Effective results for Mycobacterium sinense (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 281
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 31 eukaryotic-like domains, contained in 281 proteins (3 high, 278 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
875328.JDM601_3276(PF01083)ER; plastid
875328.JDM601_3277(PF01083)ER
875328.JDM601_3271(PF06013)mitochondrial; (mitochondrial)
875328.JDM601_0127(PF02470)ER
875328.JDM601_0126(PF02470)ER
875328.JDM601_0124(PF02470)ER
875328.JDM601_0123(PF02470)ER
875328.JDM601_0121(PF02405)mitochondrial
875328.JDM601_3470(PF02470)ER
875328.JDM601_3471(PF02470)ER
875328.JDM601_3472(PF02470)ER
875328.JDM601_3473(PF02470)ER
875328.JDM601_3097(PF01083)ER
875328.JDM601_2226(PF13564)ER
875328.JDM601_3469(PF02470)mitochondrial
875328.JDM601_3468(PF02470)ER
875328.JDM601_3794(PF02470)ER
875328.JDM601_3796(PF02405)(mitochondrial)
875328.JDM601_1102(PF02405)ER; (ER)
875328.JDM601_1103(PF02405)ER
875328.JDM601_1100(PF02470)ER
875328.JDM601_2903(PF09995)(ER); ER
875328.JDM601_3630(PF02470)ER
875328.JDM601_3631(PF02405)mitochondrial; (mitochondrial)
875328.JDM601_1660(PF09995)ER
875328.JDM601_3625(PF02470)ER
875328.JDM601_3627(PF02470)ER
875328.JDM601_3626(PF02470)(mitochondrial)
875328.JDM601_1613(PF01083)ER
875328.JDM601_1285(PF13810)ER
875328.JDM601_1603(PF13564)ER
875328.JDM601_1630(PF01083)ER
875328.JDM601_2894(PF02470)ER
875328.JDM601_4242(PF13622)(ER)
875328.JDM601_0711(PF02405)mitochondrial
875328.JDM601_2778(PF13564)ER
875328.JDM601_1098(PF02470)ER
875328.JDM601_1099(PF02470)ER
875328.JDM601_2032(PF13564)ER
875328.JDM601_0141(PF02405)mitochondrial
875328.JDM601_4263(PF00441)(mitochondrial); (plastid)
875328.JDM601_4119(PF01083)(mitochondrial)
875328.JDM601_4282(PF02470)ER
875328.JDM601_4283(PF02470)ER
875328.JDM601_4280(PF02470)ER
875328.JDM601_4284(PF02470)ER
875328.JDM601_4285(PF02470)ER
875328.JDM601_2526(PF01113)(mitochondrial)
875328.JDM601_3629(PF02470)ER
875328.JDM601_0588(PF13564)ER
875328.JDM601_4138(PF11196)ER
875328.JDM601_3791(PF02470)(ER); (plastid)
875328.JDM601_3790(PF02470)ER
875328.JDM601_3793(PF02470)(ER)
875328.JDM601_2091(PF13564)ER
875328.JDM601_2898(PF02470)ER
875328.JDM601_2892(PF02405)mitochondrial
875328.JDM601_2895(PF02470)(mitochondrial)
875328.JDM601_2897(PF02470)ER
875328.JDM601_2896(PF02470)ER
875328.JDM601_0484(PF11196)ER
875328.JDM601_0138(PF02470)mitochondrial; (mitochondrial)
875328.JDM601_0139(PF02470)ER
875328.JDM601_0135(PF02470)mitochondrial
875328.JDM601_0125(PF02470)(ER)
875328.JDM601_0120(PF02405)(mitochondrial)
875328.JDM601_4168(PF00743)(plastid)
875328.JDM601_3647(PF03007) (PF06974)
875328.JDM601_3254(PF07224)(ER)
875328.JDM601_3989(PF13810)(ER)
875328.JDM601_2969(PF06974) (PF03007)
875328.JDM601_0054(PF06013)(plastid)
875328.JDM601_0187(PF03007) (PF06974)
875328.JDM601_4247(PF00743)(mitochondrial)
875328.JDM601_0543(PF03007) (PF06974)
875328.JDM601_2498(PF03007) (PF06974)
875328.JDM601_1423(PF06974) (PF03007)
875328.JDM601_2983(PF06974) (PF03007)
875328.JDM601_4052(PF14232) (PF14231)
875328.JDM601_2662(PF14232) (PF14231)
875328.JDM601_4029(PF06974) (PF03007)
875328.JDM601_2891(PF02405)(mitochondrial)
875328.JDM601_2797(PF00441)
875328.JDM601_0658(PF13452)
875328.JDM601_0494(PF13622)
875328.JDM601_3270(PF06013)
875328.JDM601_0852(PF00441)
875328.JDM601_0875(PF01113)
875328.JDM601_0870(PF00441)
875328.JDM601_3302(PF04072)
875328.JDM601_3303(PF04072)
875328.JDM601_4058(PF13622)
875328.JDM601_1534(PF00441)
875328.JDM601_0122(PF02470)
875328.JDM601_4009(PF02353)
875328.JDM601_4007(PF02353)
875328.JDM601_0302(PF04909)
875328.JDM601_4171(PF00743)
875328.JDM601_3508(PF00441)
875328.JDM601_3509(PF00441)
875328.JDM601_1000(PF06013)
875328.JDM601_3507(PF00441)
875328.JDM601_4220(PF04909)
875328.JDM601_3501(PF04909)
875328.JDM601_2781(PF00743)
875328.JDM601_0660(PF13452)
875328.JDM601_0665(PF02353)
875328.JDM601_0666(PF02353)
875328.JDM601_1823(PF09995)
875328.JDM601_0687(PF00441)
875328.JDM601_3865(PF00441)
875328.JDM601_1497(PF00441)
875328.JDM601_1498(PF00441)
875328.JDM601_3797(PF02405)
875328.JDM601_0208(PF09995)
875328.JDM601_0206(PF09995)
875328.JDM601_3083(PF01083)
875328.JDM601_1101(PF02470)
875328.JDM601_2358(PF06013)
875328.JDM601_2357(PF06013)
875328.JDM601_0851(PF00441)
875328.JDM601_2127(PF13622)
875328.JDM601_0073(PF13810)
875328.JDM601_2902(PF09995)
875328.JDM601_3552(PF00441)
875328.JDM601_0289(PF04072)
875328.JDM601_3411(PF00441)
875328.JDM601_0500(PF13452)
875328.JDM601_3636(PF00441)
875328.JDM601_3635(PF00441)
875328.JDM601_3632(PF02405)
875328.JDM601_3744(PF04909)
875328.JDM601_3749(PF13452)
875328.JDM601_3248(PF00743)
875328.JDM601_0732(PF00441)
875328.JDM601_2807(PF04909)
875328.JDM601_3408(PF00441)
875328.JDM601_0191(PF00441)
875328.JDM601_4219(PF04909)
875328.JDM601_0229(PF00441)
875328.JDM601_2593(PF09995)
875328.JDM601_0452(PF02353)
875328.JDM601_0451(PF02353)
875328.JDM601_0929(PF00441)
875328.JDM601_3756(PF00441)
875328.JDM601_3759(PF00441)
875328.JDM601_1873(PF09995)
875328.JDM601_2574(PF00441)
875328.JDM601_1903(PF06013)
875328.JDM601_1904(PF06013)
875328.JDM601_3292(PF00441)
875328.JDM601_1616(PF01113)
875328.JDM601_3437(PF04909)
875328.JDM601_0184(PF00441)
875328.JDM601_0181(PF00441)
875328.JDM601_0183(PF00441)
875328.JDM601_4227(PF13452)
875328.JDM601_1289PF05241
875328.JDM601_1047(PF09995)
875328.JDM601_1138(PF04072)
875328.JDM601_1134(PF04909)
875328.JDM601_3764(PF00441)
875328.JDM601_3767(PF00441)
875328.JDM601_3760(PF04909)
875328.JDM601_0999(PF06013)
875328.JDM601_0739(PF00441)
875328.JDM601_0733(PF00441)
875328.JDM601_0730(PF00441)
875328.JDM601_0731(PF00441)
875328.JDM601_0735(PF00441)
875328.JDM601_3354(PF02958)
875328.JDM601_2175(PF04072)
875328.JDM601_3979(PF02353)
875328.JDM601_2820(PF06013)
875328.JDM601_3425(PF04909)
875328.JDM601_3512(PF01113)
875328.JDM601_3516(PF00441)
875328.JDM601_3515(PF00441)
875328.JDM601_2484(PF09995)
875328.JDM601_2483(PF03161)
875328.JDM601_3778(PF00441)
875328.JDM601_3777(PF00441)
875328.JDM601_3776(PF00441)
875328.JDM601_3366(PF13622)
875328.JDM601_1631(PF01083)
875328.JDM601_1633(PF03492)
875328.JDM601_3384(PF04909)
875328.JDM601_3388(PF00441)
875328.JDM601_3389(PF04909)
875328.JDM601_2944(PF00441)
875328.JDM601_2943(PF00441)
875328.JDM601_0094(PF04072)
875328.JDM601_2387(PF13622)
875328.JDM601_2542(PF00441)
875328.JDM601_0710(PF02405)
875328.JDM601_2544(PF13452)
875328.JDM601_3376(PF00441)
875328.JDM601_3371(PF04909)
875328.JDM601_3391(PF04909)
875328.JDM601_2028(PF02353)
875328.JDM601_2029(PF02353)
875328.JDM601_2025(PF02353)
875328.JDM601_2026(PF02353)
875328.JDM601_2020(PF04072)
875328.JDM601_1383(PF08354)
875328.JDM601_2849(PF00441)
875328.JDM601_1096(PF02470)
875328.JDM601_1097(PF02470)
875328.JDM601_1093(PF04909)
875328.JDM601_0377(PF04072)
875328.JDM601_3719(PF00441)
875328.JDM601_3718(PF00441)
875328.JDM601_3716(PF00441)
875328.JDM601_0703(PF00441)
875328.JDM601_3147(PF02544)
875328.JDM601_1895(PF06013)
875328.JDM601_1896(PF06013)
875328.JDM601_3810(PF00441)
875328.JDM601_3811(PF00441)
875328.JDM601_0140(PF02470)
875328.JDM601_0142(PF02405)
875328.JDM601_2856(PF00441)
875328.JDM601_2850(PF00441)
875328.JDM601_4264(PF00441)
875328.JDM601_0560(PF00743)
875328.JDM601_0365(PF13564)
875328.JDM601_3720(PF00441)
875328.JDM601_4218(PF04909)
875328.JDM601_4286(PF02405)
875328.JDM601_4287(PF02405)
875328.JDM601_3031(PF00441)
875328.JDM601_1958(PF02026)
875328.JDM601_1410(PF04072)
875328.JDM601_3553(PF00441)
875328.JDM601_0288(PF06013)
875328.JDM601_3485(PF00441)
875328.JDM601_3484(PF00441)
875328.JDM601_3487(PF04909)
875328.JDM601_3486(PF04909)
875328.JDM601_2515(PF00441)
875328.JDM601_3628(PF02470)
875328.JDM601_2465(PF00441)
875328.JDM601_0839PF05241
875328.JDM601_1405(PF00441)
875328.JDM601_1578(PF00441)
875328.JDM601_0296(PF06013)
875328.JDM601_0582(PF13622)
875328.JDM601_0587(PF13622)
875328.JDM601_3795(PF02470)
875328.JDM601_1997(PF17048)
875328.JDM601_3829(PF00441)
875328.JDM601_3828(PF13452)
875328.JDM601_0116(PF00743)
875328.JDM601_0029(PF00743)
875328.JDM601_2210(PF04072)
875328.JDM601_2884(PF01083)
875328.JDM601_4128(PF01744)
875328.JDM601_0749(PF04072)
875328.JDM601_0926(PF00441)
875328.JDM601_0922(PF09995)
875328.JDM601_3210(PF00441)
875328.JDM601_3212(PF13452)
875328.JDM601_2076PF04622
875328.JDM601_2074(PF02958)
875328.JDM601_3850(PF04909)
875328.JDM601_0105(PF13622)
875328.JDM601_0108(PF13622)
875328.JDM601_2893(PF02470)
875328.JDM601_3690(PF00441)
875328.JDM601_3691(PF00441)
875328.JDM601_0253(PF00441)
875328.JDM601_0799(PF00441)
875328.JDM601_3844(PF00441)
875328.JDM601_3840(PF00441)
875328.JDM601_0136(PF02470)
875328.JDM601_0137(PF02470)
875328.JDM601_0316(PF09995)
875328.JDM601_3689(PF13452)
875328.JDM601_3684(PF13452)
875328.JDM601_1010(PF01113)
875328.JDM601_0260(PF00441)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================