; (ER)
640512.BC1003_1981+(PF15984)
640512.BC1003_1599++
640512.BC1003_4328(PF04324)(mitochondrial)
640512.BC1003_5839(+)(mitochondrial); (plastid)
640512.BC1003_6066(<)(mitochondrial); not used
640512.BC1003_3955+(plastid)
640512.BC1003_5509+(plastid)
640512.BC1003_1880(+)ER
640512.BC1003_1083(+)(ER); (plastid)
640512.BC1003_1629(PF08546) (PF02558)
640512.BC1003_4543(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0066+(mitochondrial)
640512.BC1003_5177+(mitochondrial)
640512.BC1003_5486(+)(PF07519)(ER)
640512.BC1003_2773(+)mitochondrial; (plastid)
640512.BC1003_3644(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_3662++
640512.BC1003_5443+(>)
640512.BC1003_1568+(ER)
640512.BC1003_0888+(plastid)
640512.BC1003_5016(+)+(mitochondrial)
640512.BC1003_1549(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_3449(<)+
640512.BC1003_2313(+)(ER)
640512.BC1003_3390+(plastid)
640512.BC1003_2177(+)(ER)
640512.BC1003_2780(+)(ER)
640512.BC1003_5344(+)(mitochondrial); plastid
640512.BC1003_6087+ER
640512.BC1003_5420+(ER)
640512.BC1003_3747(PF08546) (PF02558)
640512.BC1003_1292+(plastid)
640512.BC1003_3355++
640512.BC1003_3720+(ER)
640512.BC1003_4105(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_4996(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_5870(+)ER
640512.BC1003_0022+(plastid)
640512.BC1003_5659(+)mitochondrial
640512.BC1003_1045(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_3986+(mitochondrial)
640512.BC1003_2635(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_1236+(plastid)
640512.BC1003_2778+(PF13436)
640512.BC1003_1002+(PF01075)
640512.BC1003_3235(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_1639(>)(plastid)
640512.BC1003_1354(PF04324)(ER)
640512.BC1003_5186(+)ER
640512.BC1003_0696(+)ER; (ER)
640512.BC1003_2225(+)ER; (ER)
640512.BC1003_0237(+)ER; (ER)
640512.BC1003_3904++
640512.BC1003_5592(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_3334+plastid
640512.BC1003_1448+(mitochondrial)
640512.BC1003_1879PF04916 PF15508
640512.BC1003_1657+(plastid)
640512.BC1003_2269+(mitochondrial)
640512.BC1003_2846+plastid
640512.BC1003_1462+(mitochondrial)
640512.BC1003_1819+(plastid)
640512.BC1003_0679+(plastid)
640512.BC1003_5820+plastid
640512.BC1003_2108(PF08546) (PF02558)
640512.BC1003_4080(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640512.BC1003_2829+(plastid)
640512.BC1003_2821(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0773+(ER)
640512.BC1003_4925+(PF15984)
640512.BC1003_1554++
640512.BC1003_2274+(mitochondrial)
640512.BC1003_2744(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_2160(+)(ER)
640512.BC1003_5336+(plastid)
640512.BC1003_3389+(plastid)
640512.BC1003_1847+
640512.BC1003_3790+
640512.BC1003_3799+
640512.BC1003_5431+
640512.BC1003_4219(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0912+
640512.BC1003_0915+
640512.BC1003_0917+
640512.BC1003_0666(+)(ER)
640512.BC1003_4965+not used
640512.BC1003_3366(+)+
640512.BC1003_3588(+)(plastid)
640512.BC1003_2365+
640512.BC1003_2367+
640512.BC1003_2982+
640512.BC1003_1328(>)
640512.BC1003_4008+
640512.BC1003_4552+
640512.BC1003_1185+
640512.BC1003_0279+
640512.BC1003_0278+
640512.BC1003_5972+
640512.BC1003_5975+
640512.BC1003_1906+
640512.BC1003_5680(+)ER; not used
640512.BC1003_3772+
640512.BC1003_6093+
640512.BC1003_6092+
640512.BC1003_5203+
640512.BC1003_5202(PF04324)
640512.BC1003_2642+
640512.BC1003_5019+
640512.BC1003_3791+
640512.BC1003_0649+
640512.BC1003_3348+
640512.BC1003_3342+
640512.BC1003_3343+
640512.BC1003_3344+
640512.BC1003_2436(PF06779)
640512.BC1003_5370+
640512.BC1003_4539+
640512.BC1003_4024+not used
640512.BC1003_4021+
640512.BC1003_0074+
640512.BC1003_5953+
640512.BC1003_3758+
640512.BC1003_2662+
640512.BC1003_5611+
640512.BC1003_5615(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0625+
640512.BC1003_0622+
640512.BC1003_3433+
640512.BC1003_3922+
640512.BC1003_0048+
640512.BC1003_2415+
640512.BC1003_4043+
640512.BC1003_2256(PF04324)
640512.BC1003_5939+
640512.BC1003_3737+
640512.BC1003_4189+
640512.BC1003_5736+
640512.BC1003_2290+
640512.BC1003_0316+
640512.BC1003_0705(>)
640512.BC1003_5917(+)(plastid)
640512.BC1003_5911+
640512.BC1003_2048(+)(plastid)
640512.BC1003_2044+
640512.BC1003_2595+
640512.BC1003_2621+
640512.BC1003_2625+
640512.BC1003_2627+
640512.BC1003_0194+
640512.BC1003_5071+
640512.BC1003_4301+
640512.BC1003_3507+
640512.BC1003_5685+
640512.BC1003_2964+
640512.BC1003_3262+
640512.BC1003_3190+
640512.BC1003_1051+
640512.BC1003_3994+
640512.BC1003_3991(PF09130)
640512.BC1003_1222+
640512.BC1003_0174+
640512.BC1003_5091+
640512.BC1003_0319+
640512.BC1003_3930+
640512.BC1003_3036+
640512.BC1003_1966+
640512.BC1003_2942+
640512.BC1003_1784+
640512.BC1003_3207+
640512.BC1003_4957(+)(ER)
640512.BC1003_2003+
640512.BC1003_1204+
640512.BC1003_5524+
640512.BC1003_1394+
640512.BC1003_4346+
640512.BC1003_0840+
640512.BC1003_3033+
640512.BC1003_1647+
640512.BC1003_1132+
640512.BC1003_3016+
640512.BC1003_1134+
640512.BC1003_1941(+)(plastid)
640512.BC1003_2944+
640512.BC1003_5751(+)(plastid)
640512.BC1003_5755+
640512.BC1003_1414(+)+
640512.BC1003_0450(>)
640512.BC1003_0453+
640512.BC1003_3489+
640512.BC1003_2681+
640512.BC1003_3806+
640512.BC1003_0136+
640512.BC1003_0131(+)(plastid)
640512.BC1003_0138+
640512.BC1003_4365(>)
640512.BC1003_1309(>)
640512.BC1003_3566+
640512.BC1003_5194+
640512.BC1003_5193(>)
640512.BC1003_2424+
640512.BC1003_4352+
640512.BC1003_3976+
640512.BC1003_3608+
640512.BC1003_5364(+)(plastid)
640512.BC1003_0803(PF01075)
640512.BC1003_2727+
640512.BC1003_5717(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0495+
640512.BC1003_2539+
640512.BC1003_0643(+)(plastid)
640512.BC1003_3916+
640512.BC1003_2392(PF01075)
640512.BC1003_3621+
640512.BC1003_5813+
640512.BC1003_4148+
640512.BC1003_4142(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0396+
640512.BC1003_2553+
640512.BC1003_5480+
640512.BC1003_2255+
640512.BC1003_2870+
640512.BC1003_5731+
640512.BC1003_2952(PF01075)
640512.BC1003_1206+
640512.BC1003_3646+
640512.BC1003_0503+
640512.BC1003_3295(>)
640512.BC1003_2115+
640512.BC1003_4615+
640512.BC1003_4618+
640512.BC1003_4690(+)(plastid)
640512.BC1003_0512+
640512.BC1003_5096+
640512.BC1003_3098+
640512.BC1003_3898+
640512.BC1003_2342+
640512.BC1003_2859+
640512.BC1003_4265+
640512.BC1003_4405+
640512.BC1003_1801+
640512.BC1003_1802+
640512.BC1003_5961(<)
640512.BC1003_3665(>)
640512.BC1003_3663+
640512.BC1003_4677+
640512.BC1003_4679+
640512.BC1003_1074+
640512.BC1003_5006+
640512.BC1003_4533+
640512.BC1003_3878+
640512.BC1003_3874+
640512.BC1003_2834+
640512.BC1003_4799+
640512.BC1003_1560+
640512.BC1003_0742+
640512.BC1003_4429+
640512.BC1003_2556+
640512.BC1003_4938+
640512.BC1003_1820+
640512.BC1003_3684+
640512.BC1003_3687+
640512.BC1003_2339+
640512.BC1003_5308+
640512.BC1003_1355+
640512.BC1003_2156+
640512.BC1003_1173+
640512.BC1003_3948+
640512.BC1003_3949(PF09130)
640512.BC1003_0087+
640512.BC1003_3856+
640512.BC1003_3352(+)(plastid)
640512.BC1003_2813+
640512.BC1003_2819+
640512.BC1003_5795+
640512.BC1003_5799+
640512.BC1003_4220+
640512.BC1003_1542+
640512.BC1003_5670+
640512.BC1003_4913+
640512.BC1003_3331+
640512.BC1003_2318(>)
640512.BC1003_2317(>)
640512.BC1003_1377+
640512.BC1003_5243+
640512.BC1003_0203+
640512.BC1003_2784(+)(ER)
640512.BC1003_3784(<)
640512.BC1003_3166+
640512.BC1003_5401+
640512.BC1003_0323+
640512.BC1003_4061(PF01075)
640512.BC1003_2190+
640512.BC1003_5968+
640512.BC1003_3812+
640512.BC1003_6080+
640512.BC1003_5427+
640512.BC1003_5424+
640512.BC1003_5283+
640512.BC1003_4033+
640512.BC1003_0909(PF01075)
640512.BC1003_5115+
640512.BC1003_3372+
640512.BC1003_0954+
640512.BC1003_3590+
640512.BC1003_2423+
640512.BC1003_4794+
640512.BC1003_0951+
640512.BC1003_4793+
640512.BC1003_1994+
640512.BC1003_1190+
640512.BC1003_1197+
640512.BC1003_1196+
640512.BC1003_5947+
640512.BC1003_0244+
640512.BC1003_0249+
640512.BC1003_6053+
640512.BC1003_1166(+)(>)
640512.BC1003_3296+
640512.BC1003_3740(>)
640512.BC1003_3123+
640512.BC1003_3126+
640512.BC1003_5001+
640512.BC1003_1072+
640512.BC1003_3351+
640512.BC1003_3350+
640512.BC1003_1883+
640512.BC1003_0006(+)+
640512.BC1003_4030+
640512.BC1003_0003+
640512.BC1003_0008+
640512.BC1003_1714+
640512.BC1003_3725+
640512.BC1003_2090+
640512.BC1003_2679(+)(plastid)
640512.BC1003_2898+
640512.BC1003_2676+
640512.BC1003_4739(+)plastid
640512.BC1003_1019(+)+
640512.BC1003_4199+
640512.BC1003_4361+
640512.BC1003_2467+
640512.BC1003_2897+
640512.BC1003_2891+
640512.BC1003_1484(>)
640512.BC1003_4054(PF12588)
640512.BC1003_1739(+)(plastid)
640512.BC1003_1734+
640512.BC1003_0288+
640512.BC1003_0286+
640512.BC1003_3705+
640512.BC1003_1259+
640512.BC1003_5593(PF01075)
640512.BC1003_5044+
640512.BC1003_1035(+)(ER)
640512.BC1003_1039(>)
640512.BC1003_4318(+)(PF01075)
640512.BC1003_4994+
640512.BC1003_1930+
640512.BC1003_3272+
640512.BC1003_3183(+)plastid
640512.BC1003_2588+
640512.BC1003_2057(>)
640512.BC1003_2631+
640512.BC1003_0988+
640512.BC1003_1235(>)
640512.BC1003_0188+
640512.BC1003_5061+
640512.BC1003_1582(>)
640512.BC1003_1583+
640512.BC1003_1584+
640512.BC1003_0956+
640512.BC1003_0368+
640512.BC1003_0367+not used
640512.BC1003_0774+
640512.BC1003_2213+
640512.BC1003_3513+
640512.BC1003_1912+
640512.BC1003_1916+
640512.BC1003_0424(>)
640512.BC1003_0421+
640512.BC1003_5082+
640512.BC1003_5884+
640512.BC1003_4398+
640512.BC1003_5586+
640512.BC1003_0875+
640512.BC1003_3021+
640512.BC1003_3022+
640512.BC1003_1433+
640512.BC1003_2957(>)
640512.BC1003_1796+
640512.BC1003_4870+
640512.BC1003_2487+
640512.BC1003_6040+
640512.BC1003_4050+
640512.BC1003_1896+
640512.BC1003_1892+
640512.BC1003_1092+
640512.BC1003_1630+
640512.BC1003_4371+
640512.BC1003_4379+
640512.BC1003_1357(PF04324)
640512.BC1003_0600+
640512.BC1003_5315(+)(plastid)
640512.BC1003_3553+
640512.BC1003_1957+
640512.BC1003_5180(+)(plastid)
640512.BC1003_5181+
640512.BC1003_2979+
640512.BC1003_2205+
640512.BC1003_5980+
640512.BC1003_5983+
640512.BC1003_5513(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_5514+
640512.BC1003_1614+
640512.BC1003_1617+
640512.BC1003_0947+
640512.BC1003_0699+
640512.BC1003_2227+
640512.BC1003_3700+
640512.BC1003_5160+not used
640512.BC1003_5165+
640512.BC1003_2737+
640512.BC1003_5707+
640512.BC1003_2507+
640512.BC1003_2503(+)+
640512.BC1003_2502+
640512.BC1003_2509(>)
640512.BC1003_3905+
640512.BC1003_1392+
640512.BC1003_6023+
640512.BC1003_2076+
640512.BC1003_4159(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_0105+
640512.BC1003_4386+
640512.BC1003_5490+
640512.BC1003_2246+
640512.BC1003_2716+
640512.BC1003_2249+
640512.BC1003_2863(>)
640512.BC1003_2868(PF01075)
640512.BC1003_1443+
640512.BC1003_4456+
640512.BC1003_3439+
640512.BC1003_5559+
640512.BC1003_4063+
640512.BC1003_4064(PF01075)
640512.BC1003_4066+
640512.BC1003_4607+
640512.BC1003_1651+
640512.BC1003_0523+
640512.BC1003_4869+
640512.BC1003_1465(>)
640512.BC1003_3416+
640512.BC1003_2105(PF04324)
640512.BC1003_4667+
640512.BC1003_1100+
640512.BC1003_1109(+)plastid
640512.BC1003_4082+
640512.BC1003_4088(>)
640512.BC1003_3322+
640512.BC1003_4882+
640512.BC1003_3088+
640512.BC1003_3087+
640512.BC1003_3715+
640512.BC1003_2827+
640512.BC1003_5604+
640512.BC1003_1835+not used
640512.BC1003_5845+
640512.BC1003_1349+
640512.BC1003_2127+
640512.BC1003_1698+
640512.BC1003_1694+
640512.BC1003_1697+
640512.BC1003_1693(PF04324)
640512.BC1003_1931+
640512.BC1003_5476+
640512.BC1003_4785+
640512.BC1003_4781+
640512.BC1003_5784+
640512.BC1003_4255(>)
640512.BC1003_1570(+)+
640512.BC1003_1572+
640512.BC1003_4433+
640512.BC1003_0771+
640512.BC1003_3837+
640512.BC1003_6034+
640512.BC1003_5070+
640512.BC1003_4845(<)
640512.BC1003_2498+
640512.BC1003_5318(+)+
640512.BC1003_2143+
640512.BC1003_0899+
640512.BC1003_0097(+)(plastid)
640512.BC1003_1144(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_4300+
640512.BC1003_2798+
640512.BC1003_2794+
640512.BC1003_1250(+)(mitochondrial)
640512.BC1003_3151+
640512.BC1003_4207+
640512.BC1003_3309(+)(PF01075)
640512.BC1003_4579+
640512.BC1003_1364(+)(plastid)
640512.BC1003_5494(PF04324)
640512.BC1003_5495+
640512.BC1003_5339(PF01075)
640512.BC1003_4572+
640512.BC1003_4577(>)
640512.BC1003_0218(+)
640512.BC1003_0211(+)
640512.BC1003_0216(+)
640512.BC1003_2713(+)
640512.BC1003_5353(+)
640512.BC1003_3173(+)
640512.BC1003_3176(+)
640512.BC1003_0914(+)
640512.BC1003_1445(+)
640512.BC1003_5727(+)
640512.BC1003_2767(+)
640512.BC1003_0719(+)
640512.BC1003_2180(+)
640512.BC1003_0053(+)
640512.BC1003_0588(+)
640512.BC1003_1901(+)
640512.BC1003_3779(+)
640512.BC1003_3800(+)
640512.BC1003_3111(+)
640512.BC1003_2643(+)
640512.BC1003_4761(+)
640512.BC1003_4767(+)
640512.BC1003_1515(+)
640512.BC1003_3824(+)
640512.BC1003_0648(+)
640512.BC1003_3349(+)
640512.BC1003_3345(+)
640512.BC1003_4397(+)
640512.BC1003_4028(+)not used
640512.BC1003_5957(+)
640512.BC1003_1701(+)
640512.BC1003_0253(+)
640512.BC1003_3752(+)
640512.BC1003_3139(+)
640512.BC1003_1283(+)
640512.BC1003_2666(+)
640512.BC1003_1062(+)
640512.BC1003_0043(+)
640512.BC1003_2071(+)
640512.BC1003_5935(+)
640512.BC1003_5930(+)
640512.BC1003_1727(+)
640512.BC1003_0592(+)
640512.BC1003_3731(+)
640512.BC1003_2601(+)
640512.BC1003_4729(+)
640512.BC1003_5833(+)
640512.BC1003_1000(+)
640512.BC1003_4188(+)
640512.BC1003_2295(+)
640512.BC1003_1928(+)
640512.BC1003_1929(+)
640512.BC1003_1920(+)
640512.BC1003_3246(+)
640512.BC1003_2049(+)
640512.BC1003_5216(+)
640512.BC1003_2628(+)
640512.BC1003_0998(+)
640512.BC1003_0996(+)
640512.BC1003_1247(+)
640512.BC1003_0192(+)
640512.BC1003_0197(+)
640512.BC1003_0199(+)
640512.BC1003_5073(+)
640512.BC1003_3763(+)
640512.BC1003_4307(+)
640512.BC1003_1595(+)
640512.BC1003_3503(+)
640512.BC1003_3505(+)
640512.BC1003_5687(+)
640512.BC1003_1760(+)
640512.BC1003_1769(+)
640512.BC1003_3995(+)
640512.BC1003_2020(+)
640512.BC1003_1226(+)
640512.BC1003_1223(+)
640512.BC1003_2923(+)
640512.BC1003_0438(+)not used
640512.BC1003_3208(+)
640512.BC1003_2554(+)
640512.BC1003_5528(+)
640512.BC1003_1203(+)
640512.BC1003_5525(+)
640512.BC1003_4127(+)
640512.BC1003_1367(+)
640512.BC1003_4344(+)
640512.BC1003_4343(+)
640512.BC1003_0335(+)
640512.BC1003_3038(+)
640512.BC1003_3527(+)
640512.BC1003_2031(+)
640512.BC1003_2032(+)
640512.BC1003_1130(+)
640512.BC1003_1133(+)
640512.BC1003_1945(+)
640512.BC1003_1947(+)
640512.BC1003_4470(+)
640512.BC1003_2940(+)
640512.BC1003_5753(+)
640512.BC1003_1417(+)
640512.BC1003_4597(+)
640512.BC1003_0454(+)
640512.BC1003_2687(+)
640512.BC1003_1215(+)
640512.BC1003_0510(+)
640512.BC1003_0867(+)
640512.BC1003_4810(+)
640512.BC1003_3561(+)
640512.BC1003_2218(+)
640512.BC1003_5779(+)
640512.BC1003_0474(+)
640512.BC1003_2513(+)
640512.BC1003_5314(+)
640512.BC1003_3604(+)
640512.BC1003_5386(+)
640512.BC1003_5384(+)
640512.BC1003_5365(+)
640512.BC1003_0115(+)
640512.BC1003_1601(+)
640512.BC1003_5715(+)
640512.BC1003_5713(+)
640512.BC1003_5712(+)
640512.BC1003_1452(+)
640512.BC1003_4442(+)
640512.BC1003_0494(+)
640512.BC1003_2533(+)
640512.BC1003_2393(+)
640512.BC1003_3622(+)
640512.BC1003_5548(+)
640512.BC1003_1844(+)
640512.BC1003_4143(+)
640512.BC1003_1668(+)
640512.BC1003_0398(+)
640512.BC1003_0538(+)
640512.BC1003_6076(+)
640512.BC1003_5484(+)
640512.BC1003_2257(+)
640512.BC1003_2708(+)
640512.BC1003_5158(+)
640512.BC1003_2877(+)
640512.BC1003_4283(+)
640512.BC1003_5863(+)
640512.BC1003_6032(+)
640512.BC1003_1398(+)
640512.BC1003_2112(+)
640512.BC1003_1645(+)
640512.BC1003_1644(+)
640512.BC1003_2346(+)
640512.BC1003_2433(+)
640512.BC1003_2340(+)
640512.BC1003_4408(+)
640512.BC1003_1807(+)
640512.BC1003_3666(+)
640512.BC1003_5853(+)
640512.BC1003_4673(+)
640512.BC1003_1116(+)
640512.BC1003_0570(+)
640512.BC1003_3875(+)
640512.BC1003_4434(+)
640512.BC1003_5442(+)
640512.BC1003_5455(+)
640512.BC1003_3688(+)
640512.BC1003_2480(+)
640512.BC1003_2335(+)
640512.BC1003_5671(+)
640512.BC1003_5675(+)
640512.BC1003_1179(+)
640512.BC1003_1686(+)
640512.BC1003_0229(+)
640512.BC1003_3854(+)
640512.BC1003_3857(+)
640512.BC1003_3853(+)
640512.BC1003_2815(+)
640512.BC1003_2818(+)
640512.BC1003_0944(+)
640512.BC1003_0752(+)
640512.BC1003_4911(+)
640512.BC1003_3393(+)
640512.BC1003_3392(+)
640512.BC1003_5324(+)
640512.BC1003_5326(+)
640512.BC1003_2170(+)
640512.BC1003_3838(+)
640512.BC1003_5407(+)
640512.BC1003_0923(+)
640512.BC1003_4973(+)
640512.BC1003_2373(+)
640512.BC1003_4563(+)
640512.BC1003_4568+
640512.BC1003_0041(+)
640512.BC1003_1068(+)
640512.BC1003_0872(+)
640512.BC1003_3810(+)
640512.BC1003_3817(+)
640512.BC1003_6082(+)
640512.BC1003_5422(+)
640512.BC1003_4779+
640512.BC1003_1503(+)
640512.BC1003_0900(+)
640512.BC1003_4489(+)
640512.BC1003_5112(+)
640512.BC1003_4242(+)
640512.BC1003_1997(+)
640512.BC1003_4018(+)
640512.BC1003_1199(+)
640512.BC1003_0850(+)
640512.BC1003_0242(+)
640512.BC1003_3005(+)
640512.BC1003_1161(+)
640512.BC1003_2658(+)
640512.BC1003_4717(+)
640512.BC1003_1073(+)
640512.BC1003_0965(+)
640512.BC1003_0969(+)
640512.BC1003_0968(+)
640512.BC1003_4525(+)
640512.BC1003_0001(+)
640512.BC1003_5925(+)
640512.BC1003_4101(+)
640512.BC1003_1270(+)
640512.BC1003_1277(+)
640512.BC1003_1275(+)
640512.BC1003_4731(+)
640512.BC1003_4737(+)
640512.BC1003_1018(+)
640512.BC1003_1017(+)
640512.BC1003_4992(+)
640512.BC1003_3485(+)
640512.BC1003_4369(+)
640512.BC1003_2465(+)
640512.BC1003_0023(+)
640512.BC1003_0283(+)
640512.BC1003_3259(+)
640512.BC1003_3254(+)
640512.BC1003_2614(+)
640512.BC1003_0343(+)
640512.BC1003_4991(+)
640512.BC1003_2440(+)
640512.BC1003_5305(+)
640512.BC1003_2917(+)
640512.BC1003_4072(+)
640512.BC1003_1759(+)
640512.BC1003_1758(+)
640512.BC1003_0402(+)
640512.BC1003_0406(+)
640512.BC1003_1041(+)
640512.BC1003_3987(+)
640512.BC1003_3985(+)
640512.BC1003_3980(+)
640512.BC1003_2051(+)
640512.BC1003_2059(+)
640512.BC1003_0223(+)
640512.BC1003_3514(+)
640512.BC1003_1913(+)
640512.BC1003_2931(+)
640512.BC1003_5996(+)
640512.BC1003_1431(+)
640512.BC1003_3816(+)
640512.BC1003_2974(+)
640512.BC1003_2976(+)
640512.BC1003_0127(+)
640512.BC1003_2038(+)
640512.BC1003_5089(+)
640512.BC1003_5085(+)
640512.BC1003_5234(+)
640512.BC1003_3020(+)
640512.BC1003_1219(+)
640512.BC1003_5744(+)
640512.BC1003_3454(+)
640512.BC1003_5056+
640512.BC1003_3946(+)
640512.BC1003_5538(+)
640512.BC1003_0320(+)
640512.BC1003_2203(+)
640512.BC1003_5761(+)
640512.BC1003_5763(+)
640512.BC1003_4581(+)
640512.BC1003_0462(+)
640512.BC1003_0468(+)
640512.BC1003_5518(+)
640512.BC1003_0126(+)
640512.BC1003_0873(+)
640512.BC1003_6047(+)
640512.BC1003_5162(+)
640512.BC1003_2220(+)
640512.BC1003_5700(+)
640512.BC1003_1423(+)
640512.BC1003_0485(+)
640512.BC1003_4165(+)
640512.BC1003_3909(+)
640512.BC1003_4153(+)
640512.BC1003_0815(+)
640512.BC1003_0816(+)
640512.BC1003_5224(+)
640512.BC1003_3335(+)
640512.BC1003_2529(+)
640512.BC1003_2520(+)
640512.BC1003_2383(+)
640512.BC1003_2385(+)
640512.BC1003_3651(+)
640512.BC1003_5803(+)
640512.BC1003_4601(+)
640512.BC1003_0521(+)
640512.BC1003_5633(+)
640512.BC1003_2263(+)
640512.BC1003_2848(+)
640512.BC1003_4295(+)
640512.BC1003_4293(+)
640512.BC1003_0739(+)
640512.BC1003_3676(+)
640512.BC1003_2101(+)
640512.BC1003_2104(+)
640512.BC1003_1103(+)
640512.BC1003_0502(+)
640512.BC1003_3889(+)
640512.BC1003_3712(+)
640512.BC1003_4412(+)
640512.BC1003_3475(+)
640512.BC1003_3471(+)
640512.BC1003_4648(+)
640512.BC1003_4626(+)
640512.BC1003_5696(+)
640512.BC1003_5479(+)
640512.BC1003_5789(+)
640512.BC1003_4544(+)
640512.BC1003_4251(+)
640512.BC1003_4437(+)
640512.BC1003_4436(+)
640512.BC1003_4432(+)
640512.BC1003_4923(+)
640512.BC1003_4924(+)
640512.BC1003_5668(+)
640512.BC1003_5074(+)
640512.BC1003_2497(+)
640512.BC1003_5867(+)
640512.BC1003_5646(+)
640512.BC1003_0095(+)
640512.BC1003_0091(+)
640512.BC1003_3840(+)
640512.BC1003_3847(+)
640512.BC1003_3152(+)
640512.BC1003_5413(+)
640512.BC1003_3716(+)
640512.BC1003_1550(+)
640512.BC1003_1556(+)
640512.BC1003_1555(+)
640512.BC1003_3303(+)
640512.BC1003_2161(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 1.2 (12/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 3.375 (27/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================